| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,183,258 | G→A | E672K (GAA→AAA) | rpoB → | RNA polymerase, beta subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,183,258 | 0 | G | A | 97.5% | 515.3 / 0.4 | 158 | E672K (GAA→AAA) | rpoB | RNA polymerase, beta subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/2); new base A (69/85); total (71/87) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.54e-01 | |||||||||||
Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
GGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGG > NC_000913/4183162‑4183352 | ggCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGaaa < 2:1841612/99‑1 (MQ=255)ggCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGaaa < 1:1600616/99‑1 (MQ=255) gAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAacac < 1:892321/99‑1 (MQ=255) gAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGCTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAacac < 1:3578157/99‑1 (MQ=255) tCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGGAACACGAt < 2:1010921/99‑1 (MQ=255) tCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGAt < 1:1559359/99‑1 (MQ=255) cAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCTTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGa > 2:3585700/1‑99 (MQ=255) cAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGa < 1:3941872/99‑1 (MQ=255) cAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGAGCCCGTTCCTGAAACACGATGa < 2:76700/99‑1 (MQ=255) aGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGAc > 1:3119720/1‑99 (MQ=255) ttGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGcc < 1:1681104/99‑1 (MQ=255) gTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCaa > 1:1093823/1‑99 (MQ=255) gTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCaa > 1:1093847/1‑99 (MQ=255) tCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAAcc < 1:1959666/99‑1 (MQ=255) gCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTTGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCATGAAACACGATGACGCCAACCGTg < 1:3690739/99‑1 (MQ=255) ccGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGc < 1:2318517/99‑1 (MQ=255) cgcgACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCa < 1:2781301/99‑1 (MQ=255) gcgACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCAt < 1:1341749/99‑1 (MQ=255) cgACCAGGTTGACTACATGGACGTAGCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCAtt < 1:4030077/99‑1 (MQ=255) gACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTg > 1:317833/1‑99 (MQ=255) ccAGGTTGTCTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGAt < 2:960298/99‑1 (MQ=255) ccAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTAGGTGCGGCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCCACCGTGCATTGAt < 2:3794287/99‑1 (MQ=255) cAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATg > 1:2869763/1‑99 (MQ=255) aGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATgg < 1:2986975/99‑1 (MQ=255) ggTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATggg > 1:1802651/1‑99 (MQ=255) gTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGt < 2:3609802/99‑1 (MQ=255) ccccATAGACGTCCCCCCCCAGCGGGAGGTATCCGTCGGTGCGTCTCTGATACCGTACCTGAAACACGATGACGACAAGCGTGCATTGATTGGGGCGac < 2:2439878/96‑2 (MQ=255) cTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGaa > 1:937143/1‑99 (MQ=255) cTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGaa < 1:4066587/99‑1 (MQ=255) cATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACAt < 2:439941/99‑1 (MQ=255) cATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACAt < 2:2960879/99‑1 (MQ=255) tGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGc < 1:1166300/99‑1 (MQ=255) ggACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCa > 1:2710933/1‑99 (MQ=255) gACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCaa < 1:249367/99‑1 (MQ=255) gACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCaa < 1:2158339/99‑1 (MQ=255) gACCTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCaa < 2:3139287/99‑1 (MQ=255) aCGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGCCGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCCAc > 2:3851781/1‑99 (MQ=255) aCGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAAc > 2:432298/1‑99 (MQ=255) aCGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTAATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAAc > 2:1124385/1‑99 (MQ=255) gTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGt > 1:3984542/1‑99 (MQ=255) aTCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAACCACGATGACTCCAACCGTCCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCa > 2:2293996/1‑99 (MQ=255) aTCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCa > 1:3913760/1‑99 (MQ=255) ccACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCATGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAgg < 2:1287519/99‑1 (MQ=255) cACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGc > 1:3697197/1‑99 (MQ=255) aCCCAGCAGGTGGTATCCGTGGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCTTTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGcc > 2:2003950/1‑99 (MQ=255) aCCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGcc > 1:261776/1‑99 (MQ=255) aCCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGcc > 1:2393353/1‑99 (MQ=255) cccAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCg > 1:2061289/1‑99 (MQ=255) ccAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGt > 1:53635/1‑99 (MQ=255) gctgggtggtATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTc > 2:3870565/5‑99 (MQ=255) agcagGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTc < 2:3286125/99‑1 (MQ=255) gcagGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGTGAACATGCAACGTCAGGCCGTTcc < 1:459395/99‑1 (MQ=255) agGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGa < 2:3076464/99‑1 (MQ=255) agGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGa < 2:1584578/99‑1 (MQ=255) agGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGa < 1:975004/99‑1 (MQ=255) agGTCGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGa < 1:2260187/99‑1 (MQ=255) gtggtATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGAct > 2:2158874/1‑99 (MQ=255) gtggtATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGAct > 2:2411210/1‑99 (MQ=255) gtggtATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGAct > 2:2801091/1‑99 (MQ=255) gtggtATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGAct > 1:1074447/1‑99 (MQ=255) tggtATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGActc > 2:51762/1‑99 (MQ=255) tggtATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGActc < 2:883869/99‑1 (MQ=255) gtATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTg > 1:3879047/1‑99 (MQ=255) gtATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTg > 1:3446065/1‑99 (MQ=255) tATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTgc > 2:1667234/1‑99 (MQ=255) tATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTgc > 2:1668520/1‑99 (MQ=255) aTCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTgcg > 1:2433493/1‑99 (MQ=255) cGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTgcgcgc < 1:429461/99‑1 (MQ=255) tCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGCACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTg < 2:3966544/99‑1 (MQ=255) ggTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGAt > 1:1349355/1‑99 (MQ=255) ggTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGAt < 1:537220/99‑1 (MQ=255) gTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATa > 2:481132/1‑99 (MQ=255) tGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATaa < 1:504420/99‑1 (MQ=255) tGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATaa > 1:2210429/1‑99 (MQ=255) tGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATaa < 1:287766/99‑1 (MQ=255) tGCGTCCCTGATCCCGTGCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGACGTTCCGACTCTGCGCGCTGATaa < 2:915115/99‑1 (MQ=255) tCCCTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCg > 1:1077956/1‑99 (MQ=255) cccGGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGc > 2:3428414/1‑99 (MQ=255) ccTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCt > 1:3288327/1‑99 (MQ=255) ccTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCt > 2:1639745/1‑99 (MQ=255) ccTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCt > 2:3142041/1‑99 (MQ=255) ccTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCt > 1:150035/1‑99 (MQ=255) cTGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtg > 2:1988124/1‑99 (MQ=255) tGATGCCGTCCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtgg < 2:2809739/99‑1 (MQ=255) tGATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtgg > 1:1425301/1‑99 (MQ=255) gATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtggt > 1:3332436/1‑99 (MQ=255) gATCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtggt > 1:676842/1‑99 (MQ=255) aTCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtggtt < 1:1878442/99‑1 (MQ=255) aTCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtggtt > 2:259423/1‑99 (MQ=255) aTCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtggtt < 2:2843955/99‑1 (MQ=255) aTCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtggtt < 2:3385267/99‑1 (MQ=255) tCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtggttg < 1:1275738/99‑1 (MQ=255) tCCCGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtggttg > 1:3041370/1‑99 (MQ=255) ccGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCtggttggt < 2:1504217/99‑1 (MQ=255) cGTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTa < 1:1935860/99‑1 (MQ=255) gTTCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCACTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACACTGCGCGCTGAGAAGCCGCTGGTTGGAAc < 2:2237923/99‑1 (MQ=255) ttCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACt < 1:3812020/99‑1 (MQ=255) tCCTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTg < 1:322822/99‑1 (MQ=255) ccTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTgg < 2:1331321/99‑1 (MQ=255) ccTGAAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCCGATAAGCCGCTGGTTGGTACTgg < 1:3853685/99‑1 (MQ=255) | GGCGAATCCAGCTTGTTCAGCCGCGACCAGGTTGACTACATGGACGTATCCACCCAGCAGGTGGTATCCGTCGGTGCGTCCCTGATCCCGTTCCTGGAACACGATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGG > NC_000913/4183162‑4183352 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |