| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 141977 = | NA (NA) | 5 (0.030) | 5/346 | 9.4 | NA | intergenic (+10/+31) | hpt/can | hypoxanthine phosphoribosyltransferase/carbonic anhydrase |
| ? | NC_000913 | 142000 = | NA (NA) | intergenic (+33/+8) | hpt/can | hypoxanthine phosphoribosyltransferase/carbonic anhydrase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
GTGAGATCTTAAGCCTGCGCGAACCGAAGTCGCTGGCGATTTGTACGCTGCTGGATAAACCGTCCCGTCGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGTTTGTGGTGGGTTACGGCATTGATTACGCACAGCGTTACCGTCATCTGCCGTATATCGGCAAAGTGATTCTGCTGGACGAGTAA‑GTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGCTTGAGGTTGGAAATCCCGTGACGGTAACGTTGCTCAAGGGTTTCGCGGTTGGTGGCGGTAACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGAATGCCGTAGGCCCAGCCGTGAATGGTAACTTTCTGCCCGCGTTTCCACGCTGATTGCATAATGGTGGAGTGGCCCAGGTTATACACCTGTTCCATGACGTTCAGTTCACACAA > NC_000913/141765‑142235 | gTGAGATCTTAAGCCTGCGCGAACCGAAGTCGCTGGCGATTTGTACGCTGCTGGATAAACCGTCCCGTCGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGTTTGTGGTGGGTTACGGCATTGATTACGCACAGCGTTACCGTCATCTGCCGTATATCGGCAAAGTGATTCTGCTGGACGAGTAA‑GTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCggcatggc < 1:1475725/239‑1 (MQ=255)gTGAGATCTTAAGCCTGCGCGAACCGAAGTCGCTGGCGATTTGTACGCTGCTGGATAAACCGTCCCGTCGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGTTTGTGGTGGGTTACGGCATTGATTACGCACAGCGTTACCGTCATCTGCCGTATATCGGCAAAGTGATTCTGCTGGACGAGTAA‑GTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCggcatggc < 2:2023146/239‑1 (MQ=255) cgcgAACCGAAGTCGCTGGCGCTTTGTACGCTGCTGGATAAACCGTCCCGTCGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGTTTGTGGTGGGTTACGGCATTGATTACGCACAGCGTTACCGTCATCTGCCGTATATCGGCAAAGTGATTCTGCTGGACGAGTAA‑GTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTg > 1:2025378/1‑239 (MQ=255) cgcgAACCGAAGTCGCTGGCGATTTGTACGCTGCTGGATAAACCGTCCCGTCGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGTTTGTGGTGGGTTACGGCATTGATTACGCACAGCGTTACCGTCATCTGCCGTATATCGGCAAAGTGATTCTGCTGGACGAGTAA‑GTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTg > 1:1547812/1‑239 (MQ=255) cgcgAACCGAAGTCGCTGGCGATTTGTACGCTGCTGGATAAACCGTCCCGTCGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGTTTGTGGTGGGTTACGGCATTGATTACGCACAGCGTTACCGTCATCTGCCGTATATCGGCAAAGTGATTCTGCTGGACGAGTAA‑GGGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCCTGGCATTTTTATTTTCGGTTg > 2:1139504/1‑239 (MQ=255) gAACCGAAGTCGCTGGCGATTTGTACGCTGCTGGATAAACCGTCCCGTCGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGTTTGTGGTGGGTTACGGCATTGATTACGCACAGCGTTACCGTCATCTGCCGTATATCGGCAAAGTGATTCTGCTGGACGAGTAA‑GTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGc < 1:1588372/238‑1 (MQ=255) cGCTGGCGATTTGTACGCTGCTGGATAAACCGTCCCGTCGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGTTTGTGGTGGGTTACGGCATTGATTACGCACAGCGTTACCGTCATCTGCCGTATATCGGCAAAGTGATTCTGCTGGACGAGTAA‑GTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGc < 2:1303246/238‑1 (MQ=255) cGCTGCTGGATAAACCGTCCCGTCGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGTTTGTGGTGGGTTACGGCATTGATTACGCACAGCGTTACCGTCATCTGCCGTATATCGGCAAAGTGATTCTGCTGGACGAGTAA‑GTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGCTTGAGGTTGGAAATc > 1:713567/1‑238 (MQ=255) tgctgGAGAAACCGTCCCGTCGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGTTTGTGGTGGGTTACGGCATTGATTACGCACAGCGTTACCGTCATCTGCCGTATATCGGCAAAGTGATTCTGCTGGACGAGTAA‑GTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGCTTGAGGTTGGAAATCCCGt < 2:2231015/239‑1 (MQ=255) ctgGATAAACCGTCCCGTCGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGTTTGTGGTGGGTTACGGCATTGATTACGCACAGCGTTACCGTCATCTGCCGTATATCGGCAAAGTGATTCTGCTGGACGAGTAA‑GTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGCTTGAGGTTGGAAATCCCGTg > 2:1519214/1‑238 (MQ=255) 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aaCGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGTTTGTGGGGGGTTACGGCTTTGATTACCACCACGGTTACGGCCTTTTGCGGTTTAT‑GGCAAAAGGATTTTGCTTGGCGGGGAAGGGGGGAGGTTCCGGGATGGGTTGAATCCGGCTTGGCATTTTTTTTTGTGTTTGCGGGGTTTCGGCTTGGGGTGGGAAATCCGGTGCCGTTAAGGTTGTTCAGGGGtggtctct > 2:1318283/1‑232 (MQ=255) ggTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGTTTGTGGTGGGTTACGGCATTGATTACGCACAGCGTTACCGTCATCTGCCGTATATCGGCAAAGTGATTCTGCTGGACGAGTAA‑GTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGCTTGAGGTTGGAAATCCCGTGACGGTAACGTTGCTCAAGGGTTTCGCGGTTGGTGGc > 2:220673/1‑239 (MQ=255) ggTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGTTTGTGGTGGGTTACGGCATTGATTACGCACAGCGTTACCGTCATCTGCCGTATATCGGCAAAGTGATTCTGCTGGACGAGTAA‑GTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGCTTGAGGTTGGAAATCCCGTGACGGTAACGTTGCTCAAGGGTTTCGCGGTTGGTGGc > 2:421215/1‑239 (MQ=255) 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cGGCAAAGTGATTCTGCTGGACGAGTAA‑GTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGCTTGAGGTTGGAAATCCCGTGACGGTAACg > 2:562612/1‑122 (MQ=255) cGGCAAAGTGATTCTGCTGGACGAGTAA‑GTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGCTTGAGGTTGGAAATCCCGTGACGGTAACGTTGCTCAAGGGTTTCGCGGTTGGTGGCGGTAACATCCAGATCACgcagc > 2:390334/1‑171 (MQ=255) cGGCAAAGTGATTCTGCTGGACGAGTAA‑GTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGCTTGAGGTTGGAAATCCCGTGACGGTAACGTTGCTCAAGGGTTTCGCGGTTGGTGGCGGTAACATCCAGATCACgcagc < 1:390334/171‑1 (MQ=255) gCAAAGTGATTCTGCTGGACGAGTAA‑GTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGCTTGAGGTTGGAAATCCCGTGACGGTAACGTTGCTCAAGGGTTTCGCGGTTGGTGGCGGTAACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGAATGCCGTAGGcc > 2:1929633/1‑193 (MQ=255) 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aGTGATTCTGCTGGACGAGTAA‑GTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGCTTGAGGTTGGAAATCCCGTGACGGTAACGTTGCTCAAGGGTTTCGCGGTTGGTGGCGGTAACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGAATGCCGTAGGCCCAGCCGTGAATGGTAACTTTCTGCCCGCGTTTCCACGCTGATTGCATAAt > 1:2166846/1‑239 (MQ=255) tcgggtgGAGGAGTAA‑TTGTATAGTGTCCGGTTGTTTTCACTCGGGCATGGCTTTTTTTTTTGTGGTGGGCGTGTTTCAGTTTGGGGTTGGAACCCCCGGGACGGTACCGTTGCTAAGGGGTTTCGGGGTTGGGGGCGGTAACACCCATATCACGCAGCAGGCCTTCGTGAACGCCGGAGGCCCAGCCGTGAATGGTAACTTTCTGCCCGCGTTTCCACGCTGATTGCATAATGGTGGa < 2:2118864/234‑1 (MQ=255) tCTGCTGGACGAGTAA‑GTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGCTTGAGGTTGGAAATCCCGTGACGGTAACGTTGCTCAAGGGTTTCGCGGTTGGTGGCGGTAACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGAATGCCGTAGGCCCAGCCGTGAATGGTAACTTTCTGCCCGCGTTTCCACGCTGATTGCATAATGGTGGa < 1:2144099/239‑1 (MQ=255) ctgGACGAGTAC‑GTGTGAAGTTTCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGCTTGAGGTTGGCAATCCCGTGATGGTAACGTTGCTCAAGGGTTTCGCGGTTGGTGGCGGTAACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGAATGCCGTAGGCCCAGCCGTGAATGGTAACTTTCTGCCCGAGTTTACACGCTGATTCGATAAtgcgggtgtg > 2:2006093/1‑230 (MQ=255) tgGACGAGTAA‑GTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGCTTGAGGTTGGAAATCCCGTGACGGTAACGTTGCTCAGGGGTTTCGCGGTTGGTGGCGGTAACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGAATGCCTTAGGCCCAGCCGTGAATGGTAACTTTCTGCCCGCGTTTCCACGCTGATTGCATAATGGTGGAGTGGc < 1:666428/239‑1 (MQ=255) ggACGAGTAA‑GTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGCTTGAGGTTGGAAATCCCGTGACGGTAACGTTGCTCAAGGGTTTCGCGGTTGGTGGCGGTAACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGAATGCCGTAGGCCCAGCCGTGAATGGTAACTTTCTGCCCGCGTTTCCACGCTGATTGCATAATGGTGGAGTGGc < 2:753877/238‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) aGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGCTTGAGGTTGGAAATCCCGTGACGGTAACGTTGCTCAAGGGTTTCGCGGTTGGTGGCGGTAACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGAATGCCGTAGGCCCAGCCGTGAATGGTAACTTTCTGCCCGCGTTTCCACGCTGATTGCATAATGGTGGAGTGGccc < 1:2230556/224‑1 (MQ=255) ccGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGCTTGAGGTTGGAAATCCCGTGACGGTAACGTTGCTCAAGGGTTTCGCGGTTGGTGGCGGTa < 2:917527/114‑1 (MQ=255) tgtTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGCTTGAGGTTGGAAATCCCGTGACGGTAACGTTGCTCAAGGGTTTCGCGGTTGGTGGCGGTAACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGAATGCCGTAGGCCCAGCCGTGAATGGTAACTTTCTGCCCGCGTTTCCACGCTGATTGCATAATGGTGGAGTGGCCCAGGTTATACACCTGTTCCATGACgttc > 1:983028/1‑239 (MQ=255) gCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGCTTGAGGTTGGAAATCCCGTGACGGTAACGTTGCTCAAGGGTTTCGCGGTTGGTGGCGGTAACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGAATGCCGTAGGCCCAGCCGTGAATGGTAACTTTCTGCCCGCGTTTCCACGCTGATTGCATAATGGTGGAGTGGCCCAGGTTATACACCTGTTCCATGACgttcagtt < 1:1331105/239‑1 (MQ=255) 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GTGAGATCTTAAGCCTGCGCGAACCGAAGTCGCTGGCGATTTGTACGCTGCTGGATAAACCGTCCCGTCGTGAAGTGAACGTCCCGGTAGAATTTATCGGTTTCTCGATCCCGGATGAGTTTGTGGTGGGTTACGGCATTGATTACGCACAGCGTTACCGTCATCTGCCGTATATCGGCAAAGTGATTCTGCTGGACGAGTAA‑GTGTGAAGTTGCCGGATGTGTTGCATCCGGCATGGCATTTTTATTTGTGGTTGGCGTGTTTCAGCTTGAGGTTGGAAATCCCGTGACGGTAACGTTGCTCAAGGGTTTCGCGGTTGGTGGCGGTAACATCCAGATCACGCAGCAAGCCGTCGTGAATGCCGTAGGCCCAGCCGTGAATGGTAACTTTCTGCCCGCGTTTCCACGCTGATTGCATAATGGTGGAGTGGCCCAGGTTATACACCTGTTCCATGACGTTCAGTTCACACAA > NC_000913/141765‑142235 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |