Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NC_000913	3423699–3424234	3424568–3424238	5–870	55 [50]	[53] 55	[rrfD]–[rrlD]	[rrfD],[rrlD]

ACTGTCCGCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTCCCACCTATC  >  NC_000913/3424555‑3424668               |                                                                                                    acTGTCCGCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTaa                >  2:783792/1‑100 (MQ=33)  cTGTCCGCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAATATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCCCCCTTCTAAg               >  2:2320848/1‑100 (MQ=255)  cTGTCCGCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAg               <  1:1473985/100‑1 (MQ=33)  cTGTCCGCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAg               >  2:102162/1‑100 (MQ=34)  cTGGCCGCAACCCGGATTACGGGTCAACTTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAg               <  2:1356109/100‑1 (MQ=16)   tGTCCGCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGc              >  2:430318/1‑100 (MQ=33)    gTCCGCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACCTCAAACATTAAAGGGTGGCATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGcc             >  1:2456798/1‑100 (MQ=255)    gTCCGCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGcc             >  2:1012863/1‑100 (MQ=34)    gTCCGCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGcc             >  2:944888/1‑100 (MQ=34)    gTCCGCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATAAAACATTCAAGGGCGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGCCTGGCGCCCCCACCTCTACGcc             >  2:2590025/1‑100 (MQ=11)    gTCCGCAACCCGGATTACGGGTCAACCTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATCCAGACTGGCGCCCACACTTCTAAGcc             >  2:1703462/1‑100 (MQ=255)     tCCGCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCt            >  2:252990/1‑100 (MQ=33)      ccGCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCtt           <  1:216673/100‑2 (MQ=21)      ccGCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTc           <  1:126108/100‑1 (MQ=33)      ccGCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTc           <  1:2219064/100‑1 (MQ=34)      ccGCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTc           >  1:2644795/1‑100 (MQ=33)       cGCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGTCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTcc          <  1:444458/100‑1 (MQ=18)       cGCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTcc          <  1:2554397/100‑1 (MQ=34)       cGCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTcc          >  1:717856/1‑100 (MQ=33)       cGCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTcc          <  1:691746/100‑1 (MQ=34)       cGCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTcc          <  1:628174/100‑1 (MQ=34)       cGCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTcc          <  1:240478/100‑1 (MQ=34)        ttgaCCCGTAATCCGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTccc         >  1:642438/4‑100 (MQ=11)        gCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCGCACTTCTAAGCCTccc         <  1:754798/100‑1 (MQ=21)        gCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTccc         <  1:347339/100‑1 (MQ=34)        gCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTccc         <  1:37498/100‑1 (MQ=33)        gCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTccc         <  1:2271259/100‑1 (MQ=34)        gCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTccc         <  1:1296148/100‑1 (MQ=34)        gCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTccc         <  1:61964/100‑1 (MQ=33)        gCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTccc         <  1:2085649/100‑1 (MQ=34)        gCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTccc         <  1:666881/100‑1 (MQ=34)        gCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTccc         <  1:1457717/100‑1 (MQ=34)        gCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTccc         <  1:1705663/100‑1 (MQ=33)        gCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTccc         <  1:1508945/100‑1 (MQ=33)        gCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTccc         <  1:862921/100‑1 (MQ=34)         cAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCGTGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTcccg        <  1:1222683/100‑2 (MQ=18)         cAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTCCCa        <  1:1037376/100‑1 (MQ=34)         cAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTCCCa        <  1:818951/100‑1 (MQ=34)         cAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTCCCa        <  1:201629/100‑1 (MQ=34)          aaCCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTCCCAc       <  1:1483250/100‑1 (MQ=34)          aaCCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTCCCAc       <  1:1350325/100‑1 (MQ=34)          aaCCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTCCCAc       <  1:1162620/100‑1 (MQ=34)          aaCCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACACTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTCCCAc       <  1:237724/100‑1 (MQ=21)           aCCCGGATTATGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTCCCAcc      <  1:100777/100‑1 (MQ=21)           aCCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTCCCAcc      >  1:604738/1‑100 (MQ=34)           aCCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTCCCAcc      <  1:1783873/100‑1 (MQ=34)            cccGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGGCTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTCCCAccc     <  1:1571604/100‑2 (MQ=21)            cccGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTCCCACCt     >  1:950388/1‑100 (MQ=33)            cccGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTCCCACCt     >  2:999271/1‑100 (MQ=34)            cccGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATCTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTCCCACCt     >  2:1551522/1‑100 (MQ=18)            cccGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACAGTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTCCCACCt     >  2:751456/1‑100 (MQ=21)              cGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTCCCACCTAt   <  2:1515343/100‑1 (MQ=33)              cGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTCCCACCTAt   >  2:785741/1‑100 (MQ=33)               ggATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTCCCACCTATc  >  2:1861400/1‑100 (MQ=34)               ggATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTCCCACCTATc  >  2:236806/1‑100 (MQ=34)               |                                                                                                    ACTGTCCGCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTTCTAAGCCTCCCACCTATC  >  NC_000913/3424555‑3424668

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑