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< 1:1322790‑M1/141‑129 (MQ=255) ATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTCTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGa > 1:525537‑M1/1‑141 (MQ=255) tttGTGACActacatacagcatttgtcacaaaaataagacagtacttttttataaaaaatcaacaaaaaagacattagtcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattgaatg < 2:526362‑M1/141‑133 (MQ=255) tttGTGACAcaatatattgagtttgtcttatttttgtgacactacatacagcatttgtcacaaaaataagacagtacttttttataaaaaatcaacaaaaaagacattagtcaacactaatgtcttaaataataattttgc < 2:1452604‑M1/141‑133 (MQ=255) TTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATtgt < 2:1325548‑M1/56‑1 (MQ=255) TTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCt < 1:691443‑M1/141‑1 (MQ=255) tgtgACActacatacagcatttgtcacaaaaataagacagtacttttttataaaaaatcaacaaaaaagacattagtcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattgaatgtg > 2:1412637‑M1/1‑7 (MQ=255) 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< 2:876143‑M1/140‑137 (MQ=255) TGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCa > 2:20662‑M1/1‑141 (MQ=255) gACActacatacagcatttgtcacaaaaataagacagtacttttttataaaaaatcaacaaaaaagacattagtcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattgaatgtgctt > 3:14819‑M1/1‑4 (MQ=255) gACActacatacagcatttgtcacaaaaataagacagtacttttttataaaaaatcaacaaaaaagacattagtcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattgaatgtgctt > 2:1234261‑M1/1‑4 (MQ=255) acactacatacagcatttgtaacacaaagaagacagtacttttttataaaaaatcaacaaaaaagacattagtcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaattgcggtaattgaatgtgcttt > 2:1658784‑M1/1‑3 (MQ=255) acacaatatattgcgtttgtcttatttttgtgacactacatacagcatttgtcacaaaaataagacagtacttttttataaaaaatcaacaaaaaagacattagtcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcg > 3:35374‑M1/1‑3 (MQ=255) aCAAATGCTGTATGTAGtgtcacaaaaataagacagtacttttttataaaaaatcaacaaaaaagacattagtcaacactaatgtcttaaataataattttgcttttcgaaattccaaatttcggtaatttaatgtgcttt < 4:326040‑M2/141‑125 (MQ=255) ACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCAtt > 1:198662‑M1/1‑141 (MQ=255) CAAATGCTGTATTTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCAttt > 3:189542‑M1/1‑141 (MQ=255) | ACAACAGACGAAGAAGAAAAAGCACATTCAATTACCGCAATTTGGAATTTCGAAAAGCAAA‑‑‑ATTATTATTTAAGACATTAGTGTTGACTAATGTCTTTTTTGTTGATTTTTTATAAAAAAGTACTGTCTTATTTTTGTGACAAATGCTGTATGTAGTGTCACAAAAATAAGACAAACGCAATATATTGTGTCACAAAAATAAGACAGTACAGCTTTGTATGATATCACTTTAAAATACCTTAAAACCCCTGGAATTTCTGGCTTTGCCAGACCTATCATTTT > NC_012417/916‑1197 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |