New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 1622333 | 1350 (30.940) | 12 (0.290) | 7/282 | 2.3 | 0.85% | coding (1002/1188 nt) | ydeE | putative transporter |
? | NC_000913 | = 1622355 | 1507 (36.510) | coding (1024/1188 nt) | ydeE | putative transporter | |||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 1624 total aligned reads displayed.
ATTTTTTCCGGCAACAGCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGACCGTGGGGGCAG > NC_000913/1622205‑1622504 | ttttttCCGGCAACAGCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGg > 1:358085‑M2/1‑150 (MQ=255) ttttttCCGGCAACAGCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGg > 1:687866‑M2/1‑150 (MQ=255) ttttttCCGGCAACAGCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGg > 1:60548‑M2/1‑150 (MQ=255) tttttCCGGCAACAGCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGgc > 1:539298‑M2/1‑149 (MQ=255) gCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGg > 1:325192‑M2/1‑135 (MQ=255) gCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCcg > 1:307196/1‑150 (MQ=255) gCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCcg > 1:4034/1‑150 (MQ=255) gCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCcg > 2:428528/1‑150 (MQ=255) gCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCcg > 1:514094/1‑150 (MQ=255) gCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCcg > 2:47707/1‑150 (MQ=255) cgtgatATTGTGGTGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGTTCGACCATATTGCGCCCCGAGAAATGAAAGCCAGCTATCTTTCCGCCCAGTCTTGAGGCTGGCTTGGTGCcgcg < 1:551086/146‑1 (MQ=255) cTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGa < 1:341048/151‑1 (MQ=255) cTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGa > 1:100148/1‑151 (MQ=255) 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ccAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGc < 1:649987/151‑1 (MQ=255) aaaTGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGa < 2:90529/150‑1 (MQ=255) aaTGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATg < 1:248921/151‑1 (MQ=255) aaTGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATg < 1:641157/151‑1 (MQ=255) aaGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTaaa > 2:233005/1‑151 (MQ=255) cTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAggg < 1:451079/148‑1 (MQ=255) cTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAggg < 1:47707/148‑1 (MQ=255) tttCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAg > 2:281485/1‑150 (MQ=255) cccAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGAc < 2:403816/150‑1 (MQ=255) gTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGACCGTgg > 2:664470/1‑151 (MQ=255) gTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGACCGTgg > 1:663140/1‑151 (MQ=255) gTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGACCGTgg > 2:110358/1‑151 (MQ=255) gTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGACCGTgg > 2:294780/1‑151 (MQ=255) gTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGACCGTgg > 2:439441/1‑151 (MQ=255) gTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGATGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGACCGTgg > 2:575574/1‑151 (MQ=255) tCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGACCGTggg > 1:179517/1‑151 (MQ=255) cTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGACCGTgggg > 1:72930/1‑151 (MQ=255) cTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGACCGTgggg < 1:424125/151‑1 (MQ=255) tttAGTCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTTAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCGCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGACCGTggggg < 1:143046/151‑1 (MQ=255) tttAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGACCGTggggg < 1:316329/151‑1 (MQ=255) ttAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGACCGTGGGGGc < 2:491892/151‑1 (MQ=255) ggctggctTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCCGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGACCGTGGGGGCAg > 1:390122/1‑150 (MQ=255) | ATTTTTTCCGGCAACAGCCTGCTATTGTGGGGTATGTCAGCTGCGGTATTTACTGTCGGTGAAATCATTTATGCGCCGGGCGAGTATATGTTGATTGACCATATTGCGCCGCCAGAAATGAAAGCCAGCTATTTTTCCGCCCAGTCTTTAGGCTGGCTTGGTGCCGCGATTAACCCATTAGTGAGTGGCGTAGTGCTAACCAGCCTGCCGCCTTCCTCGCTGTTTGTCATCTTAGCGTTGGTGATCATTGCTGCGTGGGTGCTGATGTTAAAAGGGATTCGAGCAAGACCGTGGGGGCAG > NC_000913/1622205‑1622504 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |