| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_LN832404 | 804269 = | 92 (0.930) | 11 (0.120) | 11/536 | NT | 10.2% | intergenic (‑47/+88) | EK12AG100_RS03990/EK12AG100_RS03995 | putative acyl‑CoA thioester hydrolase/tyrosine‑type recombinase/integrase |
| ? | NZ_LN832404 | = 849699 | 107 (1.150) | intergenic (‑750/+106) | EK12AG100_RS04330/EK12AG100_RS04335 | AAA family ATPase/kinase inhibitor | |||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
CACTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTG‑GATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAACTTGAGCGAAACGGGAAGGTAAAAAGACAAAAAGTTGTTTTTAATACCTTTAAGTGATACCAGATGGCATTGCGCCATCTGGCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGCGCCGCTGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGT > NZ_LN832404/849407‑849992 | cACTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTG‑GATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAg > 1:188303‑M2/1‑293 (MQ=255) ttACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTG‑GATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTAGTGTTTTACAGTATTATGAAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTATTTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTAGTTCAgcttttttatacta < 1:159533‑M2/294‑15 (MQ=255) aCTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTG‑GATTGCGAGGCTTTGTTCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAAc < 1:15760/294‑1 (MQ=255) aCTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTG‑GATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTGTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATTTTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAgtttttttttactaat < 2:571049‑M2/294‑17 (MQ=255) tATTCAGGTGGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGGACTG‑GATTGAGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAACTTGAGc < 2:778026/294‑1 (MQ=255) tATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTG‑GATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAgcttttttatactaagttggca > 1:574722‑M2/1‑272 (MQ=255) tATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTG‑GATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAACTTGAGc < 1:313664/294‑1 (MQ=255) tGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTG‑GATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCCTATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATGTAATTTATTGATATTTATATCATTTTTCGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAATTTGACCGa > 2:10683/1‑294 (MQ=255) ggTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTG‑GATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATCTTTATATCATTTTATGTTTCTCGTTACGCTTTTTTATAATAACTTGacagaacag > 2:513477/1‑286 (MQ=255) gTCGTAGTGGGTGGCACAAAAAGCTTTGCACTG‑GATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAACTTGAGCGAAACgg < 2:851785/294‑1 (MQ=255) gTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTG‑GATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAACTTGAGCGAAACGGGaa > 2:51203/1‑294 (MQ=255) gcattgaccacaAAGCTTTTC‑CTGTGAGTGCGATTCTTATTGCTTCTCTGGATTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTATCTCAAGAAAACAATAATCACCTTACGCTAATGCTCTGTTACAGTTCACTAATACCATCTAATTAGTTGATTCATATTTACTTCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTTTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAACTTGAGCGAAGCGGGAAGGTaa < 2:370461/286‑1 (MQ=255) ggCACACAAAGCTTTGCACTG‑GATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTGGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAACTTGAGCGAAACGGGAAGGTAAAAAg < 2:503161/294‑1 (MQ=255) 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CACTGCTATCTTCTTACTGGTTATGCAGGTCGTAGTGGGTGGCACACAAAGCTTTGCACTG‑GATTGCGAGGCTTTGTGCTTCTCTGGAGTGCGACAGGTTTGATGACAAAAAATTAGCGCAAGAAGACAAAAATCACCTTGCGCTAATGCTCTGTTACAGGTCACTAATACCATCTAAGTAGTTGATTCATAGTGACTGCATATGTTGTGTTTTACAGTATTATGTAGTCTGTTTTTTATGCAAAATCTAATTTAATATATTGATATTTATATCATTTTACGTTTCTCGTTCAGCTTTTTTATACTAACTTGAGCGAAACGGGAAGGTAAAAAGACAAAAAGTTGTTTTTAATACCTTTAAGTGATACCAGATGGCATTGCGCCATCTGGCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGCGCCGCTGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGT > NZ_LN832404/849407‑849992 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |