| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 242,498 | A→C | L269R (CTG→CGG) | fadE ← | acyl coenzyme A dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 242,498 | 0 | A | C | 98.8% | 267.7 / NA | 81 | L269R (CTG→CGG) | fadE | acyl coenzyme A dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base C (40/40); total (40/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 | |||||||||||
ACGAAGACATCTTTACCGCGCGTCGGTCCGTTCTGGAACGGTACGTTCAGCGGGAAGTGGCGACGACCAATTTCCACGCCCGGCGTGGTGGTTGGGATCAGCGCACAGGTAATGCCTAAATCTTCTGCACCGCCGAGTAATTTTTCCGGGTCGGAGAGTTTAAACGCCAGCCCAAGCACGGTCGCAATCGGTGCCAGCGTAATGTAGCGTTTGTTCCAGGTCAGACGCATCCCCAGCACCTGCTGGCCCTGCCATTCGCCCATGCAGACAATCCCGGTGTCCGGAATCGCGCCCGCATCGGAACCCGCTTCCGGGCTGGTCAGTGCAAAGCAGGGGATCTCCTGACCACGCGCCAGACGCGGCAGATAGTGATCTTTCTGCTCGTCAGTGCCGTAATGTTGCAACAGTTCGCCCGGGCCTAATGAGTTTGGCACGCCGACGGTAATCGCCAGGATCCCGCT > NC_000913/242264‑242724 | aCGAAGACATCTTTCCCGCGCGTCGGTCCGTTCTGGAACGGTACGTTCAGCGGGAAGTGGCGACGACCAATTTCCACGCCCGGCGTGGTGGTTGGGATCAGCGCACAGGTAATGCCTAAATCTTCTGCACCGCCGAGTAATTTTTCCGGGTCGGAGAGTTTAAACGCCAGCCCAAGCACGGTCGCAATCGGTGCCAGCGTAATGTAGCGTTTGTTCCAGGTCAGACGCATCCCCCGCa < 2:494703/238‑1 (MQ=255) tCTTTACCGCGCGTCGGTCCGTTCTGGAACGGTACGTTCAGCGGGAAGTGGCGACGACCAATTTCCACGCCCGGCGTGGTGGTTGGGATCAGCGCACAGGTAATGCCTAAATCTTCTGCACCGCCGAGTAATTTTTCCGGGTCGGAGAGTTTAAACGCCAGCCCAAGCACGGTCGCAATCGGTGCCAGCGTAATGTAGCGTTTGTTCCAGGTCAGACGCATCCCCCGCACct > 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aGCGTTTGTTCCAGGTCAGACGCATCCCCCGCACCTGCTGGCCCTGCCATTCGCCCATGCAGACAATCCCGGTGTCCGGAATCGCGCCCGCATCGGAACCCGCTTCCGGGCTGGTCAGTGCAAAGCAGGGGATCTCCTGACCACGCGCCAGACGCGGc < 2:499534/158‑1 (MQ=255) aGCGTTTGTTCCAGGTCAGACGCATCCCCCGCACCTGCTGGCCCTGCCATTCGCCCATGCAGACAATCCCGGTGTCCGGAATCGCGCCCGCATCGGAACCCGCTTCCGGGCTGGTCAGTGCAAAGCAGGGGATCTCCTGACCACGCGCCAGACGCGGc > 1:499534/1‑158 (MQ=255) aGCGTTTGTTCCAGGTCAGACGCATCCCCCGCACCTGCTGGCCCTGCCATTCGCCCATGCAGACAATCCCGGTGTCCGGAATCGCGCCCGCATCGGAACCCGCTTCCGGGCTGGTCAGTGCAAAGCAGGGGATCTCCTGACCACGCGCCAGACGCGGCAGATAGTGATCTTTCTGCTCGTCAGTGCCGTAATGTTGCAACAGTTCGCCCGGGCCTAATGAGTTTGGCACGCCGACGGTa < 1:877835/239‑1 (MQ=255) cGTTTGTTCCAGGTCAGACGCATCCCCCGCACCTGCTGGCCCTGCCATTCg < 1:87918/51‑1 (MQ=255) cGTTTGTTCCAGGTCAGACGCATCCCCCGCACCTGCTGGCCCTGCCATTCg > 2:87918/1‑51 (MQ=255) tGTTCCAGGGAAGACGCATCCCCCGCTCCTGCTGGCCCTGCCATTCGCCCATGCAGACAATCCCGGTGTCCGGAATCGCGCCCGCATCGGAACCCGCTTCCGGGCTGGTCAGTGCAAAGCAGGGGATCTCCTGAACACGCGCCAGACGCGGCAGATAGTGATCTTTCTGCTCGTCAGTGCCGTAATGTTGCAACAGTTCGCCCGGGCCTAATGAGTTTGGCACGCCGACGGTAATCGcc < 2:194901/239‑1 (MQ=255) gTTCCAGGTCAGACGCATCCCCCGCACCTGCTGGCCCTGCCATTCGCCCATGCAGACAATCCCGGTGTCCGGAATCGCGCCCGCATCGGAACCCGCTTCCGGGCTGGTCAGTGCAAAGCAGGGGATCTCCTGACCACGCGCCAGACGCGGCAGATAGTGATCTTTCTGCTCGTCAGTGCCGTAATGTTGCAACAGTTCGCCCGGGCCTAATGAGTTTGGCACGCCGACGGTAATCGCCa > 2:709308/1‑239 (MQ=255) gTTCCAGGTCAGACGCATCCCCCGCACCTGCTGGCCCTGCCATTCGCCCATGCAGACAATCCCGGTGTCCGGAATCGCGCCCGCATCGGAACCCGCTTCCGGGCTGGTCAGTGCAAAGCAGGGGATCTCCTGACCACGCGCCAGACGCGGCAGATAGCGATCTTTCTGCTCGTCAGTGCCGCAATGTTGCAACAGTTCGCCCGGGCCTCATGAGTTTGGCACGCCGACGGTAATCGCCa > 1:111482/1‑239 (MQ=255) gACGCATCCCCCGCACCTGCTGGCCCTGCCATTCGCCCATGCAGACAATCCCGGTGTCCGGAATCGCGCCCGCATCGGAACCCGCTTCCGGGCTGGTCAGTGCAAAGCAGGGGATCTCCTGACCACGCGCCAGACGCGGCAGATAGTGATCTTTCTGCTCGTCAGTGCCGTAATGTTGCAACAGTTCGCCCGGGCCTAATGAGTTTGGCACGCCGACGGTAATCGCCAGGATCCCGCt > 2:79515/1‑238 (MQ=255) aCGCATCCCCCGCACCTGCTGGCCCTGCCATTCGCCCATGCAGACAATCCCGGTGTCCGGAATCGCGCCCGCATCGGAACCCGCTTCCGGGCTGGTCAGTGCAAAGCAGGGGATCTCCTGACCACGCGCCAGACGCGGCAGATAGTGAt > 1:180798/1‑149 (MQ=255) aCGCATCCCCCGCACCTGCTGGCCCTGCCATTCGCCCATGCAGACAATCCCGGTGTCCGGAATCGCGCCCGCATCGGAACCCGCTTCCGGGCTGGTCAGTGCAAAGCAGGGGATCTCCTGACCACGCGCCAGACGCGGCAGATAGTGAt < 2:180798/149‑1 (MQ=255) tCCCCCGCACCTGCTGGCCCTGCCATTCGCCCATGCAGACAATCCCGGTGTCCGGAATCGCGCCCGCATCGGAAcc > 1:194019/1‑76 (MQ=255) tCCCCCGCACCTGCTGGCCCTGCCATTCGCCCATGCAGACAATCCCGGTGTCCGGAATCGCGCCCGCATCGGAAcc < 2:194019/76‑1 (MQ=255) tCCCCCGCACCTGCTGGCCCTGCCATTCGCCCATGCAGACAATCCCGGTGTCCGGAATCGCGCCCGCATCGGAACCCGCTTCCGGGCTGGTCAGTGCAAAGCAGGGGATCTCCTGACCACGCGCCAGACGCGGCAGATAGTGATCTTTCTGCTCGTCAGTGCCGTaa > 2:14010/1‑167 (MQ=255) tCCCCCGCACCTGCTGGCCCTGCCATTCGCCCATGCAGACAATCCCGGTGTCCGGAATCGCGCCCGCATCGGAACCCGCTTCCGGGCTGGTCAGTGCAAAGCAGGGGATCTCCTGACCACGCGCCAGACGCGGCAGATAGTGATCTTTCTGCTCGTCAGTGCCGTaa < 1:14010/167‑1 (MQ=255) | ACGAAGACATCTTTACCGCGCGTCGGTCCGTTCTGGAACGGTACGTTCAGCGGGAAGTGGCGACGACCAATTTCCACGCCCGGCGTGGTGGTTGGGATCAGCGCACAGGTAATGCCTAAATCTTCTGCACCGCCGAGTAATTTTTCCGGGTCGGAGAGTTTAAACGCCAGCCCAAGCACGGTCGCAATCGGTGCCAGCGTAATGTAGCGTTTGTTCCAGGTCAGACGCATCCCCAGCACCTGCTGGCCCTGCCATTCGCCCATGCAGACAATCCCGGTGTCCGGAATCGCGCCCGCATCGGAACCCGCTTCCGGGCTGGTCAGTGCAAAGCAGGGGATCTCCTGACCACGCGCCAGACGCGGCAGATAGTGATCTTTCTGCTCGTCAGTGCCGTAATGTTGCAACAGTTCGCCCGGGCCTAATGAGTTTGGCACGCCGACGGTAATCGCCAGGATCCCGCT > NC_000913/242264‑242724 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |