New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 3844457 | 62 (0.990) | 6 (0.100) | 6/278 | 5.2 | 8.4% | coding (494/1767 nt) | adeD | cryptic adenine deaminase |
? | NC_000913 | = 3844761 | 74 (1.270) | coding (798/1767 nt) | adeD | cryptic adenine deaminase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
ACCCTGGCGTAATTAGCGGGCAGAATGCGCTGCTCGATAAACTGGATGCATTTCGCCACCTGACGCTGGACGGTCACTGCCCGGGTTTGGGTGGTAAAGAACTTAACGCCTATATTACTGCGGGTATTGAAAACTGCCACGAAAGTTATCAGCTGGAAGAAGGACGCCGGAAATTACAACTCGGCATGTCGTTGATGATCCGCGAAGGGTCCGCTGCCCGCAATCTCAACGCGCTGGCACCGTTGATCAACGAATTTAACAGCCCGCAATGCATGCTCTGTACCGATGACCGTAACCCGTGGGAGATCGCCCATGAAGGACACATCGATGCCTTAATTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTC > NC_000913/3844529‑3844995 | aCCCTGGCGTAATTAGCGGGCAGAATGCGCTGCTCGATAAACTGGATGCATTTCGCCACCTGACGCTGGACGGTCACTGCCCGGGTTTGGGTGGTAAAGAACTTAACGCCTATATTACTGCGGGTATTGAAAACTGCCACGAAAGTTATCAGCTGGAAGAAGGACGCCGGAAATTACAACTCGGCATGTCGTTGATGATCCGCGAAGGGTCCGCTGCCCGCAATCTCAACGCGCTGGCa < 1:750034/239‑1 (MQ=255) 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cgAAGGGTCCGCTGCCCGCAATCTCAACGCGCTGGCACCGTTGATCAACGAATTTAACAGCCCGCAATGCATGCTCTGTACCGATGACCGTAACCCGTGGGAGATCGCCCATGAAGGACACATCGATGCCTTAATTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCg > 2:737824/1‑166 (MQ=255) cgAAGGGTCCGCTGCCCGCAATCTCAACGCGCTGGCACCGTTGATCAACGAATTTAACAGCCCGCAATGCATGCTCTGTACCGATGACCGTAACCCGTGGGAGATCGCCCATGAAGGACACATCGATGCCTTAATTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCg < 1:737824/166‑1 (MQ=255) gAAGGGTCCGCTGCCCTGAATCTCAACGCGCTGGCACCGTTGATCAACGAATTTAACAGCCCGCAATGCATGCTCTGTACCGATGACCGTAACCCGTGGGAGATCGCCCATGAAGGACACATCGATGCCTTAATTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGc < 1:615533/239‑1 (MQ=255) tCCGCTGCCCGCAATCTCAACGCGCTGGCACCGTTGATCAACGAATTTAACAGCCCGCAATGCATGCTCTGTACCGATGACCGTAACCCGTGGGAGATCGCCCATGAAGGACACATCGATGCCTTAATTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCg > 1:827338/1‑238 (MQ=255) tCCGCTGCCCGCAATCTCAACGCGCTGGCACCGTTGATCAACGAATTTAACAGCCCGCAATGCATGCTCTGTACCGATGACCGTAACCCGTGGGAGATCGCCCATGAAGGACACATCGATGCCTTAATTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCCGGTCGACGGCGAGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCg > 2:847177/1‑238 (MQ=255) cGCTGCCCGCAATCTCAACGCGCTGGCACCGTTGATCAACGAATTTAACAGCCCGCAATGCATGCTCTGTACCGATGACCGTAACCCGTGGGAGATCGCCCATGAAGGACACATCGATGCCTTAATTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCACATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCCGGCCACCTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGGATCCTGCa > 2:615533/1‑239 (MQ=255) cTGCCCGCAATCTCAACGCGCTGGCACCGTTGATCAACGAATTTAACAGCCCGCAatgc < 2:87071/59‑1 (MQ=255) cTGCCCGCAATCTCAACGCGCTGGCACCGTTGATCAACGAATTTAACAGCCCGCAatgc > 1:87071/1‑59 (MQ=255) aaTCTCAACGCGCTGGCACCGTTGATCAACGAATTTAACAGCCCGCAATGCATGCTCTGTACCGATGACCGTAACCCGTGGGAGATCGCCCATGAAGGACACATCGATGCCTTAATTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGgcg < 1:153543/186‑1 (MQ=255) aaTCTCAACGCGCTGGCACCGTTGATCAACGAATTTAACAGCCCGCAATGCATGCTCTGTACCGATGACCGTAACCCGTGGGAGATCGCCCATGAAGGACACATCGATGCCTTAATTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGgcg > 2:153543/1‑186 (MQ=255) cAACGCGCTGGCACCGTTGATCAACGAATTTAACAGCCCGCAATGCATGCTCTGTACCGATGACCGTAACCCGTGGGAGATCGCCCATGAAGGACACATCGATGCCTTAATTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCg > 1:531965/1‑239 (MQ=255) gcTGGCACCGTTGATCAACGAATTTAACAGCCCGCAATGCATGCTCTGTACCGATGACCGTAACCCGTGGGAGATCGCCCATGAAGGACACATCGATGCCTTAATTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTc < 2:531965/235‑1 (MQ=255) | ACCCTGGCGTAATTAGCGGGCAGAATGCGCTGCTCGATAAACTGGATGCATTTCGCCACCTGACGCTGGACGGTCACTGCCCGGGTTTGGGTGGTAAAGAACTTAACGCCTATATTACTGCGGGTATTGAAAACTGCCACGAAAGTTATCAGCTGGAAGAAGGACGCCGGAAATTACAACTCGGCATGTCGTTGATGATCCGCGAAGGGTCCGCTGCCCGCAATCTCAACGCGCTGGCACCGTTGATCAACGAATTTAACAGCCCGCAATGCATGCTCTGTACCGATGACCGTAACCCGTGGGAGATCGCCCATGAAGGACACATCGATGCCTTAATTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTC > NC_000913/3844529‑3844995 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |