| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1622824 = | 4773 (87.380) | 12 (0.230) | 11/284 | 2.1 | 0.26% | intergenic (+83/+136) | yneM/dgcZ | inner membrane‑associated protein/diguanylate cyclase, zinc‑sensing |
| ? | NC_000913 | 1622844 = | 4764 (90.920) | intergenic (+103/+116) | yneM/dgcZ | inner membrane‑associated protein/diguanylate cyclase, zinc‑sensing | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 290 total aligned reads displayed.
ATGTGATTAACCGAGTTTAAGCTCCGTTTAACATTCATTGAGAAAACTGATGCTACTGTGTCAACGATTCGTTATCAGTGCAGGAAAATGCCTGTTAGCGTAAAAGCAAAACACAAATCTATCCATGCAAGCATTCACCGCCGGTTTACTGGCGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1622979‑1622824‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcggtGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATCACATTTTGTTCGTCAATA > NC_000913/1622844‑1622993 TGTGATTAACCGAGTTTAAGCTCCGTTTAACATTCATTGAGAAAACTGATGCTACTGTGTCAACGATTCGTTATCAGTGCAGGAAAATGCCTGTTAGCGTAAAAGCAAAACACAAATCTATCCATGCAAGCATTCACCGCCGGTTTACTGG < 1:491505/151‑1 TGTGATTAACCGAGTTTAAGCTCCGTTTAACATTCATTGAGAAAACTGATGCTACTGTGTCAACGATTCGTTATCAGTGCAGGAAAATGCCTGTTAGCGTAAAAGCAAAACACAAATCTATCCATGCAAGCATTCACCGCCGGTTTACTGG < 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2:162555/1‑150 GTGATTAACCGAGTTTAAGCTCCGTTTAACATTCATTGAGAAAACTGATGCTACTGTGTCAACGATTCGTTATCAGTGCAGGAAAATGCCTGTTAGCGTAAAAGCAAAACACAAATCTATCCATGCAAGCATTCACCGCCGGTTTACTGG > 1:613435/1‑150 GTGATTAACCGAGTTTAAGCTCCGTTTAACATTCATTGAGAAAACTGATGCTACTGTGTCAACGATTCGTTATCAGTGCAGGAAAATGCCTGTTAGCGTAAAAGCAAAACACAAATCTATCCATGCAAGCATTCACCGCCGGTTTACTGG > 1:698075/1‑150 GTGATTAACCGAGTTTAAGCTCCGTTTAACATTCATTGAGAAAACTGATGCTACTGTGTCAACGATTCGTTATCAGTGCAGGAAAATGCCTGTTAGCGTAAAAGCAAAACACAAATCTATCCATGCAAGCATTCACCGCCGGTTTACTGG > 2:26009/1‑150 GTGATTAACCGAGTTTAAGCTCCGTTTAACATTCATTGAGAAAACTGATGCTACTGTGTCAACGATTCGTTATCAGTGCAGGAAAATGCCTGTTAGCGTAAAAGCAAAACACAAATCTATCCATGCAAGCATTCACCGCCGGTTTACTGG > 2:284198/1‑150 GTGATTAACCGAGTTTAAGCTCCGTTTAACATTCATTGAGAAAACTGATGCTACTGTGTCAACGATTCGTTATCAGTGCAGGAAAATGCCTGTTAGCGTAAAAGCAAAACACAAATCTATCCATGCAAGCATTCACCGCCGGTTTACTGG > 2:326035/1‑150 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1:618645/1‑151 GTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATCACATTTTGTTCGTCAAT > 1:531409/1‑151 GTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATCACATTTTGTTCGTCAAT > 2:358917/1‑151 GTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATCACATTTTGTTCGTCAAT > 2:12611/1‑151 GTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATCACATTTTGTTCGTCAAT > 1:46351/1‑151 GTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATCACATTTTGTTCGTCAAT > 2:103952/1‑151 GTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATCACATTTTGTTCGTCAAT > 2:487806/1‑151 GTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATCACATTTTGTTCGTCAAT > 2:497071/1‑151 GTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATCACATTTTGTTCGTCAAT > 1:858229/1‑151 GTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATCACATTTTGTTCGTCAAT > 1:406208/1‑151 GTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATCACATTTTGTTCGTCAAT > 1:381474/1‑151 GTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTC < 1:268676/97‑1 GTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTC > 2:268678/1‑97 GTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGT > 2:822663/1‑93 GTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAG < 1:669852/92‑1 GTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCAC < 2:407557/61‑1 GTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCAT > 2:62549/1‑51 GTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCAT < 1:62549/51‑1 GTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGACATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATCACATTTTGTTCGTCAAT > 1:543737/1‑151 TGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATCACATTTTGTTCGTCAAT < 2:221975/150‑1 ATGTGATTAACCGAGTTTAAGCTCCGTTTAACATTCATTGAGAAAACTGATGCTACTGTGTCAACGATTCGTTATCAGTGCAGGAAAATGCCTGTTAGCGTAAAAGCAAAACACAAATCTATCCATGCAAGCATTCACCGCCGGTTTACTGGCGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1622979‑1622824‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcggtGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTCTCAATGAATGTTAAACGGAGCTTAAACTCGGTTAATCACATTTTGTTCGTCAATA > NC_000913/1622844‑1622993 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |