| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NZ_LN832404 | 4,543,075 | T→C | 8.9% | I502I (ATT→ATC) | fimD → | fimbrial biogenesis usher protein FimD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_LN832404 | 4,543,075 | 0 | T | C | 8.9% | 344.5 / 19.5 | 112 | I502I (ATT→ATC) | fimD | fimbrial biogenesis usher protein FimD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (52/50); new base C (7/3); total (59/53) | |||||||||||
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Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
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GGCTGGCTGGACAATATATGGTGGAACGCAACTGGCGGATCGTTATCGTGCTTTTAATTTCGGTATCGGGAAAAACATGGGGGCACTGGGCGCTCTGTCTGTGGATATGACGCAGGCTAATTCCACACTTCCCGATGACAGTCAGCATGACGGACAATCGGTGCGTTTTCTCTATAACAAATCGCTCAATGAATCAGGCACGAATATTCAGTTAGTGG‑GTTACCGTTATTCGACCAGCGGATATTTTAATTTCGCTGATACAACATACAGTCGAATGAATGGCTACAACATTGAAACACAGGACGGAGTTATTCAGGTTAAGCCGAAATTCACCGACTATTACAACCTCGCTTATAACAAACGCGGGAAATTACAACTCACCGTTACTCAGCAACTCGGGCGCACATCAACACTGTATTTGAGTGGTAGCCATCAAACTTATTGGGGAACGAGTAATGTCGATGAGCAATTCCAGGCTGGATTAAATACTGCGTTCGAAGATATCAACTGGACGCTCAGCTATAGCCTGACGAAAAACGCCTGGCAAAAAGGACGGGATCAGATGTTAGCGCTTAACGTCAATA > NZ_LN832404/4542784‑4543367 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |