New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 419210 = | 126 (0.940) | 22 (0.180) | 16/178 | 9.4 | 16.1% | intergenic (+26/‑381) | phoR/brnQ | sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with PhoB/branched‑chain amino acid transport system 2 carrier protein; LIV‑II transport system for Ile, Leu, and Val |
? | NC_000913 | 419234 = | 115 (0.940) | intergenic (+50/‑357) | phoR/brnQ | sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with PhoB/branched‑chain amino acid transport system 2 carrier protein; LIV‑II transport system for Ile, Leu, and Val | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
TTCAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGCCATGTCTTTTTCACGGAAATAGTGTTTTAT > NC_000913/419137‑419332 | ttCAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAATCAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTAttt > 2:1630634/1‑99 (MQ=255) tCAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTAtttt > 2:1148837/1‑99 (MQ=255) cAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTc > 1:1522942/1‑99 (MQ=255) aGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCt < 2:1903941/99‑1 (MQ=255) gTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCtt < 2:1807364/99‑1 (MQ=255) gTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCtt < 2:2725235/99‑1 (MQ=255) gTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAg > 1:1329921/1‑99 (MQ=255) gTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAg > 2:2067889/1‑99 (MQ=255) tATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTc > 2:1751986/1‑99 (MQ=255) aTCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCa > 1:193194/1‑99 (MQ=255) aTCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCa < 2:2335098/99‑1 (MQ=255) tCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCaa > 1:1376235/1‑99 (MQ=255) cccGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCaaa < 1:396983/99‑1 (MQ=255) ccGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCaaaa < 1:2346608/99‑1 (MQ=255) ccGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCaaaa > 2:1946371/1‑99 (MQ=255) ccGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCaaaa > 1:932409/1‑99 (MQ=255) cGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGACTTATTTTCTTTGCAGTCAAAAt > 2:1239275/1‑99 (MQ=255) cGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTGTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCGTTGCAGTCAAAAt > 1:3137771/1‑99 (MQ=255) ggAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATa < 1:916386/99‑1 (MQ=255) ggAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATa < 1:244144/99‑1 (MQ=255) aCGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACgg < 2:782473/99‑1 (MQ=255) cGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACggg > 1:928321/1‑99 (MQ=255) cGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACggg < 1:1079259/99‑1 (MQ=255) gTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGc < 1:406090/99‑1 (MQ=255) tttAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCg > 2:1640078/1‑99 (MQ=255) tttAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCg > 2:318634/1‑99 (MQ=255) ttAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGt > 2:3198459/1‑99 (MQ=255) aaTTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTa > 2:1985311/1‑99 (MQ=255) aTTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAg > 2:2864158/1‑99 (MQ=255) tGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGAt < 1:1042625/99‑1 (MQ=255) gCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGAtt < 1:1546731/99‑1 (MQ=255) ccAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGAttt > 1:636689/1‑99 (MQ=255) cAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGAtttt > 2:2527781/1‑99 (MQ=255) cAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GCCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTAGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGAtttt > 2:977467/1‑99 (MQ=255) aaaaaCAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTa > 1:2178658/1‑99 (MQ=255) aaaaaCAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTa > 1:1844055/1‑99 (MQ=255) aaaaCAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTAc > 1:1154397/1‑99 (MQ=255) aaCAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACaa > 1:2741696/1‑99 (MQ=255) aaCAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACaa < 1:618336/99‑1 (MQ=255) aGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGa < 2:804452/99‑1 (MQ=255) gCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGAt < 2:1104873/99‑1 (MQ=255) gCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGAt < 2:363944/99‑1 (MQ=255) cGATTGATCCGCCTTTGGTAATC‑TTTATTTCCATAAGCCAGTGGATGCTCGCTTATTTTCATATCAGTCAAAATACGGGCGATAGCTTTTACAACgttc > 2:1895970/1‑96 (MQ=255) gATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTg < 1:2905844/99‑1 (MQ=255) aTTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTgg < 1:52256/99‑1 (MQ=255) aTTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTgg < 2:2091794/99‑1 (MQ=255) ttAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGt < 1:2579071/99‑1 (MQ=255) aaTCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGa < 1:649982/99‑1 (MQ=255) aTCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGAt < 2:1447271/99‑1 (MQ=255) cGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGAtttt > 1:2544585/1‑99 (MQ=255) gCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGAttttt > 2:487508/1‑99 (MQ=255) ccTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGAtttttt < 2:3029079/99‑1 (MQ=255) ccTTT‑GTCATCTTTGATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGAtttttt < 1:860271/99‑1 (MQ=255) tt‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGtt < 1:1105081/99‑1 (MQ=255) tCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGc > 2:2638239/1‑99 (MQ=255) tCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGc < 1:1854968/99‑1 (MQ=255) cATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCa < 1:1997165/99‑1 (MQ=255) aTCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCATTCAAAATACTGCCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCAt < 2:64934/99‑1 (MQ=255) aTCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCAt < 1:3081725/99‑1 (MQ=255) aTCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCAt > 2:34982/1‑99 (MQ=255) aTCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCAt < 2:1351894/99‑1 (MQ=255) tCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATg > 1:3376738/1‑99 (MQ=255) tCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATg > 1:2453026/1‑99 (MQ=255) cTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGa > 1:3475226/1‑99 (MQ=255) cTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGa > 1:2148657/1‑99 (MQ=255) ttttATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGac > 1:260990/1‑98 (MQ=255) ttttATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGAt > 2:1177625/1‑99 (MQ=255) ttttATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGAt > 1:54948/1‑99 (MQ=255) aTTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGc < 2:1026169/99‑1 (MQ=255) aTTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGc < 2:3223171/99‑1 (MQ=255) ttGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGcc > 1:2714128/1‑99 (MQ=255) tGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGCCa > 1:1234198/1‑99 (MQ=255) ccATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGCCATg > 1:1021279/1‑99 (MQ=255) ccATAAGCCAGTCGATGCCGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGCCATg > 1:2965813/1‑99 (MQ=255) 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(MQ=255) gTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGCCATGTCTTTTTCAc < 2:1210086/99‑1 (MQ=255) cGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGCCATGTCTTTTTCACgg < 1:100645/99‑1 (MQ=255) cGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGCCATGTCTTTTTCACgg < 2:1228865/99‑1 (MQ=255) gATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGCCATGTCTTTTTCACGGa < 2:128101/99‑1 (MQ=255) gtGCTGGCTGATTTTCTTTGCAGTCAATATTCGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCGTGATGAGCCATGTCTTTTTCACGGaa < 2:653530/98‑1 (MQ=255) aTGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGCCTTGTCTTTTTCACGGaa > 2:458833/1‑99 (MQ=255) tGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGCCATGTCTTTTTCACGGaaa < 2:2810729/99‑1 (MQ=255) gCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGCCATGTCTTTTTCACGGAAAt < 1:958651/99‑1 (MQ=255) gCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGCCATGTCTTTTTCACGGAAAt > 2:1564265/1‑99 (MQ=255) cTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGCCATGTCTTTTTCACGGAAATa > 1:2245645/1‑99 (MQ=255) cTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGCCATGTCTTTTTCACGGAAATa < 1:1322714/99‑1 (MQ=255) tGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGCCATGTCTTTTTCACGGAAATAg < 1:2625568/99‑1 (MQ=255) cTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGCCATGTCTTTTTCACGGAAATAgtgt > 1:2461331/1‑99 (MQ=255) cTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGCCATGTCTTTTTCACGGAAATAgtgt < 1:1254063/99‑1 (MQ=255) ttATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGCCATGTCTTTTTCACGGAAATAGTGtt > 2:1420802/1‑99 (MQ=255) tATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGCCATGTCTTTTTCACGGAAATAGTGttt < 1:1586905/99‑1 (MQ=255) aTTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGCCATGTCTTTTTCACGGAAATAGTGtttt < 2:2334350/99‑1 (MQ=255) ttttCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGCCATGTCTTTTTCACGGAAATAGTGTTTta < 1:3015282/99‑1 (MQ=255) | TTCAGTTTTGTTATCCCGGAACGTTTAATTGCCAAAAACAGCGATTAATCCGCCTTT‑GTCATCTTTTATTGCCATAAGCCAGTCGATGCTGGCTTATTTTCTTTGCAGTCAAAATACGGGCGTTAGATTTTACAACGATTGGTGATTTTTTGTTCGCATGATTAGCCATGTCTTTTTCACGGAAATAGTGTTTTAT > NC_000913/419137‑419332 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |