| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | USA300TCH1516_ALE | 2,468,875 | 0 | C | A | 6.9% | 649.4 / 9.1 | 199 | intergenic (‑64/‑144) | lipY/USA300HOU_RS12715 | Triacylglycerol lipase/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (91/91); new base A (2/15); total (93/106) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.16e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 201 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |