| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 82,766 | A→G | 12.3% | L255P (CTC→CCC) | leuA ← | 2‑isopropylmalate synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 82,766 | 0 | A | G | 12.3% | 258.5 / 4.3 | 111 | L255P (CTC→CCC) | leuA | 2‑isopropylmalate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (29/64); new base G (12/3); total (44/67) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.74e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
GAGGTCAGATTCAGCTGGATTTGGTTCAGACCAATAGATTCTGGTGTCATGATTTCGTAGTTTTCGCGGTTTTTCAGCACGCCATCCTGGTGTATACCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑CCAGGCCCAAATCGTCGTGGGTATGTACGGAGATAATGGCTTTGTCGATGTTAGGCACGCGTTCATACAGGCCGCTGATGATTCCGGC > NC_000913/82541‑82989 | gagGTCAGATTCAGCTGGATTTGGTTCAGACCAATAGATTCTGGTGTCATGATTTCGTAGTTTTCGCGGTTTTTCAGCACGCCATCCTGGTGTATACCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTgaga < 2:232197/228‑1 (MQ=255) gTCAGATTCAGCTGGATTTGGTTCAGACCAATAGATTCTGGTGTCATGATTTCGTAGTTTTCGCGGTTTTTCAGCACGCCATCCTGGTGTATACCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAata < 1:352516/228‑1 (MQ=255) gCTGGATTTGGTTCAGACCAATAGATTCTGGTGTCATGATTTCGTAGTTTTCGCGGTTTTTCAGCACGCCATCCTGGTGTATACCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGGGATTAATGGCGGTGTGGGCGTTGGGAAAATcc > 2:784574/1‑221 (MQ=255) cTGGATTTGGTTCAGACCAATAGATTCTGGTGTCATGATTTCGTAGTTTTCGCGGTTTTTCAGCACGCCATCCTGGTGTATACCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGaa < 1:785903/215‑1 (MQ=255) tCAGACCAATAGATTCTGGTTTCATGATTTCGTAGTTTTCGCGGTTTTTCAGCACGCCATCCTGGTGTATACCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAata < 1:1465896/206‑1 (MQ=255) cAGACCAATAGATTCTGGTGTCATGTTTTCGTAGTTTTCGCGGTTTTTCAGCCCGCCATCCTGGTGTATACCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGc < 2:1553682/225‑1 (MQ=255) aCCAATAGATTCTGGTGTCATGATTTCGTAGTTTTCGCGGTTTTTCAGCACGCCATCCTGGTGTATACCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGGTTGGACGTTTTGAATATCCTTACCAACTTTGATCGCCatgat > 1:866216/1‑228 (MQ=255) aCCAATAGATTCGTGTGTCATGATTTCGTAGGTTTCGCAGTCTTTCAGCACGCCATCCTGGTGTATACCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCatga < 2:1436714/227‑1 (MQ=255) tAGATTCTGGTGTCATGATTTCGTAGTTTTCGCGGTTTTTCAGCACGCCATCCTGGTGTATACCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATc < 2:572704/199‑1 (MQ=255) tAGATTCTGGTGTCATGATTTCGTAGTTTTCGCGGTTTTTCAGCACGCCATCCTGGTGTATACCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGAGTGGACGTTGAGAATATTCTTTCGAACATTTATTGCCctgattaatt > 1:1477053/1‑223 (MQ=255) aGATTCTGGTTTCATGATTTCGTAGTTTTCGCGGTTGTTGAGCACGCCATCCTGGTGTATACCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGAc < 2:1474424/225‑1 (MQ=255) gATTCTGGTGTCATGATTTCGTAGTTTTCGCGGTTTTTCAGCACGCCATCCTGGTGGATACCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGActtc < 1:1283749/227‑1 (MQ=255) gATTCTGGTGTCATGATTTCGTAGTTGTCGCGGTTTTTCAGCACGCCATCCTGGTGTATACCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGActtc < 1:1359328/227‑1 (MQ=255) tCTGGTGTCATGATTTCGTAGTTTTCGCGGTTTTTCAGCACGCCATCCTGGTGTATACCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATTTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGGGAGTGGGAAAATCCTCACGGAACTTGATCGCCCTGATGActtcattc > 2:1044943/1‑224 (MQ=255) tCTGGTGTCATGATTTCGTAGTTTTCGCGGTTTTTCAGCACGCCATCCTGGTGTATACCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGGCGGTTAGAATATACCTTCGAACTTTGTTCGCCatgattaactttttc > 2:221014/1‑218 (MQ=255) tGGTGTCATGATTTCGTAGTTTTCGCGGTTTTTCAGCACGCCATCCTGGTGTATACCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGCGGGGACGCTGTGAGTATCTCTATGAAATTTTATCGCCACGATGACtgcttctc > 2:310591/1‑225 (MQ=255) tgtCATGATTTCGTAGTTTTCGCGGTTTTTCAGCACGCCATCCTGGTGTATACCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGa < 1:648726/228‑1 (MQ=255) tCATGATTTCGTAGTTTTCGCGGTTTTTCAGCACGCCATCCTGGTGTATACCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGCGTGGACGTTGTGAATATACTTTCGTACCTTTATCGCCCCTATGACTGCTTCCA‑CGGat > 2:1056388/1‑226 (MQ=255) gtttGATTACGTAGTTTTCGCGGTTTTTCAGCACGCCATCCTGGTGTATACCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTTGGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑gggga > 1:1699910/4‑225 (MQ=255) tGATTTCGTAGTTTTCGCGGTTTTTCAGCACGCCATCCTGGTGTATACCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGActtc < 1:8908/214‑1 (MQ=255) tGATTTCGTAGTTTTCGCGGTTTTTCAGCACGCCATCCTGGTGTATACCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGaa < 1:1644206/224‑1 (MQ=255) aTTTCGTAGTTTTCGCGGTTTTTCAGCACGCCATCCTGGTGTATACCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGGGAAAATCCTTACGAACTTTGATCGCCCTGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGtt > 1:518930/1‑227 (MQ=255) tCGTAGTTTTCGCGGTTTTTCAGCACGCCATCCTGGTGTATACCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGGAC‑CGTTTCCg > 1:1060573/1‑228 (MQ=255) ttCAGCACGCCATCCTGGTGTATACCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATccc < 1:530462/227‑1 (MQ=255) cGCCATCCTGGTGTATACCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACGGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑tt < 1:1058288/227‑1 (MQ=255) gtgtATACCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCAc < 1:586452/228‑1 (MQ=255) tataCCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGGGAATATCCTTACGACCTTTGATAGCCATGATGACTTCTTCCC‑GGGGAC‑AGATTCCGGCACGCTCGCC‑GATACCGGTCA‑TTGCGGCCTTCACCt > 2:503531/1‑227 (MQ=255) tataCCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTg < 2:716568/228‑1 (MQ=255) tataCCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGGTCA‑TTGCGCCTTCCACCt > 1:224512/1‑227 (MQ=255) taCCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTATGAACTTTTATCGCCCAGATGACTTCTTCCC‑GGGGACAAGTTTCC‑GCACGCTCCCC‑GATACCGTTCA‑TTTGCCCTTTCACCCGGc > 2:374677/1‑228 (MQ=255) taCCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGGGTGGGGCTTGGGAATATCCTTTCGGAATTTGATTGCCCTGGTGACTTCTTCCA‑GGGGAC‑AGTTTCCCGCCCGCCCGCCGGTTCCGGTTCA‑TT‑CGCCCTCCACCTGGc > 2:246018/1‑228 (MQ=255) gaggagTTTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCa < 1:340655/228‑1 (MQ=255) gaggagTGTGCGACTGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCa < 2:20246/228‑1 (MQ=255) gaggagTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCa < 1:1375570/228‑1 (MQ=255) aggagTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTga < 1:1305541/126‑1 (MQ=255) aggagTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTTAGAATAACCTTACGAACTTTTATTGCCATGATGACTTCTTTCA‑GGGAAA‑CGGTTCCGGGACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTTGGCCTTTCACCTTGCGTGCAc > 1:2012839/1‑228 (MQ=255) ggagTGTGCGAATGCCCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCAc < 1:84615/227‑1 (MQ=255) gtgtGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGAGGTTGGGAATATCCTTACGAACCTTTATCGCCATGAGGACTTCTTCCC‑GGGAAC‑AGGTTCCGGCACGACCGCC‑GATTCCGGTCA‑TTGTGCCTTCCACCTGGCGTGCACAgg > 2:631156/1‑227 (MQ=255) gtgCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCAt < 1:1115281/228‑1 (MQ=255) gtgCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCAt < 1:1731175/228‑1 (MQ=255) tgCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTTATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCCGGCACCGGCATg > 1:1810462/1‑228 (MQ=255) aTGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGGGAATATCCTTTCGAACCTTGATCGCCCTGATGACTTCTTCCA‑GGGGAC‑AGTTTTCGGCACGCCCGCC‑CAATCCCTTCA‑TTGCGCCTTTCCCCTGGCGGGGACCCGCACGTAccg > 2:1171171/1‑228 (MQ=255) cgccgcTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGGCGTTGGGAATATCCTTACGAACTTTGTTTGCCCTGATGAATTCTTCCA‑GGGAAA‑AGTTTTCGGCCCGCTCCCC‑CGTGCCGTTctg > 2:2035423/1‑188 (MQ=255) cgccgcTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATc < 1:1996903/134‑1 (MQ=255) gccgcTGCCAACAATGGTTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCCTATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑tt < 1:2039067/190‑1 (MQ=255) ccgcTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAAAATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGAGTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTTCGGGACGCCCGCC‑GGTCCCGTTCC‑TTGCGCCCTCCCCCTGGCGGGCAACGGCATGTAAcgccgc > 2:181456/1‑227 (MQ=255) gcTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGGGAATATCCTTACGAACTTTTATCGCCCTGATGGATTTTTTCA‑GGGAAC‑AGGTTTCGGCACCCCCGCC‑CGTCCCGGTCC‑TTGCGCCTTTCACCTGGCTGGTACCGGGACGTaacccc > 2:263108/1‑218 (MQ=255) ttgttggCCGGTATCGGCATTGTACAAATCTGGTTACTTAACTGGCTGGTGCGCCTTATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTCCGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCCCGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑c < 2:1634112/227‑1 (MQ=255) tttgCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGGGAATATCCTTTCGAAATTTGATCGCCATGATGGATTTTTCCC‑TGGGAC‑AGGTTTCGGGACCCCCCCC‑GGTTCCGTTCATTTGCGCTTTCCCCTGGGCGGGACCGGGCATTTACCCCGCCCC‑GTGAGTTTCTGCCCG‑CCAg > 2:442026/1‑228 (MQ=255) tCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGGGTGGACGTTGGGAATATCCTTACGAAATTTGAACGCCATGGAGAATTCTTCCAGGGGAAA‑AGTTT‑CGGCACGGTCGCC‑GAACCCGGTCA‑TTGCGCCTTCCACCCGGCGGGGACCGGCATGTAACCCCCCCC‑GTGAGGGTTCGACCG‑CCAGGGCCtaaaggt > 2:335435/1‑224 (MQ=255) ggCATATTACAACTCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGGGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑CCAGGCCCAAAtcgtcg < 1:263555/228‑1 (MQ=255) ggCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑CCAGGCCCAAAtcgtcg < 1:362754/228‑1 (MQ=255) gCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTTTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑CCAGGCCCAAAtcgtcg < 1:408601/227‑1 (MQ=255) tttACAAATCTGGCTAACTAATGGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGACCTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCCCGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCCCCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑CCAGGCCCAAATCGTCGTGGGt < 1:403510/227‑1 (MQ=255) attcaaaattgggCTAGCTAACGGGCTGGTTGGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑CCAGGCCCAAATCGTCGTGGGt < 1:504352/217‑1 (MQ=255) atTACAAATGTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGACCTTTGATCGCCATGATGCCTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑CCAGGCCCAAATCGTCGTGGGt < 1:1579269/228‑1 (MQ=255) agtACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATTTCTCCTGGTGATTAATGGCTGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑CCAGGCCCAAATCGTCGTGGGt < 1:336003/226‑1 (MQ=255) tACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGAAGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCCCCC‑GTGGGTTTTCGTCCGCCCAGGCCCAAATCGCCGCggtag > 2:1783796/1‑225 (MQ=255) aTCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCtt > 1:1928582/1‑74 (MQ=255) tcgggCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑CCAGGCCCAAATCGTCGTGGGTATGTACg < 1:375295/224‑1 (MQ=255) tCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTa < 2:1925163/74‑1 (MQ=255) tGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTTTTCCC‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCCCGCTCGCC‑CATACCCTTCA‑TTGTGCCCTCCACCCGGCCGGGACCCGCATGTAACCCCCCCA‑GGGAGGTTTCGTCCGCCCAGGCCCAAATCTCCGTgggagtgaa > 2:1581684/1‑218 (MQ=255) gCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCatgatg > 2:1431165/1‑91 (MQ=255) gCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCAc > 2:825041/1‑119 (MQ=255) ctaactaaCTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTga < 2:858109/58‑1 (MQ=255) ctaactaaCTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCAtgatga < 1:1433731/91‑1 (MQ=255) ctaactaaCTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACg < 1:826468/119‑1 (MQ=255) tggTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTCCGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATTTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑CCAGGCCCAAATCGTCGTGGGTATGTACGGAGATAATGGCTTTGTCg < 1:632197/227‑1 (MQ=255) cATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GAt > 2:1001118/1‑107 (MQ=255) atatCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATc < 1:1002935/107‑1 (MQ=255) tgtctcCTGGTAATTAAGGGCGTTGTGGACGTTGAGAATACCCTTACGATCTTGGAGCGCCATGATGGCTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCCCCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑CCAGGCCCAAATCGTCGTGGGTATGTACGGAGATAATGGCTTTGTCGATGTTAGGCa < 2:224130/225‑1 (MQ=255) tattcccTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATTTCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTCCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑CCAGGCCCAAATCGTCGTGGGTATGTACGGAGATAATGGCTTTGTCGATGTTAGGCa < 1:1232665/222‑1 (MQ=255) tatccctgggTGATAAATGGCGGTGTGGACTTGGAGAATTTCCTTACGAACTTTACGCGCATTGATTACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGATTTTCCGACCG‑CCAGGCCCAAATCGTCGTGGGTATGTACGGAGATAATGGCTTTGTCGATGTTAGGCa < 2:685623/219‑1 (MQ=255) tataTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATACCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCCCCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑CCAGGCCCAAATCGTCGTGGGTATGTACGGAGATAATGGCTTTGTCGATGTTAGGCa < 2:246025/227‑1 (MQ=255) tatCTCCTGTGAATTAATGGCGGTGTGACCTTTGAGATTTCCCTTACGAACTTTGACCCCCATGATGACTTCTCCCG‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑CCAGGCCCAAATCGTCGTGGGTATGTACGGAGATAATGGCTTTGTCGATGTTAGGCa < 2:1578893/227‑1 (MQ=255) tatCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTCCGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTGCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑CCAGGCCCAAATCGTCGTGGGTATGTACGGAGATAATGGCTTTGTCGATGTTAGGCa < 1:1684298/227‑1 (MQ=255) tatCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGCCTTCTTCCA‑GGGACC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑CCAGGCCCAAATCGTCGTGGGTATGTACGGAGATAATGGCTTTGTCGATGTTAGGCa < 1:442757/227‑1 (MQ=255) tatCGCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTTGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑CCAGGCCCAAATCGTCGTGGGTATGTACGGAGATAATGGCTTTGTCGATGTTAGGCa < 1:1046829/227‑1 (MQ=255) tatCCCTTGGTGATTAAGGGCGGTGTGGACGTTGAAATTATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑CCAGGCCCAAATCGTCGTGGGTATGTACGGAGATAATGGCTTTGTCGATGTTAGGCa < 2:864705/227‑1 (MQ=255) ggTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTTTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTTCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GGGAGTTTCCGACCG‑CCACGCCCCAAACGCCGTGGGGATGTAc > 1:1406039/1‑190 (MQ=255) ggTGATTAATGGCGGTGGGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑CCAGGCCCAAATCGTCGTGGGTATGTACGGAGATAATGGCCTTGTCGATGTTAGGc > 1:147423/1‑218 (MQ=255) gtaaTTAATGGCGGTGTGTACGTTGGAAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGCCTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCCCGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑CCAGGCCCAAATCGTCGTGGGTATGTACg < 2:1403519/187‑1 (MQ=255) gTGATTAAGGGCGGTTGGGACGTTGAAAATTTCCTACCCAACTTTGATCGCCATGATGCCTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCCCGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑CCAGGCCCAAATCGTCGTGGGTATGTACGGAGATAATGGCTTTGTCGATGTTAGGCa < 2:147162/218‑1 (MQ=255) tGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTTTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGGTCA‑TTGCGCCTTTCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCCCCGCCC‑GTGGGGTTTCGACCG‑CCAGGCCCCAAacgtc > 2:1541659/1‑176 (MQ=255) tGATTAATGGAGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGa > 2:2009082/1‑149 (MQ=255) gATTAATGGCGGTGGGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑CCAGGCCCAAAtcgtcg < 1:1544408/176‑1 (MQ=255) gATTAATGGAGTTGTGGCCGTTGAGAATCTCCTGCCGAACTTTGATCGCCATGATGCCTTCTTCCA‑GGGACC‑AGTTTCCGGCACGCCCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGCCTTGCCCCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAg < 1:2012666/149‑1 (MQ=255) aTTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCatg > 2:1715011/1‑52 (MQ=255) aTTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGGAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCCGGCGTGCACCGGCCTGTACCCCCGCCA‑g > 2:649389/1‑144 (MQ=255) ttAATGGCGGTTTGGACGTTGAGAATATCCTTACGACCTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCCCCGGCATGTACCGCCGCCA‑Gt < 1:650472/144‑1 (MQ=255) ttAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCatga < 1:1718041/52‑1 (MQ=255) ttAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCATTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGGGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑CCAGGCCCAAATCGTCGTGGGTATGTACGGAGATAATGGCTTTGTCGATGTTAGGCACGCGTTCATACAgg < 1:1492532/228‑1 (MQ=255) aaTGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GGGAGTTTCCGACCG‑CCAGGGCCCAATCGTCGTGGGGAAGTGCGGAGAATAAGGCCTTTTCGCAGTTTGGCa > 2:2038960/1‑212 (MQ=255) aaTGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTGCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑CCAGGCCCAAATCGTCGTGGGTATGTACGGAGATAATGGCTTTGTCGATGTTAGGCACGCGTTCATACAGGcc < 2:792938/228‑1 (MQ=255) aaTGGCGGTGGGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCC‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGGTCA‑TTTCGCCCTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCACGGGGGTTTCC‑ACCG‑CCCGGCCCCAAacgtccgtg > 2:1432774/1‑171 (MQ=255) aTGGCGGTGTGGACGTTGGGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑CCAGGCCCAAATCGTCGTGGGTATGTACGGAGATAATGGCTTTGTCGATGTTAGGCa < 1:2042606/211‑1 (MQ=255) cGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑CCAGGCCCAAATCGTCGTGGGTa < 1:41187/173‑1 (MQ=255) gTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑CCACGCCCAAATCGTCGTGGGTATGTACGGAGATAATGGCCTTGTCGATGTTAGGCCCGCGTTCATACAGGCCCCTGAGGATTTCGGc > 1:1225864/1‑228 (MQ=255) gagaATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑CCAGGCCCAAATCGTCGTGGGTATGTAc > 1:1862881/1‑165 (MQ=255) agaATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑CCAGGCCCAAATCGTCGTGGGTATGTACg < 2:1859590/165‑1 (MQ=255) | GAGGTCAGATTCAGCTGGATTTGGTTCAGACCAATAGATTCTGGTGTCATGATTTCGTAGTTTTCGCGGTTTTTCAGCACGCCATCCTGGTGTATACCGGAGGAGTGTGCGAATGCGCCGCTGCCAACAATGGCTTTGTTTGCCGGGATCGGCATATTACAAATCTGGCTAACTAACTGGCTGGTGCGCCATATCTCCTGGTGATTAATGGCGGTGTGGACGTTGAGAATATCCTTACGAACTTTGATCGCCATGATGACTTCTTCCA‑GGGAAC‑AGTTTCCGGCACGCTCGCC‑GATCCCGTTCA‑TTGCGCCTTCCACCTGGCGTGCACCGGCATGTACCGCCGCCA‑GTGAGTTTCCGACCG‑CCAGGCCCAAATCGTCGTGGGTATGTACGGAGATAATGGCTTTGTCGATGTTAGGCACGCGTTCATACAGGCCGCTGATGATTCCGGC > NC_000913/82541‑82989 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 6 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |