| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 227052 | 124 (0.770) | 69 (0.460) | 17/184 | 13.1 | 37.2% | noncoding (1294/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon |
| ? | NC_000913 | 2727910 = | NA (NA) | noncoding (1275/2904 nt) | rrlG | 23S ribosomal RNA of rrnG operon | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
CGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTA > NC_000913/226954‑227085 | cGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCt > 1:2325837/1‑99 (MQ=38) gTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTc < 1:2499526/99‑1 (MQ=39) gTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTc > 1:927328/1‑99 (MQ=37) gTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGACAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTc > 1:3023394/1‑99 (MQ=255) ttCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGGGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCg > 1:2118533/1‑99 (MQ=255) ttCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATGAGAAGTGCGAATGCTGTCATAAGTAGCTATAAAGCGGGTG‑AAAAGCTCGGTCg > 1:1224246/1‑99 (MQ=11) ttCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCg > 1:2570336/1‑99 (MQ=37) ttCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCg > 1:2403281/1‑99 (MQ=38) ttCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCg > 2:383838/1‑99 (MQ=39) ttCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCg > 1:3387758/1‑99 (MQ=38) ttCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGGG‑AAAAGCCCGCTCg > 1:888489/1‑99 (MQ=255) ttCTGTAAGCCTGTGAAGGTATACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCg > 2:3861771/1‑99 (MQ=37) tGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATGAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCg > 2:4006955/1‑99 (MQ=255) tGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCg > 1:2600913/1‑99 (MQ=39) tGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCg < 2:2368532/99‑1 (MQ=39) tGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCg > 1:3547608/1‑99 (MQ=39) tAAGCCTGTGAGGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTCTCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAACGCGGGAC‑AAAAGCCCGCTCGCCGGa > 2:325386/1‑99 (MQ=11) tAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGa > 1:2548226/1‑99 (MQ=39) aaGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGTAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGaa < 1:3781344/99‑1 (MQ=255) aaGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGaa < 2:2359121/99‑1 (MQ=39) aGCCTGTGAAGGTGTACTGGGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAg > 2:1834985/1‑99 (MQ=255) gCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTTTCAGAAGTGCGAACGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGa < 2:4001434/99‑1 (MQ=255) gCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTCTCAGAAGTGCGAATGATGACATCAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCACGCTCGCAGGaaca > 2:1804023/1‑97 (MQ=11) gCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAAGCCCGCTCGCCGGAAg > 1:3655025/1‑99 (MQ=255) gCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGa > 1:2455796/1‑99 (MQ=38) gCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGa > 2:2841581/1‑99 (MQ=38) gCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGa > 2:533693/1‑99 (MQ=39) gCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGAAAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGa < 2:1601475/99‑1 (MQ=255) ccTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGAc < 1:1347104/99‑1 (MQ=37) tgtgAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCa > 2:1142276/1‑99 (MQ=38) tgtgAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCa > 1:1114381/1‑99 (MQ=38) cgtgAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCa > 1:416533/2‑99 (MQ=39) gtgAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCaa > 2:1992010/1‑99 (MQ=38) gtgAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCaa < 1:3981289/99‑1 (MQ=39) tgAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAg < 1:2334017/99‑1 (MQ=39) tgAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAg > 1:2108331/1‑99 (MQ=38) tgAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAg > 1:2931843/1‑99 (MQ=38) tgAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAg < 1:70486/99‑1 (MQ=37) tgAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAg > 1:3572276/1‑99 (MQ=39) gAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGAAATAAGTAACGATAAAGCGAGTG‑AAAAGACCGCGCGCCGGAGCACCCAgg > 1:3529920/1‑99 (MQ=14) agggTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAggg > 1:936493/3‑99 (MQ=255) aaGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAggg < 1:868784/99‑1 (MQ=39) aaGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAggg < 2:535913/99‑1 (MQ=38) gggTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGt > 1:475941/2‑99 (MQ=39) aGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGt > 1:1650179/1‑99 (MQ=38) aGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGt < 1:1606078/99‑1 (MQ=39) ggTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTTCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGAG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGtt > 2:348127/1‑99 (MQ=255) gtgtACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGGGGGCG‑AAACGACCGCTCGCAGGTGGACGAAgggaac > 1:2060778/1‑96 (MQ=14) gtgtACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTc > 2:1787931/1‑99 (MQ=39) gtgtACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTc < 1:1567334/99‑1 (MQ=39) gtgtACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTc < 1:802090/99‑1 (MQ=38) gtgtACTGTAAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTc < 2:915040/99‑1 (MQ=255) tgtACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTcc > 2:1698837/1‑99 (MQ=37) gtACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACTAAGGGTTCCt < 2:457773/99‑1 (MQ=255) gtACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCt < 2:146207/99‑1 (MQ=38) gtACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCt < 1:2623925/99‑1 (MQ=38) gtACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCt > 1:3367599/1‑99 (MQ=38) gtACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCt < 1:2133051/99‑1 (MQ=37) tACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTg < 1:3651614/99‑1 (MQ=37) tACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTg < 2:1046479/99‑1 (MQ=37) tACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTg > 1:2006386/1‑99 (MQ=37) tACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTg > 1:1323662/1‑99 (MQ=37) cTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑TAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTc > 1:931595/1‑99 (MQ=18) cTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTc > 1:3287814/1‑99 (MQ=34) cTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTc > 1:2508508/1‑99 (MQ=34) tgtgAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGGCATAAGTAAAGTTAAAGCGGGTG‑AAAAGCGCGCTCGCCGGAAGACCAGGGGTTCCTGTcc > 1:3932639/1‑99 (MQ=11) tgtgAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTcc > 1:1995952/1‑99 (MQ=34) tgtgAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTcc > 1:196972/1‑99 (MQ=34) tgtgAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTcc > 1:251473/1‑99 (MQ=33) tgtgAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTcc > 1:2760312/1‑99 (MQ=34) tgtgAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTcc > 1:117408/1‑99 (MQ=34) tgtgAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTcc > 1:2870193/1‑99 (MQ=34) tgtgAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTcc > 1:1159975/1‑99 (MQ=34) tgtgAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTcc > 1:964240/1‑99 (MQ=34) tgtgAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTcc > 1:3331213/1‑99 (MQ=34) tgtgAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTcc > 1:3243198/1‑99 (MQ=34) tgtgAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTcc > 1:515227/1‑99 (MQ=33) tgtgAAGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTcc > 1:379761/1‑99 (MQ=21) tgAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCaa < 1:2976958/99‑1 (MQ=34) tgAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCaa > 1:3369697/1‑99 (MQ=33) tgAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCaa > 1:837047/1‑99 (MQ=33) tgAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCaa > 1:2580577/1‑99 (MQ=34) tgAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCaa > 1:683886/1‑99 (MQ=33) tgAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCaa > 1:607982/1‑99 (MQ=34) gAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGTTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAAc < 1:24218/99‑1 (MQ=21) gAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAAc > 1:3989292/1‑99 (MQ=34) gAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAAc < 1:689073/99‑1 (MQ=33) gAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAAc < 2:3084941/99‑1 (MQ=33) aGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACg > 1:207795/1‑99 (MQ=33) ggTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGt < 1:1331548/99‑1 (MQ=33) ggTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGt < 2:714948/99‑1 (MQ=33) ggTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTCCCTGTCCAACGt < 1:1693399/99‑1 (MQ=18) gTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGtt > 1:727807/1‑99 (MQ=32) gTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGtt > 1:3202771/1‑99 (MQ=32) gTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGtt > 1:3010261/1‑99 (MQ=32) tATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTa > 1:2878036/1‑99 (MQ=31) tATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTa > 1:1761772/1‑99 (MQ=31) tATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTa > 1:3947078/1‑99 (MQ=31) tATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTa > 1:3186744/1‑99 (MQ=31) tATGCTGGAGGTATAAGAAGTGCGAATGCAGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AGAAGCCCGCTCGCCGGAAGTCCAAGGGTTCCTGACCAACGTTa > 1:3594941/1‑99 (MQ=11) | CGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTACTGTGAGGTATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTG‑AAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTA > NC_000913/226954‑227085 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |