Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 1,292,989 | IS1 (+) +8 bp | intergenic (‑67/‑531) | hns ← / → tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 291401 | NA (NA) | 144 (0.960) | 87/196 | 0.4 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | = 1292996 | 0 (0.000) | intergenic (‑74/‑531) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase | |||||
* | ? | NC_000913 | = 1050545 | NA (NA) | 148 (0.990) | 91/196 | 0.2 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | 1292989 = | 0 (0.000) | intergenic (‑67/‑538) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
Only 100 of 300 total aligned reads displayed.
GTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATA > NC_000913/1292893‑1293087 | aagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTGc < 2:2319337‑M2/3‑1 (MQ=255) aagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTGc > 2:1258732‑M2/97‑99 (MQ=255) aagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTGc > 1:3530147‑M2/97‑99 (MQ=255) gtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTGCaa > 2:242183‑M2/95‑99 (MQ=255) tcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTGCAAt < 2:2399608‑M2/6‑1 (MQ=255) ttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCagat > 1:1345153/1‑96 (MQ=255) cAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGg < 1:1301174‑M2/99‑2 (MQ=255) gAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggt < 1:3342232‑M2/99‑4 (MQ=255) tcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTGCAATAGCCAg < 2:2272741‑M2/12‑1 (MQ=255) aaTTTTAAGTGCTTCGCTCATTATAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGCTGTGCAATAGggtg < 1:3049025‑M2/99‑5 (MQ=255) ttttAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgat > 2:3343134‑M2/1‑93 (MQ=255) tcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGt < 2:3671955‑M2/18‑1 (MQ=255) aaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTaa > 2:1600825‑M2/80‑99 (MQ=255) aaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTaa > 1:3404545‑M2/80‑99 (MQ=255) aaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTaa > 1:3364223‑M2/80‑99 (MQ=255) cGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaactta < 2:3730774‑M2/99‑19 (MQ=255) cGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaactta > 1:3185481‑M2/1‑81 (MQ=255) tCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactg > 2:1226289‑M2/1‑78 (MQ=255) tCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactg < 2:879898‑M2/99‑22 (MQ=255) agctgcatgacaaagtcatcgggcattgtctgaacataaaacactatcaataagatggactcattaccTACAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCaaaa < 1:3436467‑M2/31‑1 (MQ=255) agctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCaaaa < 1:1016809‑M2/31‑1 (MQ=255) ctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAAtt < 1:3277276‑M2/33‑1 (MQ=255) gtagtaATCTCAATCTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAACCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgattta > 1:3570382‑M2/1‑73 (MQ=255) gtagtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgattta > 2:1008379‑M2/1‑73 (MQ=255) gtagtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgattta > 1:369568‑M2/1‑73 (MQ=255) gtagtaATCTCAAACTTATATTGGGGCGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgattta < 1:2580845‑M2/99‑27 (MQ=255) tagtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttag < 1:1980056‑M2/99‑28 (MQ=255) catgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGCATGTAAGGAATTCAAAATTGtt > 2:2046785‑M2/64‑99 (MQ=255) catgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGtt > 1:1939237‑M2/64‑99 (MQ=255) agtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTGGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagt > 2:438682‑M2/1‑71 (MQ=255) tgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCt > 1:1285525‑M2/62‑99 (MQ=255) taATCTCGAAGTTATAGTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgcaaacttacggatttagtgt > 2:2023369‑M2/1‑69 (MQ=255) taATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgt > 1:2466721‑M2/1‑69 (MQ=255) tctcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatg < 2:2788654‑M2/99‑34 (MQ=255) tctcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatg > 1:280218‑M2/1‑66 (MQ=255) cAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatg > 2:525676‑M2/1‑63 (MQ=255) agtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTAttt < 1:3822282‑M2/44‑1 (MQ=255) ttcatcgggcattctctgaacataaaacactatcaataagttggactcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTATGGAATTCAAAAGTGTTCTTTAtttt < 2:3591606‑M2/45‑1 (MQ=255) aaaCTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatgg > 2:405761‑M2/1‑62 (MQ=255) aaCTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggt > 2:3303095‑M2/1‑61 (MQ=255) catcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTATTTATTTtgt < 1:2751100‑M2/47‑1 (MQ=255) tcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTgc > 1:2957084‑M2/51‑99 (MQ=255) gatctggggTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttt > 2:2739270‑M2/5‑56 (MQ=255) ggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTgccgc < 1:2923105‑M2/52‑1 (MQ=255) atTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTCTGCAATAGggtgatgcttccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttg > 2:3610811‑M2/1‑54 (MQ=255) ttGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATGATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttga > 2:569477‑M2/1‑53 (MQ=255) ttGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttga > 2:1666663‑M2/1‑53 (MQ=255) ttGGGGGGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttgtga < 2:833063‑M2/99‑47 (MQ=255) cattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCa > 2:651318‑M2/46‑99 (MQ=255) tGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgag > 1:352418‑M2/1‑52 (MQ=255) ggggTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgagg > 1:2063418‑M2/1‑51 (MQ=255) atctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCaataa > 2:2155660‑M2/42‑99 (MQ=255) ctgaacataaaacactatcactaagttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCaataaat < 2:1128860‑M2/60‑1 (MQ=255) ctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCaataaat > 2:339614‑M2/40‑99 (MQ=255) ctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATACAAAATAGTTCTTTATTTTGTGCCGCCaataaat > 2:2532894‑M2/40‑99 (MQ=255) tgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCaataaata > 2:2981869‑M2/39‑99 (MQ=255) gaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAatat > 1:2251282‑M2/38‑99 (MQ=255) tatgttgagGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctcca < 2:2508120‑M2/97‑56 (MQ=255) aacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATc < 1:951982‑M2/63‑1 (MQ=255) tgttgAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagt > 1:1594503‑M2/1‑42 (MQ=255) tgttgAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagt > 2:33272‑M2/1‑42 (MQ=255) gttgAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtg < 2:1348262‑M2/99‑59 (MQ=255) ataaaacactatcaataagttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCttt > 1:3119605‑M2/34‑99 (MQ=255) ataaaacactatcaataagttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCttt > 2:596223‑M2/34‑99 (MQ=255) ttgAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtgg > 2:1469692‑M2/1‑40 (MQ=255) aaacactatcaataagttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCa > 1:870728‑M2/31‑99 (MQ=255) aaaactatcaataagttggagtcattaccTGCAATAGCAAGGAATGTAAGGAATTCACAATTGATATTTATTTTGTACCGCCAATAAATATCTTTTCAt > 2:1533246‑M2/30‑99 (MQ=255) cactatcaataagttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATaa > 2:3037302‑M2/28‑99 (MQ=255) aataatAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgt < 1:2110763‑M2/99‑67 (MQ=255) aataatAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgt < 1:547556‑M2/99‑67 (MQ=255) tatcaataagttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAAt > 1:433622‑M2/25‑99 (MQ=255) taataGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgttt > 1:592785‑M2/1‑31 (MQ=255) taataGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgttt > 1:1661899‑M2/1‑31 (MQ=255) aataGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttc < 1:1495855‑M2/99‑70 (MQ=255) taGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttcta > 1:651136‑M2/1‑28 (MQ=255) taGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttcta < 1:1115059‑M2/99‑72 (MQ=255) taGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttcta < 1:1467425‑M2/99‑72 (MQ=255) aataagttggagtcattaccTGCAATAGCCTGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGc > 2:3460977‑M2/21‑99 (MQ=255) aataagttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGc > 1:3909484‑M2/21‑99 (MQ=255) ataagttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGcc > 1:1032385‑M2/20‑99 (MQ=255) taagttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCa < 1:489452‑M2/81‑1 (MQ=255) agCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatca < 1:2847010‑M2/99‑75 (MQ=255) aagttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAg < 1:177679‑M2/82‑1 (MQ=255) gttggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGaa > 1:2713603‑M2/16‑99 (MQ=255) tggagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGaaaa < 2:1857734‑M2/86‑1 (MQ=255) gagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGa > 2:1786739‑M2/12‑99 (MQ=255) gagtcattaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGa > 1:163578‑M2/12‑99 (MQ=255) aaTTCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtcc > 1:833188‑M2/1‑18 (MQ=255) ttCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccct < 1:3727366‑M2/99‑84 (MQ=255) ttCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccct < 1:3166‑M2/99‑84 (MQ=255) tCAGTTGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctc > 1:2016640‑M2/1‑15 (MQ=255) attaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCgg > 2:3651583‑M2/7‑99 (MQ=255) attaccTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCgg < 1:3109181‑M2/93‑1 (MQ=255) ttGTGCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgt < 1:126147‑M2/99‑89 (MQ=255) tgtgCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgtt > 1:186500‑M2/1‑10 (MQ=255) gtgCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttc < 2:2606181‑M2/99‑91 (MQ=255) gtgCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttc < 2:2928756‑M2/99‑91 (MQ=255) tgCAATAGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttca < 1:2311815‑M2/99‑92 (MQ=255) tgCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCAtata < 2:458054/99‑1 (MQ=255) tgCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTACCCAGAAAAGACGCTGCataca > 2:3089765/1‑97 (MQ=255) | GTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATA > NC_000913/1292893‑1293087 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |