| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 3037292 = | 155 (1.120) | 3 (0.020) | 3/534 | NT | 2.2% | coding (815/1734 nt) | recJ | ssDNA exonuclease, 5' ‑‑> 3'‑specific |
| ? | NC_000913 | 3037622 = | 119 (0.880) | coding (485/1734 nt) | recJ | ssDNA exonuclease, 5' ‑‑> 3'‑specific | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
GGCTCGGATGCGACTCATCCCCTGCCAGGTCAGAATGCGATTATTAGCGTCCAGCGGCACGACGTCCGCCACTGTCCCCAGCGCGACCAGATCCAGCAGTTCTGCCAGGTTAGGAATTGCGATGTTACGCTCATCAAACCAGCCCTGATCGCGCAAAAAGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGCCTGATCGACCACTTCCGGGCTTAAGCCGTAACCGTCTTCGAAACGGTTTGGTACCAGGTAGTCGATATTGCTGCAACCAAGCGAGCGCATCGCCAGCACGCTTAGAGCCGTGCTGGTCGCGCCGTCGGCGTCGAAATCACCGACCACAATAATCCGCGTTCCTTCGCGAAAAGCGT > NC_000913/3037336‑3037910 | gggtCGGATGCGACTCATCCCCGGCGAGGTCAGAAGGCGATGGTTAGGGTCCAGGGGCACGACGTCCGCCACTGTCCCCAGCGCGACCAGAGCCAGCAGTTCTGCCAGGTTAGGAATGGCGATGTTACGCTCATCAAACCAGCCCTGATCGCGCAAAAAGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGGCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATgg < 2:843609/286‑1 (MQ=255) cTCGGATGCGACTCATCCCCTGCCAGGTCAGAATGCGATTATTAGCGTCCAGCGGCACGACGTCCGCCACTGTCCCCAGCGCGACCAGATCCAGCAGTTCTGCCAGGTTAGGAATTGCGATGTTACGCTCATCAAACCAGCCCTGATCGCGCAAAAAGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAACACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGCTTAATGATCGCTTCCGCTGAGGGTAATGTCTAGCCCGGCAAATgctc > 2:1115820/1‑286 (MQ=255) cTCGGATGCGACTCATCCCCTGCCAGGTCAGAATGCGATTATTAGCGTCCAGCGGCACGACGTCCGCCACTGTCCCCAGCGCGACCAGATCCAGCAGTTCTGCCAGGTTAGGAATTGCGATGTTACGCTCATCAAACCAGCCCTGATCGCGCAAAAAGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTg < 2:1006895/289‑1 (MQ=255) aTGCGACTCATCCCCTGCCAGGTCAGAATGCGATTATTAGCGTCCAGCGGCACGACGTCCGCCACTGTCCCCAGCGCGACCAGATCCAGCAGTTCTGCCAGGTTAGGAATTGCGATGTTACGCCCATCAAACCAGCCCTGATCGCGCCAAACGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGCTAAACCGCCACACCCACGCCTGCCAGTGACTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCACGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGCACTGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCgg > 2:1072490/1‑289 (MQ=255) 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aGGTCAGAATGCTATTATTAGCGTCAAGCGGCACGACGTCCGCCACTGTCCCCAGCGCGACCAGATCCAGCAGTTCTGCCAGGTTAGGAATTGCGATGTTACGCTCATCAAACCAGCCCTGATCGCGCAAAAAGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGcc < 1:1096075/289‑1 (MQ=255) cAGAATGCGATTATTAGCGTCCAGCGGCACGACGTCCGCCACTGTCCCCAGCGCGACCAGATCCAGCAGTTCTGCCAGGTTAGGAATTGCGATGTTACGCTCATCAAACCAGCCCTGATCGCGCAAAAAGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAAc > 1:166032/1‑289 (MQ=255) cGATTAGTAGCGTCCAGCGGCACGACGTCCGCCACTGTCCCCAGCGCGACCAGATCCAGCAGTTCTGCCAGGTTAGGAATTGCGATGTTACGCTCATCAAACCAGCCCTGATCGCGCAAAAAGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAAcgagcgag < 1:1029641/289‑1 (MQ=255) 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cGCCACTGTCCCCAGCGCGACCAGATCCAGCAGTTCTGCCAGGTTAGGAATTGCGATGTTACGCTCATCAAACCAGCCCTGATCGCGCAAAAAGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGaaa < 2:153297/287‑1 (MQ=255) cACTGTCCCCAGCGCGACCAGATCCAGCAGTTCTGCCAGGTTAGGAATTGCGATGTTACGCTCATCAAACCAGCCCTGATCGCGCAAAAAGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCg < 1:321687/289‑1 (MQ=255) aGCGCTTCCAGATCCAGCAGTTCGGCCAGGTTAGGAATTTCGATGTTACGCTCATCAAACCAACCCTGATCGCGCAAAAGGCTGCGCTGGGCCAGGAACAGATAGAACGCCACACCCACGCCGGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAAGGGTCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCg < 2:105126/289‑1 (MQ=255) 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gcaaaTGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGCCTGATCGACCACTTCCGGGCTTAAGCCGTAACCGTCTTCGAAACGGTTTGGTACCAGGTAGTCGATATTGCTGCAACCAAGCGAGCGCATCGCCAGCACGCCTAGAGCCGTGCTGGTCGCGCCGTCGGCGTCGAAATCACCGACCACAATAATCCGCGTTCCTTCGCGaa > 2:881265‑M2/6‑288 (MQ=255) aaaTGGTCATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACAAGCTAGCGTGCTCACCCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAGCTGCGCGCCACGGGCATGGGCCTGATCGACCACTTCCGGGCTTAAGCCGTAACCGTCTTCGAAACGGTTTGGTACCAGGTAGTCGATATTGCTGCAACCAAGCGAGCGCATCGCCAGCACGCTTAGAGCCGTGCTGGTCGCGCCGTCGGCGTCGAAATCACCGACCACAATAATCCGCGTTCCTTCGCGAAAAg < 2:1097059‑M2/286‑1 (MQ=255) tGGTGCTCGGTAACAATAACCTGAATGCCCAACGGGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGCCTGATCGACCACTTCCGGGCTTAAGCCGTAACCGTCTTCGAAACGGTTTGGTACCAGGTAGTCGATATTGCTGCAACCAAGCGAGCGCATCGCCAGCACGCTTAGAGCCGTGCTGGTCGCGCCGTCGGCGTCGAAATCACCGACCACAATAATCCGCGTTCCTTCGCGGAAAGCGt < 1:748898/289‑1 (MQ=255) | GGCTCGGATGCGACTCATCCCCTGCCAGGTCAGAATGCGATTATTAGCGTCCAGCGGCACGACGTCCGCCACTGTCCCCAGCGCGACCAGATCCAGCAGTTCTGCCAGGTTAGGAATTGCGATGTTACGCTCATCAAACCAGCCCTGATCGCGCAAAAAGGTGCGCAGCGCCAGCATCAGATAAAACGCCACACCCACGCCTGCCAGTGATTTCGACGGGAAATTACAGTCGCGCAAGTTAGGGTTAATGATCGCTTCCGCTGCGGGTAATGTGTCGCCTGGCAAATGGTGATCGGTAACAATAACCGGGATGCCCAACGAGCGAGCGTGCTCAACCCCCGCATGGGAGGAAATACCGTTATCCACCGTGACAATTAACTGCGCGCCACGGGCATGGGCCTGATCGACCACTTCCGGGCTTAAGCCGTAACCGTCTTCGAAACGGTTTGGTACCAGGTAGTCGATATTGCTGCAACCAAGCGAGCGCATCGCCAGCACGCTTAGAGCCGTGCTGGTCGCGCCGTCGGCGTCGAAATCACCGACCACAATAATCCGCGTTCCTTCGCGAAAAGCGT > NC_000913/3037336‑3037910 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |