Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | USA300TCH1516_ALE | 2,744,213 | 0 | T | A | 5.8% | 804.9 / 26.8 | 236 | intergenic (+150/+43) | fda/mqo2 | Fructose‑bisphosphate aldolase class 1/putative malate:quinone oxidoreductase 2 |
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Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
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2:98744/1‑141 (MQ=255) ttAAGATTT‑CTCAGTTGTCCGATTTTAAATATAGCTATTAGAATTTAGTTTTCGTAGTAACCTAATTCTAAGTCTTTTGAAGTTTGTTTACGGATTTTTCTCATTAATTTTTCGTCTTCAATTAATGATTCACCGTatgat > 4:651385/1‑141 (MQ=255) tAAGATTT‑CTCAGTTGTCCGATTTTAAATATAGCTATTAGAATTTAGTTTTCGTAGTAACCTAATTCTAAGTCTTTTGAAGTTTGTTTACGGATTTTTCTCATTAATTTTTCGTCTTCAATTAATGATTCACCGTatgatg > 4:505469/1‑141 (MQ=255) | TAAACTATTTTTTGATATAAACTACTAAAAAGGACTCATACATGTGCTTTAAAGGCATTGTGTATGAGTCTTTTTTGATTAAAGTTGATTTTGCCGTATGTATTAGATTACGT‑‑‑AAAAAAATCGGACAGCTGAAAAATCTTTAAGATTT‑CTCAGTTGTCCGATTTTAAATATAGCTATTAGAATTTAGTTTTCGTAGTAACCTAATTCTAAGTCTTTTGAAGTTTGTTTACGGATTTTTCTCATTAATTTTTCGTCTTCAATTAATGATTCACCGTATGATG > USA300TCH1516_ALE/2744073‑2744353 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |