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atTAAGAACCCCCAGCATATGCTTTATATAGCTTGCTGGGGGTTTCTCATACAATATGGATCGAGCATCTTGCATGTATAAACAAATAGGCTATTCAAAGTAAAATTACTCAAACTTTGAATAGCCTTTCCTCTTCAAATa < 3:302458/141‑1 (MQ=255) atTAAGAACCCCCAGCATATGCTTTATATAGCTTGCTGGGGGTTTCTCATACAATATGGATCGAGCATCTTGCATGTATAAACAAATAGGCTATTCAAAGTAAAATTACTCAAACTTTGAATAGCCTTTCCTCTTCAAATa > 1:1179247/1‑141 (MQ=255) ttAAGAACCCCCAGCATATGCTTTATATAGCTTGCTGGGGGTTTCTCATACAATATGGATCGAGCATCTTGCATGTATAAACAAATAGGCTATTCAAAGTAAAATTACTCAAACTTTGAATAGCCTTTCCTCTTCAAATAg > 1:1585806/1‑141 (MQ=255) aCCCCCAGCAagctatataaagcatatgctgggggttcttaatattttaaaaattattgttagattatatatatcgtcgctttttctaaaacaatctcatcgcatgaaattttttcttcctagagacctttaataagatta > 1:967656‑M1/1‑10 (MQ=255) cccccAGCAagctatataaagcatatgctgggggttcttaatattttaaaaattattgttagattatatatatcgtcgctttttctaaaacaatctcatcgcatgaaattttttcttcctagagacctttaataagattaa > 1:273317‑M1/1‑9 (MQ=255) ccAGCATATGCTTTATATAGCTTGCTGGGGGTTTCTCATACAATATGGATCGAGCATCTTGCATGTATAAACAAATAGGCTATTCAAAGTAAAATTACTCAAACTTTGAATAGCCTTTCCTCTTCAAATAGTCtttattta > 4:179147/1‑141 (MQ=255) cAGCAagctatataaagcatatgctgggggttcttaatattttaaaaattattgttagattatatatatcgtcgctttttctaaaacaatctcatcgcatgaaattttttcttcctagagacctttaataagattaatagt < 1:747518‑M1/141‑137 (MQ=255) cAGCAagctatataaagcatatgctgggggttcttaatattttaaaaattattgttagattatatatatcgtcgctttttctaaaacaatctcatcgcatgaaattttttcttcctagagacctttaataagattaatagt < 1:215540‑M1/141‑137 (MQ=255) aGCAagctatataaagcatatgctgggggttcttaatattttaaaaattattgttagattatatatatcgtcgctttttctaaaacaatctcatcgcatgaaattttttcttcctagagacctttaataagattaatagtt > 2:618183‑M1/1‑4 (MQ=255) aGCAagctatataaagcatatgctgggggttcttaatattttaaaaattattgttagattatatatatcgtcgctttttctaaaacaatctcatcgcatgaaattttttcttcctagagacctttaataagattaatagtt < 4:520106‑M1/141‑138 (MQ=255) gCAagctatataaagcatatgctgggggttcttaatattttaaaaattattgttagattatatatatcgtcgctttttctaaaacaatctcatcgcatgaaattttttcttcctagagacctttaataagattaatagttt > 2:1518586‑M1/1‑3 (MQ=255) gCAagctatataaagcatatgctgggggttcttaatattttaaaaattattgttagattatatatatcgtcgctttttctaaaacaatctcatcgcatgaaattttttcttcctagagacctttaataagattaatagttt > 2:1517799‑M1/1‑3 (MQ=255) aagctatataaagcatatgctgggggttcttaatattttaaaaattattgttagattatatatatcgtcgctttttctaaaacaatctcatcgcatgaaattttttcttcctagagacctttaataagattaatagtttac < 1:1312990‑M1/141‑141 (MQ=255) | TATCTAGATATGATTAAGTAAACTATTAATCTTATTAAAGGTCTCTAGGAAG‑AAAAAATTTCATGCGATGAGATTGTTTTAGAAAAAGCGACGATATATATAATCTAACAATAATTTTTAAAATATTAAGAACCCCCAGCATATGCTTTATATAGCTTGCTGGGGGTTTCTCATACAATATGGATCGAGCATCTTGCATGTATAAACAAATAGGCTATTCAAAGTAAAATTACTCAAACTTTGAATAGCCTTTCCTCTTCAAATAGTCTTTATTTAAATTG > USA300TCH1516_ALE/2057247‑2057527 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |