Predicted mutation | ||||||
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MC JC | NC_000913 | 3,815,859 | Δ82 bp | [rph]–[rph] | [rph], [rph] |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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* | * | ÷ | NC_000913 | 3815859 | 3815940 | 82 | 167 [0] | [2] 168 | [rph]–[rph] | [rph],[rph] |
New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | 3815941 = | 0 (0.000) | pseudogene (609/669 nt) | rph | ribonuclease PH (defective);enzyme; Degradation of RNA; RNase PH |
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
CAGCGCCGCCTTCTGCGTCGCTACAATGGATTCGATTCCCCTCGGGCCAGAGCCAACAAGATGAGTAGCTCTTCATGGGTGAACGGCTCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCG > NC_000913/3815843‑3816038 | ggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcc > 2:784708‑M2/99‑99 (MQ=255) ggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcc > 1:2126839‑M2/99‑99 (MQ=255) ggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcc < 2:300056‑M2/1‑1 (MQ=255) ggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcc < 2:505420‑M2/1‑1 (MQ=255) tttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGt > 1:421439‑M2/97‑99 (MQ=255) tttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGt < 1:2059806‑M2/3‑1 (MQ=255) catgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTccc > 1:3935819‑M2/94‑99 (MQ=255) atgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTcccc > 2:1023254‑M2/93‑99 (MQ=255) atgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCt > 1:2565221‑M2/92‑99 (MQ=255) gccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTg < 1:1224750‑M2/9‑1 (MQ=255) cttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCa > 1:715515‑M2/89‑99 (MQ=255) ctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCa > 1:2519428‑M2/84‑99 (MQ=255) tcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcaccgccgtctgcCGTCCCCTGCACTTCaa > 1:3601012‑M2/83‑99 (MQ=255) cctcatcttgctttcctacagacacaaaaaaggcgacccatccgtcgccttaaacatcactttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAat < 2:2169508‑M2/18‑1 (MQ=255) cctcagcttactcataaacaaaaaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAat < 2:1455447‑M2/18‑1 (MQ=255) cctcaccttacttttcaacagacaacaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAat < 2:3771326‑M2/18‑1 (MQ=255) ctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAatg > 1:847883‑M2/81‑99 (MQ=255) catcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAatgat < 1:650109‑M2/21‑1 (MQ=255) atcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAatgatg > 2:2437675‑M2/78‑99 (MQ=255) cttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcattagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATgcg > 2:2254284‑M2/76‑99 (MQ=255) cttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATgcg > 2:391287‑M2/76‑99 (MQ=255) ttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATgcgc > 1:2697301‑M2/75‑99 (MQ=255) tacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGcc < 1:2779297‑M2/26‑1 (MQ=255) cttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATAATCAGCCCg > 2:1067578‑M2/72‑99 (MQ=255) ttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGt > 1:994633‑M2/71‑99 (MQ=255) ttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGt > 1:582871‑M2/71‑99 (MQ=255) ttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGt > 1:2052134‑M2/71‑99 (MQ=255) tctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCtt > 1:2692243‑M2/68‑99 (MQ=255) tacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCg < 1:2495229‑M2/34‑1 (MQ=255) tacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCg < 2:2855584‑M2/34‑1 (MQ=255) tacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCg < 2:716699‑M2/34‑1 (MQ=255) agacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGtc > 1:2246958‑M2/63‑99 (MQ=255) agacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGtc < 1:1650456‑M2/37‑1 (MQ=255) gacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGtca < 2:1494226‑M2/38‑1 (MQ=255) gacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGtca > 2:607124‑M2/62‑99 (MQ=255) aaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGtcatca > 1:2942098‑M2/59‑99 (MQ=255) aaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGtcatca > 1:522383‑M2/59‑99 (MQ=255) aaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagcttgccagcgccggcttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGtcatca > 2:3650390‑M2/59‑99 (MQ=255) aaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgtcttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCAc > 1:3723063‑M2/58‑99 (MQ=255) ttttaaggcgactgatgagtcgccttaaaaatcagtttgctagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACt > 2:111757‑M2/57‑99 (MQ=255) tttaaggcgactgatgagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTa > 1:3557291‑M2/56‑99 (MQ=255) 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< 1:1362104‑M2/81‑1 (MQ=255) gcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTCCGTCCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTcc > 1:1194506‑M2/15‑99 (MQ=255) cgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCa < 1:1157566‑M2/86‑1 (MQ=255) gccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCTCCCGTCTTCTGTCATCACTACTTTCTTGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAg > 1:1462973‑M2/13‑99 (MQ=255) gccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATc < 1:3912414‑M2/90‑1 (MQ=255) ccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCg > 2:2681922‑M2/9‑99 (MQ=255) cTTCTGCCGTCCCCTGCACTACGATGTTGCGCCCGTCGGCGGTGATCACTACGTTCATGTCGGTCTGTGCGGCAGGGGCTTCAACGTATTCCAGATCga < 2:3634242/99‑2 (MQ=255) cTTCTCCCGTCCCCCCCACTCCAATGATGCTCCCGTTTTCGGTCTTCACTACGTTCATGTCGGTCTCTCCGTCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGc > 2:1817550/1‑99 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |