| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 232 total aligned reads displayed.
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ctaAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTC‑G‑CCCTTC‑GGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCg < 1:1446463/151‑1 (MQ=255) ccATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTC‑G‑CCCTTC‑GGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTatca < 1:1967304/85‑1 (MQ=39) ccATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTC‑G‑CCCTTC‑GGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGcc > 1:35149/1‑199 (MQ=255) atatCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTC‑G‑CCCTTC‑GGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTAc < 2:2396531/112‑1 (MQ=255) atatCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTC‑G‑CCCTTC‑GGGCCGGTGCTAAAGCCACGTTATCATCCCCAGGGCCCGCGGTTCATTTCCCTACCTCTTCCATACCTTCCTTGCTGAAGATTTCGGGGGATATGGTGCATCCGGGGGGATTCGAAACTCCCCACCCTCGGTTCGTAGCCGAGTAATCTATCCAGGCGAGCAACAGATGCaatggggcattt > 2:2603494/1‑228 (MQ=14) atatCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCCC‑G‑CCCTTC‑GGGCCGTTGCTAAAGCa > 1:2387871/1‑74 (MQ=25) atCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTC‑G‑CCCTTC‑GGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCg > 2:2380233/1‑96 (MQ=255) atCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTC‑G‑CCCTTC‑GGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCg < 1:2380233/96‑1 (MQ=255) ttAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTC‑G‑CCCTTC‑GGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTAcc > 1:54055/1‑106 (MQ=255) ttAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTC‑G‑CCCTTC‑GGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCt < 1:117710/178‑1 (MQ=255) ttAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTC‑G‑CCCTTC‑GGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTAc < 1:1496040/239‑1 (MQ=255) 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tGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTC‑G‑CCCTTC‑GGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGGGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTTGAACCTCCGACCGCCCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGGGCTACTGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGatt > 1:1112424/1‑238 (MQ=255) tGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTC‑G‑CCCTTC‑GGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGaa < 1:937307/133‑1 (MQ=255) tGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTC‑G‑CCCTTC‑GGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGaa > 2:937307/1‑133 (MQ=255) tGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTC‑G‑CCCTTC‑GGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTActgct < 1:834450/235‑1 (MQ=255) tGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTC‑G‑CCCTTC‑GGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTActgct < 1:143981/235‑1 (MQ=255) tGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTC‑G‑CCCTTC‑GGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTActgct < 1:733869/235‑1 (MQ=255) tGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTC‑G‑CCCTTC‑GGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGata > 1:780708/1‑239 (MQ=255) gTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTC‑G‑CCCTTC‑GGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCTGCTAc < 2:2226343/95‑1 (MQ=255) 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1:2083104/1‑237 (MQ=255) aggaTTACTCGCCTTGCGGCTC‑G‑CCCTTC‑GGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCAGCGGGTAATTCCGCCAACTCTTCGATACCTTCATTg > 2:1306299/1‑103 (MQ=14) | TGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGA‑‑TATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTC‑G‑CCCTTC‑GGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTA > NC_000913/2817728‑2818177 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |