| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4515759 = | 117 (0.840) | 3 (0.020) | 3/540 | NT | 2.6% | coding (919/2325 nt) | fecA | TonB‑dependent outer membrane ferric citrate transporter and signal transducer; ferric citrate extracelluar receptor; FecR‑interacting protein |
| ? | NC_000913 | 4515778 = | 107 (0.780) | coding (900/2325 nt) | fecA | TonB‑dependent outer membrane ferric citrate transporter and signal transducer; ferric citrate extracelluar receptor; FecR‑interacting protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
GGTAGCCGCTGCGCAGGGTTTGGGTGTAGAACCCCTGAATGTTGAATTTATGCTGGCTGTCTGGCTGGAACTGGTAGCCCAGGCTCGCCAGCTTGCGACGACCCCAGAAGCGGTCATACGGGCGGGTGGATTGCCAGCGATCGGCGTCGTAATCCGCGCGAGACAGGCCACCGGGCATGTCGGCTTCACCGTCGTAATATTGCAGCAGGCTGTTGAAGGTGTGCACCTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGC > NC_000913/4515474‑4516035 | gttacccGCTGGCCAGGGTGTGGGTGGAGAACCCCTGAATGTTGAATTTATGCTGGCTGTCTGGCTGGAACTGGTAGCCCAGGCTCGCCAGCTTGCGACGACCCCAGAAGCGGTCATACGGGCGGGTGGATTGCCAGCGATCGGCGTCGTAATCCGCGCGAGACAGGCCACCGGGCATGTCGGCTTCACCGTCGTAATATTGCAGCAGGCTGTTGAAGGTGTGCACCTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTcgcg < 2:1182621/284‑1 (MQ=255)ggTAGCCGCTGCGCAGGGTTTGGGTGTAGAACCCCTGAATGTTGAATTTATGCTGGCTGTCTGGCTGGAACTGGTAGCCCAGGCTCGCCAGCTTGCGACGACCCCAGAAGCGGTCATACGGGCGGGTGGATTGCCAGCGATCGGCGTCGTAATCCGCGCGAGACAGGCCACCGGGCATGTCGGCTTCACCGTCGTAATATTGCAGCAGGCTGTTGAAGGTGTGCACCTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTcgcg < 1:522265/289‑1 (MQ=255)ggTAGCCGCTGCGCAGGGTTTGGGTGTAGAACCCCTGAATGTTGAATTTATGCTGGCTGTCTGGCTGGAACTGGTAGCCCAGGCTCGCCAGCTTGCGACGACCCCAGAAGCGGTCATACGGGCGGGTGGATTGCCAGCGATCGGCGTCGTAATCCGCGCGAGACAGGCCACCGGGCATGTCGGCTTCACCGTCGTAATATTGCAGCAGGCTGTTGAAGGTGTGCACCTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTcgcg > 1:390162/1‑289 (MQ=255) gCCGCTGCGCAGGGTTTGGGTGTAGAACCCCTGAATGTTGAATTTATGCTGGCTGTCTGGCTGGAACTGGTAGCCCAGGCTCGCCAGCTTGCGACGACCCCAGAAGCGGTCATACGGGCGGGTGGATTGCCAGCGATCGGCGTCGTAATCCGCGCGAGACAGGCCACCGGGCATGTCGGCTTCACCGTCGTAATATTGCAGCAGGCTGTTGAAGGTGTGCACCTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTTCTCGCGCCAg > 1:1152050/1‑289 (MQ=255) ccGCTGCGCAGGGTTTGGGTGTAGAACCCCTGAATGTTGAATTTATGCTGGCTGTCTGGCTGGAACTGGTAGCCCAGGCTCGCCAGCTTGCGACGACCCCAGAAGCGGTCATACGGGCGGGTGGATTGCCAGCGATCGGCGTCGTAATCCGCGCGAGACAGGCCACCGGGCATGTCGGCTTCACCGTCGTAATATTGCAGCAGGCTGTTGAAGGTGTGCACCTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGt > 1:300242/1‑289 (MQ=255) ccGCTGCGCAGGGTTTGGGTGTAGAACCCCTGAATGTTGAATTTATGCTGGCTGTCTGGCTGGAACTGGTAGCCCAGGCTCGCCAGCTTGCGACGACCCCAGAAGCGGTCATACGGGCGGGTGGATTGCCAGCGATCGGCGTCGTAATCCGCGCGAGACAGGCCACCGGGCATGTCGGCTTCACCGTCGTAATATTGCAGCAGGCTGTTGAAGGTGTGCACCTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGt > 1:725801/1‑289 (MQ=255) ccGCTGCGCAGGGTTTGGGTGTAGAACCCCTGAATGTTGAATTTATGCTGGCTGTCTGGCTGGAACTGGTAGCCCAGGCTCGCCAGCTTGCGACGACCCCAGAAGCGGTCATACGGGCGGGTGGATTGCCAGCGATCGGCGTCGTAATCCGCGCGAGACAGGCCACCGGGCATGTCGGCTTCACCGTCGTAATATTGCAGCAGGCTGTTGAAGGTGTGCACCTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGt > 1:1003455/1‑289 (MQ=255) cGCTGCGCAGGGTTTGGGTGTAGAACCCCTGAATGTTGAATTTATGCTGGCTGTCTGGCTGGAACTGGTAGCCCAGGCTCGCCAGCTTGCGACGACCCCAGAAGCGGTCATACGGGCGGGTGGATTGCCAGCGATCGGCGTCGTAATCCGCGCGAGACAGGCCACCGGGCATGTCGGCTTCACCGTCGTAATATTGCAGCAGGCTGTTGAAGGTGTGCACCTCATCCGGCGCATCTTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTc > 2:289060/1‑289 (MQ=255) cgcAGGGTTTGGGTGTAGAACCCCTGAATGTTGAATTTATGCTGGCTGTCTGGCTGGAACTGGTAGCCCAGGCTCGCCAGCTTGCGACGACCCCAGAAGCGGTCATACGGGCGGGTGGATTGCCAGCGATCGGCGTCGTAATCCGCGCGAGACAGGCCACCGGGCATGTCGGCTTCCCCGTCGTAATATTGCAGCAGGCTGTTGAAGGTGTGCACCTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCCGCATCAGGTCGTCGACGCGGGTCGCGCCGTCCTCGCCGCAGTCACTGc > 2:923912/1‑289 (MQ=255) gggTTTGGGTGTAGAACCCCTGAATGTTGAATTTATGCTGGCTGTCTGGCTGGACCTGGTAGCCCAGGCTCGCCAGCTTGCGACGACCCCAGAAGCGGTCATACGGGCGGGTGGATTGCCAGCGATCGGCGTCGTAATCCGCGCGAGACAGGCCACCGGGCATGTCGGCTTCACCGTCGTAATATTGCAGCAGGCTGTTGAAGGTGTGCACCTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCcgcg < 1:835845/289‑1 (MQ=255) gggTTTGGGTGTAGAACCCCTGAATGTTGAATTTATGCTGGCTGTCTGGCTGGAACTGGTAGCCCAGGCTCGCCAGCTTGCGACGACCCCAGAAGCGGTCATACGGGCGGGTGGATTGCCAGCGATCGGCGTCGTAATCCGCGCGAGACAGGCCACCGGGCATGTCGGCTTCACCGTCGTAATATTGCAGCAGGCTGTTGAAGGTGTGCACCTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCcgcg < 1:669801/289‑1 (MQ=255) gagTTTGGGTGTAGAACCCCTGAATGTTGAATTGATGCTGGCTGTCTGGCTGGAACTGGTAGCCCAGGCTCGCCAGCTTGCGACGACCCCAGAAGCGGTCATACGGGCGGGTGGATTGCCAGCGATCGGCGTCGTAATCCGCGCGAGACAGGCCACCGGGCATGTCGGCTTCACCGTCGTAATATTGCAGCAGGCTGTTGAAGGTGTGCACCTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCcgcg < 1:359088/287‑1 (MQ=255) gggTGTAGAGCCCCTGAATGTTGAATTTATGCTGGCTGTCTGGCTGGAACTGGTAGCCCAGGCTCGCCAGCTTGCGACGACCCCAGAAGCGGTCATACGGGCGGGTGGATTGCCAGCGATCGGCGTCGTAATCCGCGCGAGACAGGCCACCGGGCATGTCGGCTTCACCGTCGTAATATTGCAGCAGGCTGTTGAAGGTGTGCACCTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGc < 2:367030/288‑1 (MQ=255) 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tAGAACCCCTGAATGTTGAATTTATGCTGGCTGTCTGGCTGGAACTGGTAGCCCAGGCTCGCCAGCTTGCGACGACCCCAGAAGCGGTCATACGGGCGGGTGGATTGCCAGCGATCGGCGTCGTAATCCGCGCGAGACAGGCCACCGGGCATGTCGGCTTCACAGTCGTAATATTGCAGCAGGCTGGTGAAGGTGTGGACCTCATCCGGCCCATATTTGCTTTTCAGCATAAGGGCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTGGCGCCAGTCACTTCCGCCGGTGCGCGAGt > 2:414265/1‑289 (MQ=255) cccTGAATGTTGAATTTATGCTGGCTGTCTGGCTGGAACTGGTAGCCCAGGCTCGCCAGCTTGCGACGACCCCAGAAGCGGTCATACGGGCGGGTGGATTGCCAGCGATCGGCGTCGTAATCCGCGCGAGACAGGCCACCGGGCATGTCGGCTTCACCGTCGTAATATTGCAGCAGGCTGTTGAAGGTGTGCACCTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTTCCCGCGCCCGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTagag > 2:346387/1‑287 (MQ=255) cccTGAATGTTGAATTTATGCTGGCTGTCTGGCTGGAACTGGTAGCCCAGGCTCGCCAGCTTGCGACGACCCCAGAAGCGGTCATACGGGCGGGTGGATTGCCAGCGACCGGCGTCGTAATCCGCGCGAGACAGGCCACCGGGCATGTCGGCTTCACCGTCGTAATATTGCAGCAGGCCGTTGACGGTGTGCACCTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCACCATCAGGTCGTTGACGCGGGTGGCCCCGTGCTCGCGCCAGTCACTCCCGCGCCACCCGGAGTCGagcc > 2:511723/1‑288 (MQ=255) 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ggctgTCTGGCTGGAACTGGTAGCCCAGGCTCGCCAGCTTGCGACGACCCCAGAAGCGGTCATACGGGCGGGTGGATTGCCAGCGATCGGCGTCGTAATCCGCGCGAGACAGGCCACCGGGCATGTCGGCTTCACCGTCGTAATATTGCAGCAGGCTGTTGAAGGTGTGCACCTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTc > 1:876407/1‑289 (MQ=255) ggctgTCTGGCTGGAACTGGTAGCCCAGGCTCGCCAGCTTGCGACGACCCCAGAAGCGGTCATACGGGCGGGTGGATTGCCAGCGATCGGCGTCGTAATCCGCGCGAGACAGGCCACCGGGCATGTCGGCTTCACCGTCGTAATATTGCAGCAGGCTGTTGAAGGTGTGCACCTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGCGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTc > 1:753792/1‑289 (MQ=255) ggctggAACGGGTAGCCCAGGCCGGCCAGCTTGGGACGACCCCAGAGGCGGTGATACGGGCGGGTGGCTTGCCAGCGATCGGCGTCGGAATCGGCGCGAGAAAGGCCACCGGGCATGTCGGCTTCACCGTCGTAATATTGCAGCAGGCTGTTGAAGGTGTGCACCTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCtgtg < 2:462788/288‑1 (MQ=255) 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ggTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGcc < 1:1199571/289‑1 (MQ=255) gtcgtcGAGGCGGGTGGCGCTGTGCTCGGGCCAGTCACTGCGCGGCGTGCCGGCGGAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCg < 2:25896/289‑1 (MQ=255) tcgATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGc > 1:975642/1‑288 (MQ=255) tcgATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGc > 1:760842/1‑288 (MQ=255) gtgtCGCTGTGCCCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAg < 1:680187/289‑1 (MQ=255) gcgcTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGc > 1:227316/1‑287 (MQ=255) | GGTAGCCGCTGCGCAGGGTTTGGGTGTAGAACCCCTGAATGTTGAATTTATGCTGGCTGTCTGGCTGGAACTGGTAGCCCAGGCTCGCCAGCTTGCGACGACCCCAGAAGCGGTCATACGGGCGGGTGGATTGCCAGCGATCGGCGTCGTAATCCGCGCGAGACAGGCCACCGGGCATGTCGGCTTCACCGTCGTAATATTGCAGCAGGCTGTTGAAGGTGTGCACCTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCCACGCCCGCCTCGATACCAAAGTCCTGCGGAATGGCACGGGTAACAAAGTTCACCACGCCGCCCACGCTCTGCGGTCCGTAACGCACCGCACCACCACCGCGTACCACGTCAATGGCATCCATGTTGCCGAGCGAAACGGGAGC > NC_000913/4515474‑4516035 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |