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Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
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CAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCAGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGACACCAGCATCGTCTAGCTCAAACCACTGCTCCGGCATTGGTACTATTCTTCAACGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCATGGCAATCTGGATTGAGGTGCCCCCTGACGGGGCGGCTAATTTTAACGTACTCTGGTGGTGTCTGCTGGCATGTA > 2:2027613/1‑251 CCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCTCTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGC < 1:1315423/251‑1 CAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGATAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTC > 1:168821/1‑228 CAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTCCAGTCTTCGTTTCCATGCTCTATAGCTGTGGCGGCGGTAGCCAGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGAAACGGCAATGGTACCCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTGGCCTGGAAATATGGATGGAGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCAGGTGGTGTCTGCGGGCAGTTACCGCGCTCGGC > 2:441220/1‑251 AAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGATATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCACGTCCGGCT > 1:312911/1‑251 GGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGC < 2:1412216/158‑1 tgatcctgcttgcTTCCGTCTTGGTTGCCATGCTCTCGTGCTGTGGCGGCCGGATCCTGCTGCCGTGAGATACTGGCATCGTCTTGCTAAATCCTCTGCACCGGCAATTGTACTCTTCATCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCTCTGCGTACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTA < 2:1746330/238‑1 TAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTAT < 1:1226727/251‑1 TAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTAT < 2:1437920/251‑1 AACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTCGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTACAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAAGCTGGATGGCGCTGCGCATTGCAGGGGCGGCGAAATTTCTCGCTTTCTGGTGGTGTCCTCCGGCATCTATAGCGTTCTGTGACCAGCCCTCTATC > 2:1617971/1‑251 GTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATGGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAAC < 2:1903003/251‑1 CGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACAT < 1:2197279/251‑1 CGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACAT < 1:1401408/251‑1 CGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACAT < 2:850536/251‑1 CGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACAT < 2:1832598/251‑1 gCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACG < 1:164840/250‑1 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CTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCT < 1:547199/207‑1 CTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCG < 1:1439446/155‑1 CTATAGCTGGGGGGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGTT < 2:353792/251‑1 CTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTAT < 1:2255459/218‑1 CTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGT < 1:715880/199‑1 ATAGCTGGGGGGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCACAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTTGCGCTCTCCTGGTTCG < 1:656758/251‑1 AGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTG < 2:151589/134‑1 CGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAAGCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGTTCGGCAACCACAGCGA < 1:1359997/251‑1 GGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGTTCGGCACCCACAGCGAA > 2:637820/1‑251 GGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGTTCGGCAACCACAGCGAA > 1:361440/1‑251 CCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGTTCGGCAACCACAGCGAAGCCTA > 2:1159657/1‑251 CCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGCTGCACTGTGTAACGGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGTTGGCGCTGCCCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCAGGAATTTCTCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTACCGCTAACATTACCCTGTTCGCGCTCTCCTGGTTGCGCAACCACAGCGACGCCTA > 2:158443/1‑251 CCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGATGCATTGTGTAACTGTCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGTCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTTTCTCTATCTGGTGCTGTCTGCTGGCATTTATCGCTTCAGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATAACGCTGTTCGCCCTCTCCTGGTTCGGCAACCCCAGAGCAGCttc > 2:2228452/1‑248 CTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGTTCGGCAACCACAGCGAAGCCTAC > 1:1708322/1‑251 TGCTGCCGGTAGATCCCAGCAGCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGTTCGGCAACCACAGCGAAGCCTACA < 2:910891/251‑1 TGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAGAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTGTCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGTTCGGCAACCACAGCGAGGCCTACA < 2:87380/251‑1 TGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGTTCGGCAACCACAGCGAAGCCTACA < 2:559425/251‑1 GCTGCCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGTTCGGCAACCACAGCGAAGCCTACAC > 1:1802372/1‑251 GCTGCCGGTAGATACCAGCATAGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATATGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGCAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGGATTTATCGCGTCCGGGTACGAGACCTCTATCGATCACATGACGCTGTTCGCGGTCTCCTGGTTCGGCAACCACAGCGTAGACCACAa > 2:1511721/1‑250 CCGGTAGATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTT > 1:151602/1‑134 GATACCAGCATCGTCTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTAAGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTTTTCGCGCTTTCCTGGTTCGGCAACCACAGCca > 2:886147/1‑230 TACGCCCTTTGGTGATGGGCGCGACCTTTGGTATCGCCTTAACGCTGGTGATTATCGCCGGTTCTGAACTGTTCACCGGACACACCATGTTCCTCACCTTTGGGGTAAAAGCGGGCAGCATCAGCCACGGGCAAATGTGGGCAATCCTGCCGCAAACCTGGCTGGGTAACCTGGTCGGTTCCGTCTTCGTTGCCATGCTCTATAGCTGGGGCGGCGGTAGCCTGCTGCCGGTAGATACCAGCATCGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3497169‑3497415‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTGGCTAAAACCACTGCACCGGCAATGGTACTCTTCTTCAAAGGTGCATTGTGTAACTGGCTGGTTTGCCTGGCAATCTGGATGGCGCTGCGCACTGAAGGGGCGGCGAAATTTATCGCTATCTGGTGGTGTCTGCTGGCATTTATCGCGTCCGGCTACGAGCACTCTATCGCTAACATGACGCTGTTCGCGCTCTCCTGGTTCGGCAACCACAGCGAAGCCTACACGCTGGCGGGTATTGGTCAT > NC_000913/3497429‑3497674 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |