| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 262,894 | 0 | G | A | 6.9% | 322.3 / 11.0 | 98 | noncoding (24/76 nt) | thrW | tRNA‑Thr |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (43/48); new base A (3/4); total (46/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.35e-01 | |||||||||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
AAGCACACAAAAACTCCACGCGCGTG‑GCCCAATGGGGCTGGAAGCACTGACCACT‑TACAAGTGGATCGGCATTGGTGATTACACCATTCGTGCGTAAATAAAACCGGGTGATGCAAAAGTAGCCATTTGATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAATTGTTACGTAAGATCTTATCATTCTCCCACCAAAAAATTATCTTAATGTAACAGCTGGTGTAAGTAAATTCTATCAACGAAGATCAATCTTATCTACTGACCAAAAAGGCCTGATAGGGCTTCGCTCACTATACATCCTTGGCTGCAGGTTTAGTTGTACACCACT > NC_000913/262660‑263123 | aaGCACACAAAAACTCCACGCGCGTG‑GCCCAATGGGGCTGGAAGCACTGACCACT‑TACAAGTGGATCGGCATTGGTGATTACACCATTCGTGCGTAAATAAAACCGGGTGATGCAAAAGTAGCCATTTGATTCACAAGGCCATTGACGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGGCCGATATAGCTCAGTTGGTAGagcag < 1:734858/238‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |