| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3983571 = | 84 (0.930) | 6 (0.070) | 6/402 | 6.7 | 6.1% | coding (614/1236 nt) | aslB | putative AslA‑specific sulfatase‑maturating enzyme |
| ? | NC_000913 | 3983798 = | 106 (1.240) | coding (841/1236 nt) | aslB | putative AslA‑specific sulfatase‑maturating enzyme | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
TCGAGCGCCTGGCTGATGAAACAACTGCCCGCGATGGACTTAAGTTACATGCGCCTGGTGATATTCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGATTGTTGAGCACAACGGCGACGTTTACGCCTGTGATCACTATGTTTATCCGCAATATCGGCTGGGGAATATGCACCAGCAAACAATTGCAGAAATGATCGATTCCCCGCAACAGCAGGCGTTTGGTGAAGATAAATTTAAGCAGTTACCGGCGCAGTGTCGCAGTTGTAACGTGTTAAAAGCGTGCTGGGGAGGCTGCCCGAAACACCGCT > NC_000913/3983562‑3984026 | tCGAGCGCCTGGCTGATGAAACAACTGCCCGCGATGGACTTAAGTTACATGCGCCTGGTGATATTCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAAc < 1:216609/238‑1 (MQ=255) cGAGCGCCTGGCTGATGAAACAACTGCCCGCGATGGACTTAAGTTACATGCGCCTGGTGATATTCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATTGAATGGGAGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGGCaa > 2:216609/1‑236 (MQ=255) tGGCTGATGAAACAACTGCCCGCGATGGACTTAAGTTACATGCGCCTGGTGATATTCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGgcgc < 1:23691/239‑1 (MQ=255) ggtgaAACAACGGCACGCTATGGACTTAAGTTACATGCGCCTGGGTATATTCAGGGTTAGCTAACGGAATGGTCGGTGCAGCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTTGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGCATCTCGAATGGGGGTTTGCCAATTTTGTCGGTTCGCAGGGTGCGGTTTGCCATCTTCAGCCAACCTGTGGTCGCTCGGt < 2:693662/237‑1 (MQ=255) aacaacTGCCCGCGATGGACTTAAGTTACATGCGCCTGGTGATATTCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGAttg < 1:483322/239‑1 (MQ=255) tGCCCGCGATGGACTTAAGTTACATGCGCCTGGTGATATTCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGAttgtt < 2:711669/235‑1 (MQ=255) tGCCCGCGATGGACTTAAGTTACATGCGCCTGGTGATATTCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTGCGTGGTGAATATCAAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGAttgtt < 1:424945/235‑1 (MQ=255) cccGCGATGGACTTAAGTTACATGCGCCTGGTGATATTCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTTGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCACTTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGATTGTTGAGcac > 1:490226/1‑239 (MQ=255) gATGGACTTAAGTTACATGCGCCTGGTGATATTCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGAttg < 1:769878/226‑1 (MQ=255) gATGGACTTAAGTTACATGCGCCTGGTGATATTCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGAttg > 2:769878/1‑226 (MQ=255) tGGACTTAAGTTACATGCGCCTGGTGATATTCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGATTGTTGAGCACAACGGc < 1:638061/238‑1 (MQ=255) tGGACTTAAGTTACATGCGCCTGGTGATATTCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGGGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTCGGCGCTCGGTGATTGTTGAGCACAACGGCg > 1:239336/1‑239 (MQ=255) aTGCGCCTGGTGATATTCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGATTGTTGAGCACAACGGCGACGTTTACGCCtgt < 2:927063/239‑1 (MQ=255) aTGCGCCTGGTGATATTCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGATTGTTGAGCACAACGGCGACGTTTACGCCtgt < 2:667757/239‑1 (MQ=255) tGCGCCTGGTGATATTCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGATTGTTGAGCACAACGGCGACGTTTACGCCtgtg < 2:533397/239‑1 (MQ=255) tGCGCCTGGTGATATTCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGATTGTTGAGCACAACGGCGACGTTTACGCCtgtg > 1:368067/1‑239 (MQ=255) cgcCTGGTGATATTCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGATTGTTGAGCACAACGGCGACGTTTa < 2:860072/229‑1 (MQ=255) ccTGGTGATATTCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGATTGTTGAGcaca > 1:712781/1‑214 (MQ=255) cTGGTGATATTCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGATTGTTGAGCACAACGGCGACGTTTACGCCTGTGATCa < 1:217832/238‑1 (MQ=255) tGGTGATATTCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGATTGTTGAGCACAACGGCGACGTTTACGCCTGTGATCACt < 1:124785/239‑1 (MQ=255) gTGATATTCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGATTGTTGAGCACAACGGCGACGTTTACGCCTGTGATCACTAt > 1:10573/1‑239 (MQ=255) tCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGTCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGATTGTTGAGCACAACGGCGACGTTTACGCCTGTGATCACTATGTTTATc < 2:227341/239‑1 (MQ=255) aGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTTTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGATTGTTGAGCACAACGGCGACGTTTACGCCTGTGATCACTATGTTTATcc > 2:683344/1‑238 (MQ=255) ggTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGATTGTTGAGCACAACGGCg < 2:647919/205‑1 (MQ=255) ggTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGATTGTTGAGCACAACGGCg > 1:647919/1‑205 (MQ=255) ggTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGATTGTTGAGCACAACGGCGACGTTTACGCCTGTGATCACTATGTTTATCCGCa > 1:959555/1‑239 (MQ=255) gTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGATTGTTGAGCACAACGGCGACGTTTACGCCTGTGATCACTATGTTTATcc < 2:167281/235‑1 (MQ=255) aGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGATTGTTGAGCACAACGGCGACGTTTACg < 1:456620/210‑1 (MQ=255) aGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGATTGTTGAGCACAACGGCGACGTTTACg > 2:456620/1‑210 (MQ=255) aGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGATTGTTGAGCACAACGGCGACGTTTACGCCtgt > 2:118299/1‑215 (MQ=255) aGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGATTGTTGAGCACAACGGCGACGTTTACGCCtgt < 1:118299/215‑1 (MQ=255) 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NC_000913/3983562‑3984026 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |