Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 1,879,829 | Δ1 bp :: IS186 (+) +6 bp :: Δ1 bp | coding (115‑120/360 nt) | yeaR ← | DUF1971 family protein, nitrate‑inducible |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 1879829 = | 2 (0.020) | 138 (1.050) | 90/192 | 0.1 | 98.5% | coding (120/360 nt) | yeaR | DUF1971 family protein, nitrate‑inducible |
? | NC_000913 | = 2515616 | NA (NA) | noncoding (1344/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
* | ? | NC_000913 | = 1879834 | 2 (0.020) | 86 (0.660) | 65/190 | 1.1 | 97.6% | coding (115/360 nt) | yeaR | DUF1971 family protein, nitrate‑inducible |
? | NC_000913 | 2514274 = | NA (NA) | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region |
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
CTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCC > NC_000913/2514176‑2514370 | cTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTc > 2:2265124/1‑99 (MQ=255) gAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTccc < 2:2358016/99‑1 (MQ=255) aaGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACCTAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCa > 1:894417/1‑99 (MQ=255) aaGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCa > 2:2707111/1‑99 (MQ=255) aGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCAt < 1:1454790/99‑1 (MQ=255) gCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATa > 1:726133/1‑99 (MQ=255) 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(MQ=255) cGGCTATACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCCTACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAAc > 1:2031935/1‑99 (MQ=255) ggCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACt > 1:550597/1‑99 (MQ=255) tctACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTaa < 2:1362476/99‑1 (MQ=255) tctACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTaa < 2:553177/99‑1 (MQ=255) tctACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATCCCCATAAGCGCTAACTTaa > 2:3056262/1‑99 (MQ=255) tctACCCGGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACGGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTaa < 2:105738/99‑1 (MQ=255) ctACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAg < 2:1524117/99‑1 (MQ=255) ctACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAg < 2:1829201/99‑1 (MQ=255) ctACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAg > 1:115245/1‑99 (MQ=255) aCCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAggg < 1:1685060/99‑1 (MQ=255) cccTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGt > 2:1745647/1‑99 (MQ=255) ccTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGtt < 1:2933780/99‑1 (MQ=255) ccTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGtt > 1:298106/1‑99 (MQ=255) cTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTtg < 2:1195773/99‑1 (MQ=255) ggTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGAACATAAAAAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTtgtg < 2:1206345/99‑1 (MQ=255) ggTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGAACAAAAATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTtgtg < 2:3101532/99‑1 (MQ=255) aGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTAt < 1:1046203/99‑1 (MQ=255) tgtgCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTAtca > 1:430621/1‑97 (MQ=255) tgtgCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTa > 1:2182452/1‑99 (MQ=255) tgtgCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTa > 1:692983/1‑99 (MQ=255) tgCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACg < 1:466461/99‑1 (MQ=255) gCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGc < 2:3339139/99‑1 (MQ=255) gCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGc < 2:3338762/99‑1 (MQ=255) cTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGcc > 2:2080265/1‑99 (MQ=255) cTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCCGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGcc > 2:3164226/1‑99 (MQ=255) tGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCt > 1:1005293/1‑99 (MQ=255) tCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGa > 1:127927/1‑99 (MQ=255) tCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGa > 1:1237498/1‑99 (MQ=255) tCTGCGTCAATCGCAGCAATGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGACCGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGa > 2:836756/1‑99 (MQ=255) tGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGata > 2:1671614/1‑99 (MQ=255) tGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGata > 1:429773/1‑99 (MQ=255) gCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGatat < 2:897062/99‑1 (MQ=255) gCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGatat < 2:2476807/99‑1 (MQ=255) cGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATg > 1:3108884/1‑99 (MQ=255) cGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATg > 1:2707741/1‑99 (MQ=255) ttcgaTCCCAACACTGGTACCGGAAAACGAGACATACAAAAGCCGGGGATGATTCCCATAAGCGCGAACTTAAGGGTTGTGGTATTATGCCTGATATGa < 2:3243064/95‑1 (MQ=12) aaTCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAttt > 2:2636639/1‑99 (MQ=255) aaTCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAttt > 2:1216400/1‑99 (MQ=255) aTCGCAGCACTGGTGCTGTAAGAGCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCGTAAGCGCTAACTTAAGGGATGTGCTATTACGCCTGATATGATTTa > 1:3247447/1‑99 (MQ=25) aTCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTa > 1:867707/1‑99 (MQ=255) tCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTaa > 1:2512747/1‑99 (MQ=255) tCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTaa < 1:1982577/99‑1 (MQ=255) cGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAAc < 1:1765897/99‑1 (MQ=255) cagcaCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTGAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGt > 2:1922950/1‑99 (MQ=255) agcaCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTg < 2:2009354/99‑1 (MQ=255) gcaCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGc < 2:913795/99‑1 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1:3281537/99‑1 (MQ=255) tGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGaa > 2:2675566/1‑99 (MQ=255) gCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGaaa > 2:2518069/1‑98 (MQ=255) gCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAAt < 2:1326637/99‑1 (MQ=255) gCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAAt < 1:193671/99‑1 (MQ=255) gCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATGCCCGTAAGCGCTAACTGAAGGGTGGTGGTATTACGCCTGGTATGATTTAACGTGCAGATGagt > 2:763462/1‑97 (MQ=21) cTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAAtt > 1:2725517/1‑99 (MQ=255) gTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCTATAAGCGCTAAATTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGACGATGAATTag > 2:749788/1‑98 (MQ=18) gTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTAc 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(MQ=255) ttCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGccc > 2:2105948/1‑99 (MQ=31) | CTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCC > NC_000913/2514176‑2514370 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |