| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1618222 = | 1811 (41.500) | 6 (0.150) | 6/282 | 2.6 | 0.36% | intergenic (+4/+21) | ydeA/marC | arabinose efflux transporter, arabinose‑inducible/UPF0056 family inner membrane protein |
| ? | NC_000913 | 1618242 = | 1613 (39.080) | intergenic (+24/+1) | ydeA/marC | arabinose efflux transporter, arabinose‑inducible/UPF0056 family inner membrane protein | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
GCTCCGGCGCAATTATGCGGCTGGTGGGCAAGGGTGGCATTGAAGCGATCTCCCGTCTGATGGGATTCCTGCTGGTATGTATGGGTGTGCAGTTTATTATTAACGGCATCCTGGAAATCATTAAAACGTACCATTAAAAAAGGCCCGAATGGGCCTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1618379‑1618222‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggcctttTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACGGGAGATCGCTTCAATGCCACCCTTGCCCACCAGCCGCATAATTGCGCCGGAGCTGCGTAGGCTTC > NC_000913/1618242‑1618391 GCTCCGGCGCAATTATGCGGCTGGTGGGCAAGGGTGGCATTGAAGCGATCTCCCGTCTGATGGGATTCCTGCTGGTATGTATGGGTGTGCAGTTTATTATTTACGGCATCCTGGAAATCATTAAAACGTACCATTAAAAAAGGCCCGAATG > 1:27875/1‑151GCTCCGGCGCAATTATGCGGCTGGTGGGCAAGGGTGGCATTGAAGCGATCTCCCGTCTGATGGGATTCCTGCTGGTATGTATGGGTGTGCAGTTTATTATTAACGGCATCCTGGAAATCATTAAAACGTACCATTAAAAAAGGCCCGAATG > 1:320372/1‑151GCTCCGGCGCAATTATGCGGCTGGTGGGCAAGGGTGGCATTGAAGCGATCTCCCGTCTGATGGGATTCCTGCTGGTATGTATGGGTGTGCAGTTTATTATTAACGGCATCCTGGAAATCATTAAAACGTACCATTAAAAAAGGCCCGAATG > 1:436645/1‑151GCTCCGGCGCAATTATGCGGCTGGTGGGCAAGGGTGGCATTGAAGCGATCTCCCGTCTGATGGGATTCCTGCTGGTATGTATGGGTGTGCAGTTTATTATTAACGGCATCCTGGAAATCATTAAAACGTACCATTAAAAAAGGCCCGAATG > 2:18035/1‑151GCTCCGGCGCAATTATGCGGCTGGTGGGCAAGGGTGGCATTGAAGCGATCTCCCGTCTGATGGGATTCCTGCTGGTATGTATGGGTGTGCAGTTTATTATTAACGGCATCCTGGAAATCATTAAAACGTACCATTAAAAAAGGCCCGAATG > 1:501474/1‑151GCTCCGGCGCAATTATGCGGCTGGTGGGCAAGGGTGGCATTGAAGCGATCTCCCGTCTGATGGGATTCCTGCTGGTATGTATGGGTGTGCAGTTTATTATTAACGGCATCCTGGAAATCATTAAAACGTACCATTAAAAAAGGCCCGAATG > 1:513955/1‑151GCTCCGGCGCAATTATGCGGCTGGTGGGCAAGGGTGGCATTGAAGCGATCTCCCGTCTGATGGGATTCCTGCTGGTATGTATGGGTGTGCAGTTTATTATTAACGGCATCCTGGAAATCATTAAAACGTACCATTAAAAAAGGCCCGAATG > 1:195359/1‑151GCTCCGGCGCAATTATGCGGCTGGTGGGCAAGGGTGGCATTGAAGCGATCTCCCGTCTGATGGGATTCCTGCTGGTATGTATGGGTGTGCAGTTTATTATTAACGGCATCCTGGAAATCATTAAAACGTACCATTAAAAAAGGCCCGAATG > 2:583765/1‑151GCTCCGGCGCAATTATGCGGCTGGTGGGCAAGGGTGGCATTGAAGCGATCTCCCGTCTGATGGGATTCCTGCTGGTATGTATGGGTGTGCAGTTTATTATTAACGGCATCCTGGAAATCATTAAAACGTACCATTAAAAAAGGCCCGAATG > 2:652552/1‑151GCTCCGGCGCAATTATGCGGCTGGTGGGCAAGGGTGGCATTGAAGCGATCTCCCGTCTGATGGGATTCCTGCTGGTATGTATGGGTGTGCAGTTTATTATTAACGGCATCCTGGAAATCATTAAAACGTACCATTAAAAAAGGCCCGAATG > 1:64925/1‑151 CTCCGGCGCAATTATGCGGCTGGTGGGCAAGGGTGGCATTGAAGCGATCTCCCGTCTGATGGGATTCCTGCTGGTATGTATGGGTGTGCAGTTTATTATTAACGGCATCCTGGAAATCATTAAAACGTACCATTAAAAAAGGCCCGAATGG < 2:327596/151‑1 CTCCGGCGCAATTATGCGGCTGGTGGGCAAGGGTGGCATTGAAGCGATCTCCCGTCTGATGGGATTCCTGCTGGTATGTATGGGTGTGCAGTTTATTATTAACGGCATCCTGGAAATCATTAAAACGTACCATTAAAAAAGGCCCGAATG < 2:429491/150‑1 CTCCGGCGCAATTATGCGGCTGGTGGGCAAGGGTGGCATTGAAGCGATCTCCCGTCTGATGGGATTCCTGCTGGTATGTATGGGTGTGCAGTTTATTATTAACGGCATCCTGGAAATCATTAAAACGTACCATTAAAAAAGGCCCGAATG < 1:383914/150‑1 TCCGGCGCAATTATGCGGCTGGTGGGCAAGGGTGGCATTGAAGCGATCTCCCGTCTGATGGGATTCCTGCTGTTATGTATGGGTGTGCAGTTTATTATTAACGGCATCCTGGAAATCATTAAAACGTACCATTAAAAAAGGCCCGAATGGG < 2:51124/151‑1 CCGGTGCAATTATGCGGCTGGTGGGCAAGGGTGGCATTGAAGCGATCTCCCGTCTGATGGGATTCCTGCTGGTATGTATGGGTGTGCAGTTTATTATTAACGGCATCCTGGAAATCATTAAAACGTACCATTAAAAAAGGCCCGAATGGG > 1:679830/1‑150 ccGCGCAATTATGCGGGTGGTGGGAAAGGGTGGCGTTGAAGCGATCTCCCGTCTGATGGGATTCCTGCTGGTATGTATTGGTGTGCAGTTTATTATTATCGGCATCCTGGAAATCATTAAAACGTACCATTAAAAAAGGCCCGAATGatcg < 1:634237/149‑5 CGGCGCAATTATGCGGCTGGTGGGCAAGGGTGGCATTGAAGCGATCTCCCGTCTGATGGGATTCCTGCTGGTATGTATGGGTGTGCAGTTTATTATTAACGGCATCCTGGAAATCATTAAAACGTACCATTAAAAAAGGCCCGAATGGGCC < 1:74479/151‑1 CGGCGCAATTATGCGGCTGGTGGGCAAGGGTGGCATTGAAGCGATCTCCCGTCTGATGGGATTCCTGCTGGTATGTATGGGTGTGCAGTTTATTATTAACGGCATCCTGGAAATCATTAAAACGTACCATTAAAAAAGGCCCGAATGGGCC < 1:686542/151‑1 CGGCGCAATTATGCGGCTGGTGGGCAAGGGTGGCATTGAAGCGATCTCCCGTCTGATGGGATTCCTGCTGGTATGTATGGGTGTGCAGTTTATTATTAACGGCATCCTGGAAATCATTAAAACGTACCATTAAAAAAGGCCCGAATGGGCC < 1:457925/151‑1 CGGCGCAATTATGCGGCTGGTGGGCAAGGGTGGCATTGAAGCGATCTCCCGTCTGATGGGATTCCTGCTGGTATGTATGGGTGTGCAGTTTATTATTAACGGCATCCTGGAAATCATTAAAACGTACCATTAAAAAAGGCCCGAATGGGCC < 2:250100/151‑1 CGGCGCAATTATGCGGCTGGTGGGCAAGGGTGGCATTGAAGCGATCTCCCGTCTGATGGGATTCCTGCTGGTATGTATGGGTGTGCAGTTTATTATTAACGGCATCCTGGAAATCATTAAAACGTACCATTAAAAAAGGCCCGAATGGGCC < 2:311169/151‑1 CGGCGCAATTATGCGGCTGGTGGGCAAGGGTGGCATTGAAGCGATCTCCCGTCTGATGGGATTCCTGCTGGTATGTATGGGTGTGCAGTTTATTATTAACGGCATCCTGGAAATCATTAAAACGTACCATTAAAAAAGGCCCGAATGGGCC < 1:308540/151‑1 CGGCGCAATTATGCGGCTGGTGGGCAAGGGTGGCATTGAAGCGATCTCCCGTCTGATGGGATTCCTGCTGGTATGTATGGGTGTGCAGTTTATTATTAACGGCATCCTGGAAATCATTAAAACGTACCATTAAAAAAGGCCCGAATGGGCC < 2:472122/151‑1 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1:54295/150‑1 GGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACGGGAGATCGCTTCAATGCCACCCTTGCCCACCAGCCGCATAATTGCGCCGGAGCTGCGTA > 2:132849/1‑151 GGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACGGGAGATCGCTTCAATGCCACCCTTGCCCACCAGCCGCATAATTGCGCCGGAGCTGCGT < 2:588807/150‑1 GGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACGGGAGATCGCTTCAATGCCACCCTTGCCCACCAGCCGCATAATTGCGCCGGAGCTGCGT < 2:406943/150‑1 GGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACGGGAGATCGCTTCAATGCCACCCTTGCCCACCAGCCGCATAATTGCGCCGGAGCTGCGT < 1:276990/150‑1 GGCCTTTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACGGGAGATCGCTTCAATGCCACCCTTGCCCACCAGCCGCATAATTGCGCCGGAGCTGCGT < 2:234712/150‑1 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1:16578/151‑2 gTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACGGGAGATCGCTTCAATGCCACCCTTGCCCACCAGCCGCATAATTGCGCCGGAGCTGCGTAGGCT < 2:332116/149‑1 TTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACGGGAGATCGCTTCAATGCCACCCTTGCCCACCAGCCGCATAATTGCGCCGGAGCTGCGTAGGCTT > 1:216698/1‑151 TTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACGGGAGATCGCTTCAATGCCACCCTTGCCCACCAGCCGCATAATTGCGCCGGAGCTGCGTAGGCTT > 1:590424/1‑151 TTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACGGGAGATCGCTTCAATGCCACCCTTGCCCACCAGCCGCATAATTGCGCCGGAGCTGCGTAGGCTT > 1:428028/1‑151 TTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACGGGAGATCGCTTCAATGCCACCCTTGCCCACCAGCCGCATAATTGCGCCGGAGCTGCGTAGGCTT > 1:609122/1‑151 TTTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACGGGAGATCGCTTCAATGCCACCCTTGCCCACCAGCCGCATAATTGCGCCGGAGCTGCGTAGGCTT > 2:658319/1‑151 TTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACGGGAGATCGCTTCAATGCCACCCTTGCCCACCAGCCGCATAATTGCGCCGGAGCTGCGTAGGCTTC < 1:61334/151‑1 TTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACGGGAGATCGCTTCAATGCCACCCTTGCCCACCAGCCGCATAATTGCGCCGGAGCTGCGTAGGCTTC < 2:370146/151‑1 TTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACGGGAGATCGCTTCAATGCCACCCTTGCCCACCAGCCGCATAATTGCGCCGGAGCTGCGTAGGCTT > 1:111478/1‑150 TTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACGGGAGATCGCTTCAATGCCACCCTTGCCCACCAGCCGCATAATTGCGCCGGAGCTGCGTAGGCTT > 1:190623/1‑150 TTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACGGGAGATCGCTTCAATGCCACCCTTGCCCACCAGCCGCATAATTGCGCCGGAGCTGCGTAGGCTT > 2:498888/1‑150 TTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACGGGAGATCGCTTCAATGCCACCCTTGCCCACCAGCCGCATAATTGCGCCGGAGCTGCGTAGGCTT > 2:489264/1‑150 TTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACGGGAGATCGCTTCAATGCCACCCTTGCCCACCAGCCGCATAATTGCGCCGGAGCTGCGTAGGCTT > 2:321307/1‑150 TTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACGGGAGATCGCTTCAATGCCACCCTTGCCCACCAGCCGCATAATTGCGCCGGAGCTGCGTAGGCTT > 1:655274/1‑150 TTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACC > 2:88371/1‑66 TTTTAATGGTACGCTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTGATAATAGGCTGCGCACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACGTGAGATCGCTTCAATGCCACCCTTGCCCACCAGCCGCATAATTGCGCCGGAGCTGCGTAGGCTT > 1:34645/1‑150 GCTCCGGCGCAATTATGCGGCTGGTGGGCAAGGGTGGCATTGAAGCGATCTCCCGTCTGATGGGATTCCTGCTGGTATGTATGGGTGTGCAGTTTATTATTAACGGCATCCTGGAAATCATTAAAACGTACCATTAAAAAAGGCCCGAATGGGCCTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1618379‑1618222‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggcctttTTTAATGGTACGTTTTAATGATTTCCAGGATGCCGTTAATAATAAACTGCACACCCATACATACCAGCAGGAATCCCATCAGACGGGAGATCGCTTCAATGCCACCCTTGCCCACCAGCCGCATAATTGCGCCGGAGCTGCGTAGGCTTC > NC_000913/1618242‑1618391 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |