Predicted mutation | |||||||
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* | USA300TCH1516_ALE | 622,359 | 0 | T | C | 5.1% | 915.6 / 11.2 | 389 | D974D (GAT→GAC) | sdrE | Serine‑aspartate repeat‑containing protein E |
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Only 100 of 421 total aligned reads displayed.
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gACTCAGATGCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGATTCAGa < 1:1832923/134‑1 (MQ=255) cTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTAAGACAGCGATTAAGACt > 1:1273917/1‑134 (MQ=255) cTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAAAGAACAACGTGTAGAGAGCGAATCAGAGTCAGACAGCGACTCAGACt > 2:2030445/1‑134 (MQ=11) tcagattcagatAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGATTCAGACTc < 1:1398992/134‑1 (MQ=255) gattcagatAGCGACTCAGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGa < 2:1419072/134‑1 (MQ=255) | CACTTGATAACGGATACTTCGAAGAAGATACATCAGACAGCGATTCAGACTCAGATAGTGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGAT > USA300TCH1516_ALE/622226‑622491 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |