| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 2286126 = | 120 (0.840) | 6 (0.050) | 6/310 | NT | 5.7% | coding (1751/1761 nt) | yejM | essential inner membrane DUF3413 domain‑containing protein; lipid A production and membrane permeability factor |
| ? | NC_000913 | 2286159 = | 89 (0.670) | intergenic (+23/‑52) | yejM/proL | essential inner membrane DUF3413 domain‑containing protein; lipid A production and membrane permeability factor/tRNA‑Pro | |||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
TGCCAGCGAATATTCGCAAGGTCAGGATTTGTTCAACCCTCAACGCCGTCATTACTGGGTTACCGCAGCGGATAACGATACGCTGGCAATTACCACCCCGAAAAAGACGCTGGTACTGAACAATAACGGTAAATACCGCACTTACAACTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGGGTCGGAGGTTCAAATCCTCTCGTGCCGACCAAAAATCCCAAGAAAAAACCAACCCTTACGGTTGGTTTTTTTATATCTGCAATTAATTCG > NC_000913/2285899‑2286346 | agaaaataaacaggctgtgatgtgtcacggtctgtttatcgaattaattgcagatataaaaaaaccaaccgtaagggttggttttttcttgggatttttggtcggcacgagaggatttgaacctccgacccccgacaccccatgacggtgcgctaccaggctgcgctacgtgccgactcgtggctgctaatactaccgttttccacaccgattgcaagtaagatattt < 1:1604993‑M1/1‑1 (MQ=255) ataaacaggctgtgatgtgtcacggtctgtttatcgaattaattgcagatataaaaaaaccaaccgtaagggttggttttttcttgggatttttggtcggcacgagaggatttgaacctccgacccccgacaccccatgacggtgcgctaccaggctgcgctacgtgccgactcgtggctgctaatactaccgttttccacaccgattgcaagtaagatattTCGCTa < 2:516717‑M1/6‑1 (MQ=255) ggctgtgatgtgtcacggtctgtttatcgaattaattgcagatataaaaaaaccaaccgtaagggttggttttttcttgggatttttggtcggcacgagaggatttgaacctccgacccccgacaccccatgacggtgcgctaccaggctgcgctacgtgccgactcgtggctgctcatactaccgttttccacaccgattgcaagtacgctattTCGCTAACTTatt < 1:410804‑M1/13‑1 (MQ=255) gctgtgatgtgtcacggtctgtttatcgaattaattgcagatataaaaaaaccaaccgtaagggttggttttttcttgggatttttggtcggcacgagaggatttgaacctccgacccccgacaccccatgacggtgcgctaccaggctgcgctacgtgccgactcgtggctgctaatactaccgtttccacaccgattgcaagtaagatatttcgcctgtctcttta < 1:2044676‑M1/15‑12 (MQ=255) ctgtgatgtgtcacggtctgtttatcgaattaattgcagatataaaaaaaccaaccgtaagggttggttttttcttgggatttttggtcggcacgagaggatttgaacctccgacccccgacaccccatgacggtgcgctaccaggctgcgctacgtgccgactcgtggctgctaatactaccgttttccacaccgattgcaagtaagatattTCGCTAACTGatt > 1:1271856‑M1/214‑226 (MQ=255) atgtgatgtgtcacggtcggtttatcgaattaattgcagatataaacaaaccaaccgtaagggttggttttttcttgggatttttggtcggcacgagaggatttgaacctccgacccccgacaccccatgacggtgcgctaccaggctgcgctacgtgccgactcgtggctgctaatactaccgttttccacaccgattgcaagtaagatattTCGCTAACTGatt > 1:1782055‑M1/214‑226 (MQ=255) cAGGATTTGTTCAACCCTCAACGCCGTCATTACTGGGTTACCGCAGCGGATAACGATACGCTGGCAATTACCACCCCGAAAAAGACGCTGGTACTGAACAATAACGGT‑AATACCGCACTTACAACTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATc < 2:749166/228‑1 (MQ=255) cacggtctgtttatcgaattaattgcagatataaaaaaaccaaccgtaagggttggttttttcttgggatttttggtcggcacgagaggatttgaacctccgacccccgacaccccatgacggtgcgctaccaggctgcgctacgtgccgactcgtggctgctaatactaccgttttccacaccgattgcaagtaagatattTCGCTAACTGat < 2:1363651‑M1/12‑1 (MQ=255) acggtctgtttatcgaattaattgcagatataaaaaaaccaaccgtaagggttggttttttcttgggatttttggtcggcacgagaggatttgaacctccgacccccgacaccccatgacggtgcgctaccaggctgcgctacgtgccgactcgtggctgctaatactaccgttttccacaccgattgcaagtaagatattTCGCTAACTGatt > 1:1366110‑M1/202‑214 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1:1720641/1‑228 (MQ=255) aagaTGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAg < 2:1156779/90‑1 (MQ=255) aGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGGGTCGGAGGTTCAAATCCTCTCGTGCCGACCAAAAATCCCAAGAAAAaacc < 2:1442762/226‑1 (MQ=255) aGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGGGTCGGAGGTTCAAATCCTCTCGTGCCGACCAAAAATCCCAAGAAAAaacc < 2:665316/226‑1 (MQ=255) gTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGGGTCGGAGGTTCAAATCCTCTCGTGCCGACCAAAAATCCCAAGCAAAAACCAACCCTTa > 1:1487355/1‑228 (MQ=255) 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TGCCAGCGAATATTCGCAAGGTCAGGATTTGTTCAACCCTCAACGCCGTCATTACTGGGTTACCGCAGCGGATAACGATACGCTGGCAATTACCACCCCGAAAAAGACGCTGGTACTGAACAATAACGGTAAATACCGCACTTACAACTTACGTGGTGAAAGAGTGAAAGATGAAAAACCACAGTTAAGTTTGTTATTGCAAGTGCTGACAGACGAGAAGCGTTTTATCGCTAACTGATTAATTATAAATCAGTTAGCGAAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCAGCCTGGTAGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGGGTCGGAGGTTCAAATCCTCTCGTGCCGACCAAAAATCCCAAGAAAAAACCAACCCTTACGGTTGGTTTTTTTATATCTGCAATTAATTCG > NC_000913/2285899‑2286346 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |