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aaaCTATTTAGTCTGTGACA‑GAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATT‑AAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGAACGC‑GGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGTATATGCTCTCTTTTCTGACGTTAGTCTCCGACGGCAGGCTTCAATGACCCAGGCTGAGAAATTCCCGGGCCCTTTTTGCTCAAGAGCGATGTTAATTTGTTCCATCATTTGGCACGGAAAGCGGa > 2:472234/1‑294 (MQ=255) aaCTATTTAGTCTGTGACA‑GAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATT‑AAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGAAAGAACGC‑GGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGTTGTATATGCTCTCTTTTCTGACTTTAGTCTACGACGGCAGGATTCAATGACCCAGGCTGAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCTCACGAGCGCTTTTAATTTGTGAAATCATTTGGTTAGTACAGCGGAt > 2:298079/1‑294 (MQ=38) cTATTTAGTCTGTGACA‑GAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATT‑AAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGAACGC‑GGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGTATATGCTCTCTTTTCTGACGTTAGTCTCCGACGGCAGGCTTCAATGACCCAGGCTGAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCTCAAGAGCGATGTTAATTTGTTCAATCATTTGGTTAGGAAAGCGGATGt < 1:854278/294‑1 (MQ=255) | AAAGATTTGAAGTAATATTTTAACCGCTAGATGAAGAGCAAGCGCATGGAGCGACAAAATGAATAAAGAACAATCTGCTGATGATCCCTCCGTGGATCTGATTCGTGTAAAAAATATGCTTAATAGCACCATTTCTATGAGTTACCCTGATGTTGTAATTGCATGTATAGAACATAAGGTGTCTCTGGAAGCATTCAGAGCAATTGAGGCAGCGTTGGTGAAGCACGATAATAATATGAAGGATTATTCCCTGGTGGTTGACTGATCACCATAACTGCTAATCATTCAAACTATTTAACCTGTGACA‑GAGCCAACACGCAGTCTGTCACTGTCAGGAAAGTGGTAAAACTGCAACTCAATTACTGCAATGCCCTCGTAATT‑AAGTGAATTTACAATATCGTCCTGTTCGGAGGGAAGAACGC‑GGGATGTTCATTCTTCATCACTTTTAATTGATGTATATGCTCTCTTTTCTGACGTTAGTCTCCGACGGCAGGCTTCAATGACCCAGGCTGAGAAATTCCCGGACCCTTTTTGCTCAAGAGCGATGTTAATTTGTTCAATCATTTGGTTAGGAAAGCGGATGTTG > NZ_LN832404/576763‑577348 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |