New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3497415 | 57 (0.740) | 9 (0.120) | 9/450 | 4.9 | 13.5% | coding (413/807 nt) | nirC | nitrite transporter |
? | NC_000913 | 3497429 = | 58 (0.750) | coding (427/807 nt) | nirC | nitrite transporter | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
TGGGCGCGACCTTTGGTATCGCCTTAACGCTGGTGATTATCGCCGGTTCTGAACTGTTCACCGGACACACCATGTTCCTCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGTTCGGCAACCACAGCGAAGCCTACACGCTGGCGGGTATTGGTCATAACC > NC_000913/3497184‑3497678 | tGGGCGCGACCTTTGGTATCGCCTTAACGCTGGTGATTATCGCCGGTTCTGAACTGTTCACCGGACACACCATGTTCCTCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCCTGCCCTATAGCTTGGGCGGCCGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCAGCGTTCAATCCGTCGCCCTGGCt > 2:163103/1‑251 (MQ=255) tGGGCGCGACCTTTGGTATCGCCTTAACGCTGGTGATTATCGCCGGTTCTGAACTGTTCACCGGACACACCATGTTCCTCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACCCCGTCGCGCTGGCt > 1:778688/1‑251 (MQ=255) gcgACCTTTGGTATCGCCTTAACGCTGGTGATTATCGCCGGTTCTGAACTGTTCACCGGACACACCATGTTCCTCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAAc > 1:277181/1‑251 (MQ=255) nttGGTAGCGCCTTAACGCTGGTGCTTATCGCCGGTTCTGAACTGTTCACCGGACACACCATGTTCCTCACCGTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGc < 1:506683/250‑1 (MQ=255) ggTATGGCCTTACCGCTGGTGATGATCGCCGGTTCTGAACTGTTACCCGGACGCACCATGTTCCTCACCTTGGGGGAAAAGGCGGGCAGCATCAGCCACGGTCAAATGTTGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTATCCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATATCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCAcc < 2:396851/251‑1 (MQ=255) aTCGCCTTAACGCTGGTGATTATCGCCGGTTCTGAACTGTTCACCGGACACACCATGTTCCTCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGc > 2:826702/1‑251 (MQ=255) cGCCTTAACGCTGGTGATTATCGCCGGTTCTGAACTGTTCACCGGACACACCATGTTCCTCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCAACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACTAGCATCGTTCACTCCGTCGCTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCaa > 2:506711/1‑251 (MQ=255) cGCTGGTGATTATCGCCGGTTCTGAACTGTTCACCGGACACACCATGTTCCTCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAAGGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTCGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTActc > 2:564191/1‑251 (MQ=255) cTGGTCATTATCGCCGGTTCTGAACTGTTCACCGGACACACCATGTTCCTCACCTTTGTGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGTCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCATTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGTTCCGGCAATGGTACtctt < 2:813328/251‑1 (MQ=255) gATTATCGCCGGTTCTGAACTGTTCACCGGACACACCATGTTCCTCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCa > 2:145670/1‑251 (MQ=255) 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cACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTGGCTAAAACCACTGCACCGGCATTGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTCGCAATACGGATGGCGCTGCGCACTGa > 2:291627/1‑251 (MQ=255) ggggTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGggcg > 2:281456/1‑251 (MQ=255) gggTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTgcgc > 2:394178/1‑251 (MQ=255) tAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCAcg > 1:25139/1‑250 (MQ=255) tAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACt < 2:348835/251‑1 (MQ=255) aaaaGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGGGCCCTg > 1:445793/1‑251 (MQ=255) gggCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCTGATTGAAgggg > 1:697518/1‑251 (MQ=255) cAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTAt < 1:394158/251‑1 (MQ=255) tgtgGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGTTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTgg < 1:291611/251‑1 (MQ=255) cAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAAcc > 2:201294/1‑131 (MQ=255) gCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGGTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACAGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTgg < 1:826653/251‑1 (MQ=255) gCCGAAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTgg < 2:25139/251‑1 (MQ=255) gCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCCTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTGGCTAAGACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCgg < 1:281442/251‑1 (MQ=255) 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gggTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATcgc < 2:586593/246‑1 (MQ=255) cGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCCCTCTATCGc > 1:586558/1‑246 (MQ=255) cGTTGCCATGCTCTATAGCAGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGCCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCCGGTGGTGTCCGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTACCGCCAACa > 1:823837/1‑251 (MQ=255) 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ccAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAACTTTATCGCCTTCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACCAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGTTCGGCAACCACAGCGAAGCCTacacc > 2:814259/1‑250 (MQ=255) gCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGTTCGGCAACCACAGCGAAGCCTACACGCTg < 2:445816/251‑1 (MQ=255) cGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGtt < 1:95915/219‑1 (MQ=255) cTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGTTCGGCAACCACAGCGAAGCCTACACGCTGGCGGGTATTg < 2:323042/251‑1 (MQ=255) gTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGCCGCTGTTCGCGCTCTCCTGGTTCGGCCACCACAGCGAAGCCTACACg > 1:656381/1‑234 (MQ=255) gTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCAGGCTACGAGCCCTCTTTCGCTAACATGACGCTGTTTGCTCTCTCCTGGTTAGGCAACCACCGCGAAGCCTACACGCTGGCGGGTATTGGTCa > 1:802839/1‑251 (MQ=255) gcTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTctgct > 2:235263/1‑138 (MQ=255) gcTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCAc > 2:179516/1‑166 (MQ=255) gcTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGTTCGGCAACCACAGCGAAGACTACACGCTGGCGGGTATTGGTCATAAcn > 1:503278/1‑250 (MQ=255) | TGGGCGCGACCTTTGGTATCGCCTTAACGCTGGTGATTATCGCCGGTTCTGAACTGTTCACCGGACACACCATGTTCCTCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTTCACTCCGTCGCGCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGTTCGGCAACCACAGCGAAGCCTACACGCTGGCGGGTATTGGTCATAACC > NC_000913/3497184‑3497678 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |