| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | USA300TCH1516_ALE | 4,449 | 0 | C | A | 8.0% | 782.1 / 11.8 | 240 | Q171K (CAA→AAA) | recF | DNA replication and repair protein RecF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (116/99); new base A (2/23); total (118/122) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.81e-06 | |||||||||||
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Only 100 of 245 total aligned reads displayed.
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USA300TCH1516_ALE/4309‑4588 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |