| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,183,258 | G→A | E672K (GAA→AAA) | rpoB → | RNA polymerase, beta subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,183,258 | 0 | G | A | 97.0% | 531.9 / 3.4 | 168 | E672K (GAA→AAA) | rpoB | RNA polymerase, beta subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/2); new base A (76/86); total (79/89) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.68e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.36e-01 | |||||||||||
Only 100 of 170 total aligned reads displayed.
GGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGT > NC_000913/4183162‑4183353 | ggCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGaaa < 2:3425343/99‑1 (MQ=255)ggCGAATCCAGCTTGTTCAACCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGaaa < 1:2749132/99‑1 (MQ=255) gCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAac < 1:2768485/99‑1 (MQ=255) gAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAacac < 2:1291051/99‑1 (MQ=255) gAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAacac > 1:2890443/1‑99 (MQ=255) aaTCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACg < 1:1838663/99‑1 (MQ=255) aTCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGa < 1:4019843/99‑1 (MQ=255) tCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCATGTTGACTACATTGACGTATCCACCCAGCAGGTGCTATCCGTCGGTGCGTCCCTGGTCCCGTTCCTGAAACACGAt < 1:4981884/99‑1 (MQ=255) cAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGa < 1:2972211/99‑1 (MQ=255) aGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGAc > 2:53617/1‑99 (MQ=255) aGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGATGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGAc > 1:1159800/1‑99 (MQ=255) gCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGGAACACGATGACg > 1:2098466/1‑99 (MQ=255) cTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGc < 2:1859360/99‑1 (MQ=255) ttCAGCCGGGAGCAGGGTGACGACATGGACGTTGCCAGCAAGCAGGTGGTATCCGTCGGTTCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAAc < 2:3981936/99‑1 (MQ=255) ttCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGGGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAAc > 1:2407560/1‑99 (MQ=255) tCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAAcc > 2:3348456/1‑99 (MQ=255) cAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCg > 2:2520233/1‑99 (MQ=255) atccGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGt < 1:4448948/97‑1 (MQ=255) aGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGTCGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGGCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGt < 1:589154/99‑1 (MQ=255) aGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGt < 2:209293/99‑1 (MQ=255) gCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTg < 2:3441/99‑1 (MQ=255) ccGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGc < 2:4909126/99‑1 (MQ=255) gcgACCAGGTGGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATGCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCAt > 2:4790708/1‑99 (MQ=255) cgACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGCTCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCttt < 2:304845/99‑1 (MQ=255) gACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTg < 1:614900/99‑1 (MQ=255) gACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTg > 2:1324447/1‑99 (MQ=255) aCCAGGTTGACTACATGTACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGa < 1:2708975/99‑1 (MQ=255) aCCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGa < 1:1496718/99‑1 (MQ=255) aCCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGa < 1:4737973/99‑1 (MQ=255) ccAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGAt < 1:159593/99‑1 (MQ=255) aGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATgg > 1:150409/1‑99 (MQ=255) ggTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATggg > 1:4195121/1‑99 (MQ=255) gTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGt < 2:1467817/99‑1 (MQ=255) ttGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTg < 2:618625/99‑1 (MQ=255) tGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGc < 1:129659/99‑1 (MQ=255) cTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGaa < 2:298728/99‑1 (MQ=255) cTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGaa > 1:1939079/1‑99 (MQ=255) tACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATTACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGaat > 1:5279572/1‑98 (MQ=255) tACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAAc > 1:2647918/1‑99 (MQ=255) tACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAAc < 1:2110560/99‑1 (MQ=255) tACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAAc > 1:2974291/1‑99 (MQ=255) aCATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACa < 2:1977633/99‑1 (MQ=255) cATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACAt < 1:97142/99‑1 (MQ=255) cATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACAt > 1:2015113/1‑99 (MQ=255) aTGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATg > 1:4630132/1‑99 (MQ=255) ggACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCa > 1:3693132/1‑99 (MQ=255) ggACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCa > 2:5014876/1‑99 (MQ=255) ggACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCa > 1:5141433/1‑99 (MQ=255) gACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCaa < 1:3887246/99‑1 (MQ=255) gACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCaa < 1:226320/99‑1 (MQ=255) aCGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAAc > 2:2197141/1‑99 (MQ=255) gTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGt < 2:2643553/99‑1 (MQ=255) gTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGt < 2:2926573/99‑1 (MQ=255) tATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTc < 2:2603522/99‑1 (MQ=255) aTCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCa < 1:5187887/99‑1 (MQ=255) aTCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATAACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCa > 1:1373505/1‑99 (MQ=255) tCCACCCAGGAGGTGGTATACGTCGGTTAGACCCTGTTCCCGTTCCTGAAACAAGATGCCGCCAAGCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCGACGTCAg < 2:3917019/99‑1 (MQ=255) tCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGCCGGCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAg > 2:4798598/1‑99 (MQ=255) tCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAg < 1:2136687/99‑1 (MQ=255) aCCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGcc > 1:2063239/1‑99 (MQ=255) aCCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGcc < 1:342803/99‑1 (MQ=255) gcagGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTcc < 1:4633984/99‑1 (MQ=255) gcagGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGACAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTcc > 2:4472080/1‑99 (MQ=255) cagGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTTCTGAAACACGATGCCGCCAACCGTTCATTGATGGGTGCGAATATGCAACGTCAGGCCGTTCCg < 2:4163568/99‑1 (MQ=255) agGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGa < 2:113419/99‑1 (MQ=255) ggtggtATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGAc < 1:1412263/99‑1 (MQ=255) tggtATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGActc > 2:4348536/1‑99 (MQ=255) tggtATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGActc > 1:2557023/1‑99 (MQ=255) tggtATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATGGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGActc > 1:5044758/1‑99 (MQ=255) ggtATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTACATTAATAGATACGAACATACAACGTCAGGCCGTTCCGActct > 1:3047156/1‑99 (MQ=255) tATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTgc < 2:716008/99‑1 (MQ=255) aTCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTgcg < 1:5007280/99‑1 (MQ=255) aTCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTgcg < 1:2236769/99‑1 (MQ=255) tgTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACTGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTgcgcgc < 1:1785015/98‑1 (MQ=255) cGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTgcgcgc < 2:756655/99‑1 (MQ=255) cGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTgcgcgc < 1:3910981/99‑1 (MQ=255) cGTCGGTGCGTCCCTGATCCCATTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTgcgcgc < 1:1035524/99‑1 (MQ=255) cGTCGGTGCGTCCCTGATCCCATTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTgcgcgc < 1:2331063/99‑1 (MQ=255) gTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCt < 1:1540206/99‑1 (MQ=255) gTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCt > 2:282974/1‑99 (MQ=255) tCGGTGCGTCCCTGCTCCCGTTCCTGAAAGACGATGACGCCAACTGTGCATTGAAGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTg > 2:5075466/1‑99 (MQ=255) gTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATa > 1:2250857/1‑99 (MQ=255) gTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATa > 2:1966388/1‑99 (MQ=255) tGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATaa < 1:3263349/99‑1 (MQ=255) gTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGcc > 1:3398887/1‑99 (MQ=255) tCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCg > 2:4161781/1‑99 (MQ=255) tCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCg > 1:3747998/1‑99 (MQ=255) cTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCAAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtg > 1:422549/1‑99 (MQ=255) tGATCCCGTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtgg > 2:1487410/1‑99 (MQ=255) aTCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtggtt < 1:2003763/99‑1 (MQ=255) aTCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtggtt < 2:1663883/99‑1 (MQ=255) aTCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtggtt < 2:1814222/99‑1 (MQ=255) cccGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtggttgg < 2:1232051/99‑1 (MQ=255) ccGTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtggttggt < 1:577084/99‑1 (MQ=255) ccGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtggttggt > 2:3162497/1‑99 (MQ=255) ccGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtggttggt > 2:4861546/1‑99 (MQ=255) tCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTg < 1:3339044/99‑1 (MQ=255) ccTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTgg < 1:1747238/99‑1 (MQ=255) cTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGt < 2:3453412/99‑1 (MQ=255) cTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGt > 1:3282141/1‑99 (MQ=255) | GGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGT > NC_000913/4183162‑4183353 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |