| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,292,991 | +T :: IS1 (–) +7 bp | intergenic (‑69/‑530) | hns ← / → tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 19795 = | NA (NA) | 117 (0.890) | 84/192 | 0.2 | 100% | intergenic (+175/+16) | nhaR/insB1 | transcriptional activator of nhaA/IS1 transposase B |
| ? | NC_000913 | = 1292997 | 0 (0.000) | intergenic (‑75/‑530) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 291401 | NA (NA) | 105 (0.780) | 71/196 | 0.8 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1292991 = | 0 (0.000) | intergenic (‑69/‑536) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase | |||||
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
TTGCCCGCTTGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCC > NC_000913/19697‑19893 | agaattttaagtgcttcgctcattgtagtaatctcaaacttatattggggtggtttgttgaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagct < 1:1411345‑M1/1‑1 (MQ=255) tGCCCGCTTGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTg < 1:2821806/99‑1 (MQ=255) gCCCGCTTGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTgg < 2:1920538/99‑1 (MQ=255) aattttaagtgcttcgctcattgtagtaatctcaaacttatattggggtggtttgttgaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTgg > 1:1965962‑M1/97‑99 (MQ=255) ccGCTTGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTCCTTCCTTCCTGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTa > 2:1934282/1‑99 (MQ=255) ccGCTTGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTa > 1:169291/1‑99 (MQ=255) tttaagtgcttcgctcattgtagtaatctcaaacttatattggggtggtttgttgaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTaa < 1:973933‑M1/6‑1 (MQ=255) cGCTTGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTaa < 2:1410811/99‑1 (MQ=255) cGCTTGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTaa < 2:1586951/99‑1 (MQ=255) ttaagtgcttcgctcattgtagtaatctcaaacttatattggggtggtttgttgaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAAt < 2:2519019‑M1/7‑1 (MQ=255) ttGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGa < 2:552443/99‑1 (MQ=255) ttGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGa < 2:2218999/99‑1 (MQ=255) ttGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGa < 2:481444/99‑1 (MQ=255) aagtgcttcgctcattgtagtaatctcaaacttatattggggtggtttgttgaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGa > 2:2183353‑M1/91‑99 (MQ=255) aagtgcttcgctcantgtagtaatctcaaacttatattggggnggtttgttgaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGa < 2:64006‑M1/9‑1 (MQ=255) gtgcttcgctccttgtagtaatctcaaacgtatattggggtggtttgctgaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACt < 2:412259‑M1/11‑1 (MQ=255) gcttcgctcattgtagtaatctcaaacttatattggggtggtttgttgaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTcc > 2:1856062‑M1/87‑99 (MQ=255) cttcgctcattgtagtaatctcaaacttatattggggtggtttgttgaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCa < 1:2396556‑M1/14‑1 (MQ=255) cATTGTTTCCATGTGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGTCTACaa < 2:1685642/99‑1 (MQ=255) ttGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACt > 1:3126182/1‑99 (MQ=255) ttGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACt > 2:2123082/1‑99 (MQ=255) tGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACtt > 2:201007/1‑99 (MQ=255) ctcattgtagtaatctcaaacttatattggggtggtttgttgaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTa > 1:2920765‑M1/81‑99 (MQ=255) tttCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTAt < 2:1320045/99‑1 (MQ=255) ttCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTAtt < 1:2123856/99‑1 (MQ=255) tCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCATTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTg > 1:452046/1‑99 (MQ=255) attgtagtaatctcaaacttatattggggtggtttgttgaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTg < 1:2144215‑M1/22‑1 (MQ=255) attgtagtaatctcaaacttatattggggtggtttgttgaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTg < 1:1866211‑M1/22‑1 (MQ=255) ttgtagtaatctcaaacttatattggggtggtttgttgaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTCTTGa < 1:495668‑M1/23‑1 (MQ=255) ttgtagtaatctcaaacttatattggggtggtttgttgaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGa < 1:630728‑M1/23‑1 (MQ=255) ccATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGa < 2:2379130/99‑1 (MQ=255) gtagtaatctcaaacttatattggggtggtttgttgaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATa > 1:2723562‑M1/75‑99 (MQ=255) atatGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATa < 1:2441329/99‑1 (MQ=255) tagtaatctcaaacttatattggggtggtttgttgaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAg < 1:2573346‑M1/26‑1 (MQ=255) tagtaatctcaaacttatattggggtggtttgttgaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAg < 2:1763367‑M1/26‑1 (MQ=255) tACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGtt > 2:2993003/1‑99 (MQ=255) atctcaaacttatattggggtggtttgttgaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGttt < 1:1799248‑M1/31‑1 (MQ=255) ctcaaacttatattggggtggtttgttgaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTa > 1:2267005‑M1/67‑99 (MQ=255) tcaaacttatattggggtggtttgttgaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCACCTTATTGATAGTGTTTTAt > 2:333463‑M1/66‑99 (MQ=255) gggCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATg < 1:671260/99‑1 (MQ=255) gCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGtt > 2:2949238/1‑99 (MQ=255) cGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTc < 2:3091687/99‑1 (MQ=255) acttatattggggtggtttgttgaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTc < 1:2032331‑M1/38‑1 (MQ=255) acttatattggggtggtttgttgaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTc > 2:436303‑M1/62‑99 (MQ=255) gAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCa < 1:153570/99‑1 (MQ=255) gAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCa > 2:453514/1‑99 (MQ=255) ttatattggggtggtttgttgaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAg < 2:3250118‑M1/40‑1 (MQ=255) aataaataGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAg < 1:2016964/99‑1 (MQ=255) atattggggtggtttgttgaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAt > 1:2681398‑M1/58‑99 (MQ=255) attggggtggtttgttgaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATaa < 1:133312‑M1/44‑1 (MQ=255) ggggtggtttgttgaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGc > 2:3319056‑M1/53‑99 (MQ=255) ggggtggtttgttgaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGc > 1:3222387‑M1/53‑99 (MQ=255) agagGAACCTGATCACTGCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAAAGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGc > 2:2359662/1‑99 (MQ=25) agGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGccc > 1:874418/1‑99 (MQ=255) tggtttgttgaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGa > 2:563138‑M1/49‑99 (MQ=255) gAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGa > 1:1458276/1‑99 (MQ=255) ggtttgttgaggtgataatagagcgttaaatgcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAt > 2:2682411‑M1/48‑99 (MQ=255) aaTCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAt < 1:2183603/99‑1 (MQ=255) tCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGa < 1:1744050/99‑1 (MQ=255) tgttgaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACt > 1:2221077‑M1/44‑99 (MQ=255) aTTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGGCTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATGATGCCCGATGACttt > 2:3157186/1‑99 (MQ=255) aTTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACttt > 2:301421/1‑99 (MQ=255) aTTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACttt < 2:1136478/99‑1 (MQ=255) tgaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTg > 2:816670‑M1/41‑99 (MQ=255) gaggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGt < 2:1833246‑M1/60‑1 (MQ=255) aggtaataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTc < 1:466246‑M1/61‑1 (MQ=255) ttccttcATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAt > 2:2077499/1‑99 (MQ=255) taataatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATg < 1:2651921‑M1/64‑1 (MQ=255) ttcATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAg > 2:951668/1‑99 (MQ=255) aatagagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGc > 1:1360259‑M1/32‑99 (MQ=255) aTGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAAGGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCACCTc < 2:2889683/99‑1 (MQ=255) gagccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCa < 1:714445‑M1/72‑1 (MQ=255) agccttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAc < 1:427464‑M1/73‑1 (MQ=255) gATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCg > 2:2308507/1‑99 (MQ=255) ttaaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAt < 1:2313272‑M1/77‑1 (MQ=255) taaattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAtt < 1:29557‑M1/78‑1 (MQ=255) tGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAtttt < 1:3289968/99‑1 (MQ=255) tGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAtttt > 1:2876501/1‑99 (MQ=255) tGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAtttt > 2:306241/1‑99 (MQ=255) aattcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCTCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAtttt > 1:3278998‑M1/20‑99 (MQ=255) gAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACGCCAACTTCGTGAGAGTGATTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTCTGTCATGCAGCTCCCACGCTTTTg > 2:1259597/1‑99 (MQ=17) ttcagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTga < 1:346512‑M1/82‑1 (MQ=255) aaaaGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTga > 2:1487565/1‑99 (MQ=255) cagttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTgaga > 2:2297116‑M1/16‑99 (MQ=255) agagTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGaa < 1:1122688/99‑1 (MQ=255) gttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCAGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAAc < 2:3113336‑M1/86‑1 (MQ=255) gagTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAAc < 2:374083/99‑1 (MQ=255) ttgtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACg < 1:996511‑M1/87‑1 (MQ=255) tagtaATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGAc > 2:2813549/1‑99 (MQ=255) gtgcaatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGAc < 2:1505222‑M1/89‑1 (MQ=255) taATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATTTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGc < 2:2250804/99‑1 (MQ=255) taATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCCATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGc < 2:2446692/99‑1 (MQ=255) caatagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGc < 2:2581569‑M1/92‑1 (MQ=255) aaTTGCTGGTAATGACTCCAACTTATGGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCg < 1:251519/99‑1 (MQ=255) atagcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATGGTGCCTGATGTTCAGATAATGCCTGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGTTTTTGAGAACGACAGCGa < 2:516620‑M1/94‑1 (MQ=255) gcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTGCACCGATTTTGAGATCGACAGCGACtt > 1:3058612‑M1/3‑99 (MQ=255) gcTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACtt > 1:1015396‑M1/3‑99 (MQ=255) cTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTc < 2:1086376‑M1/98‑1 (MQ=255) cTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTc < 1:3479633‑M1/98‑1 (MQ=255) tGGTAATGCCTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTcc < 2:2427190/99‑1 (MQ=14) | TTGCCCGCTTGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCC > NC_000913/19697‑19893 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |