| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,966,174 | IS1 (–) +9 bp | intergenic (+84/‑235) | trxA → / → rho | thioredoxin 1/transcription termination factor |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3583428 = | NA (NA) | 36 (1.040) | 29/296 | 0.1 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3966174 = | 0 (0.000) | intergenic (+84/‑243) | trxA/rho | thioredoxin 1/transcription termination factor | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | 44 (1.270) | 32/296 | 0.1 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3966182 | 0 (0.000) | intergenic (+92/‑235) | trxA/rho | thioredoxin 1/transcription termination factor | |||||
CAACCAAAGTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATCCGTCTTGTCGTTTCAGTTCTGCGTACTCTCCTGTGACCAGGCAGCGAAAAGACATG > NC_000913/3966026‑3966323 | cAACCAAAGTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAAc < 1:217103/151‑1 (MQ=255) tagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATAc < 1:393784‑M2/7‑1 (MQ=255) tagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATAc < 1:422844‑M2/7‑1 (MQ=255) aaaGTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATAcc < 1:26889/151‑1 (MQ=255) gcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATAc > 2:419503‑M2/143‑149 (MQ=255) gTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTgg < 2:9937‑M2/151‑3 (MQ=255) tGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggt < 1:116800‑M2/151‑4 (MQ=255) ggTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggta > 1:47959‑M2/1‑146 (MQ=255) ggTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggta > 2:531463‑M2/1‑146 (MQ=255) cTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgact < 1:306545‑M2/150‑11 (MQ=255) gTCTAATGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCACGGCGTGAGTCATGCTAACTCAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactaca < 1:143166‑M2/151‑14 (MQ=255) gTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactcca < 2:177410‑M2/151‑14 (MQ=255) gTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactcca < 2:226509‑M2/151‑14 (MQ=255) gTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactcca < 1:337167‑M2/151‑14 (MQ=255) gTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactcca < 1:106721‑M2/151‑14 (MQ=255) gTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactcca < 1:521372‑M2/151‑14 (MQ=255) gTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactcca < 1:182807‑M2/151‑14 (MQ=255) cTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactccaac > 1:224174‑M2/1‑136 (MQ=255) gagTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactccaacttattgatagtgtttta < 1:80399‑M2/151‑33 (MQ=255) agTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactccaacttattgatagtgtttta > 1:164440‑M2/1‑118 (MQ=255) gTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatg < 2:149614‑M2/151‑35 (MQ=255) ttCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttat > 2:432299‑M2/1‑116 (MQ=255) ccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCCTGTAATTTCCAACGCTTc > 1:517815‑M2/108‑150 (MQ=255) ccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGt > 1:427130‑M2/105‑151 (MQ=255) aCGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagata > 1:52‑M2/1‑109 (MQ=255) aCGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagata > 1:359303‑M2/1‑109 (MQ=255) aCGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagata > 1:114720‑M2/1‑109 (MQ=255) aCGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagat > 1:357918‑M2/1‑109 (MQ=255) cGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataa < 1:470773‑M2/151‑44 (MQ=255) gtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCtt > 1:150917‑M2/97‑151 (MQ=255) aaCCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcc > 1:526533‑M2/1‑104 (MQ=255) gaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATg > 1:537288‑M2/91‑150 (MQ=255) gCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatg > 1:52449‑M2/1‑98 (MQ=255) tAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactt < 2:551028‑M2/151‑57 (MQ=255) ggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGt > 2:24864‑M2/86‑151 (MQ=255) gagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGa < 2:475439‑M2/63‑1 (MQ=255) gagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAg < 1:384124‑M2/65‑1 (MQ=255) gagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAg < 1:185204‑M2/65‑1 (MQ=255) tttCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgc > 2:418706‑M2/1‑87 (MQ=255) gctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGAtt > 1:190804‑M2/77‑151 (MQ=255) ctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGAtt < 1:522121‑M2/75‑1 (MQ=255) aTGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcag < 1:19936‑M2/149‑67 (MQ=255) tGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctc > 2:357778‑M2/1‑82 (MQ=255) tCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccac > 1:259687‑M2/1‑79 (MQ=255) aaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGc < 2:532591‑M2/81‑1 (MQ=255) ccccGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGGGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgatttt < 1:356875‑M2/151‑80 (MQ=255) ccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTc < 2:392753‑M2/90‑1 (MQ=255) ccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCaa > 1:67935‑M2/60‑151 (MQ=255) cactggagcacctcaaaaacaccatcatccactaaatcagtaagttggaagcatcaccAACCTACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAACTGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAAt > 1:456594‑M2/59‑151 (MQ=255) actggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATc < 1:390613‑M2/94‑1 (MQ=255) ctggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATcc < 2:162653‑M2/95‑1 (MQ=255) ggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGc < 1:193633‑M2/40‑1 (MQ=255) ggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCTCATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGc > 2:193637‑M2/55‑94 (MQ=255) agcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATCCGTc < 2:444675‑M2/98‑1 (MQ=255) accatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATCCGTCTTGTCGTTTCAGTTc < 1:178169‑M2/113‑1 (MQ=255) accatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATCCGTCTTGTCGTTTCAGTTc < 2:356883‑M2/113‑1 (MQ=255) accatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATCCGTCTTGTCGTTTCAGTTc < 1:432367‑M2/113‑1 (MQ=255) ccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATCCGTCTTGTc < 2:445708‑M2/103‑1 (MQ=255) ccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATCCGTCTTGTc > 1:445698‑M2/38‑140 (MQ=255) ccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATCCGTCTTGTCGTTTCAGtt > 1:539673‑M2/38‑149 (MQ=255) atcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATCCGTCTTGTCGTTTCAGTTCTg > 1:386332‑M2/36‑150 (MQ=255) atcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATCCGTCTTGTCGTTTCAGTTCTg > 1:84060‑M2/36‑150 (MQ=255) catacactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATCCGTCTTGTCGTTTCAGTTCtgcat < 1:345266‑M2/118‑3 (MQ=255) aGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtg < 1:451244‑M2/151‑111 (MQ=255) aGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtg < 1:33356‑M2/151‑111 (MQ=255) gTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtg < 1:382787‑M2/150‑111 (MQ=255) cactaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATCCGTCTTGTCGTTTCAGTTCTGCGTAct > 1:261571‑M2/30‑150 (MQ=255) actaaatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATCCGTCTTGTCGTTTCAGTTCTGCGTActct < 1:380877‑M2/123‑1 (MQ=255) tGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccagg > 2:279203‑M2/1‑36 (MQ=255) gCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggt < 1:304352‑M2/151‑117 (MQ=255) cTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtg > 1:348902‑M2/1‑34 (MQ=255) tAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgc > 2:337101‑M2/1‑33 (MQ=255) aatcagtaagttggcagcatcaccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATCCGTCTTGTCGTTTCAGTTCTGCGTACTCTCCtg < 2:261575‑M2/127‑1 (MQ=255) aaCTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtg < 2:475819‑M2/149‑118 (MQ=255) aagttggcagcatcaccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATCCGTCTTGTCGTTTCAGTTCTGCGTACTCTCCTGTGACCAg > 2:78369‑M2/18‑151 (MQ=255) aCTTCGTATTAAACATACCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattc > 2:476952‑M2/1‑20 (MQ=255) tCGTATTAAACATACCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccgccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggt > 2:197507‑M2/1‑17 (MQ=255) tCGTATTAAACATACCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggt > 1:21443‑M2/1‑17 (MQ=255) ttAAACATACCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgc > 1:355455‑M2/1‑12 (MQ=255) ccAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATCCGTCTTGTCGTTTCAGTTCTGCGTACTCTCCTGTGACCAGGCAGCGAAAAGACAt > 1:105040‑M2/3‑151 (MQ=255) aaaCATACCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccg < 2:493458‑M2/151‑142 (MQ=255) | CAACCAAAGTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATCCGTCTTGTCGTTTCAGTTCTGCGTACTCTCCTGTGACCAGGCAGCGAAAAGACATG > NC_000913/3966026‑3966323 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |