Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | USA300TCH1516_ALE | 1,435,071 | 0 | C | T | 11.8% | 444.7 / 13.1 | 203 | T143I (ACT→ATT) | dapH | 2,3,4,5‑tetrahydropyridine‑2,6‑dicarboxylate N‑acetyltransferase |
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Only 100 of 205 total aligned reads displayed.
CGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTACGTGTT > USA300TCH1516_ALE/1434939‑1435204 | gTTTATTAAAGAACAAGTAATGATTGAAGTTGGTGGTGTCGTTATGGTGGGGGCAAAAGTTAATATGGGCGTAGTGGTTGGGGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTg < 2:1367921/134‑1 (MQ=255) tttATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATACTACTCTCGGTGGTCGCGGTATAACtaa > 2:2190969/1‑132 (MQ=255) ttattaGAGAGCAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGt < 1:751529/134‑1 (MQ=255) attaGAGAACAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGACGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTaa > 1:722111/1‑134 (MQ=255) taGATAACAAGCCATTATTGAAGATGGTGTTGTCTTTATGATGTGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTaaaa < 1:974739/134‑1 (MQ=255) aaCAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTa > 1:1641190/1‑134 (MQ=255) cAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGCCCTACAATTCAAAAAAATATACa > 2:2658062/1‑134 (MQ=255) aaGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTGTAGGTAGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACAt > 1:1952298/1‑134 (MQ=255) aaGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTCCTACAACTAATAAAAATGTACAt > 2:2015004/1‑134 (MQ=255) aaGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTAGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACAt > 1:110315/1‑134 (MQ=255) ccATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGGTATAACTGGTAAAAATGTatctttt > 2:1710565/1‑128 (MQ=255) ccATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGGTACAATTAATAAAAATGTACAAGTa > 2:2692783/1‑134 (MQ=255) ccATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAACAATGTACATGTa > 1:2537883/1‑134 (MQ=255) ccATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTa > 1:612483/1‑134 (MQ=255) ccATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTa > 1:1783087/1‑134 (MQ=255) ccATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTa > 1:1527636/1‑134 (MQ=255) 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atgGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGAt < 1:1977785/134‑1 (MQ=255) atgGGCGCAACAAGTGAGATTGGCGCAGTCGTCGGCGAAGGTACAATGATTGATATGACTGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGAt < 2:1775108/134‑1 (MQ=255) aagggCGGAACAATTAATGTTGGCGCAGGCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAAGGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTTGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGAt < 1:1325865/132‑1 (MQ=255) tttgcgcAACAATTAATATTGGCGCAGTTGTTGGAACAGTAACAATGATGGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGAtt < 1:532919/131‑1 (MQ=255) gcAATAATTAGTAATGGGTCTGTATTTGTCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGATACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCCGTATTAGCAGGTGTGATTGAAcc < 2:2292996/134‑1 (MQ=255) aaTTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGGTATCACTAAAAAAAAAAAACATGTAAAGGCAGGCACAGCATTAGCCAGTAAGATTGAAaccccaa > 2:2485415/1‑132 (MQ=255) 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aCTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGTTATGATTGAAACCAATAGTGATTCACCGGATATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGt > 1:837321/1‑134 (MQ=255) ctctCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGAAAATGCAGtt > 1:208074/1‑134 (MQ=255) tctcGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTa < 1:1557875/134‑1 (MQ=255) actcGGGGGGCGTGCTACAAGTGGTAAAAATGGACTGGTAGGGGGTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACTCCCTAGTGCTTCACGGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCGAATGCAGTTa < 2:62346/133‑1 (MQ=255) tcGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGTGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTAtt < 1:2305089/134‑1 (MQ=255) ggtggtCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATAGGTGCAAATGCAGTTAtttt > 1:76252/1‑134 (MQ=255) tggtCGTGCTACAACTGGTAAAAATATAGCTCTGTGTGCTGGCTTAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAg < 1:1220957/134‑1 (MQ=255) tagtCGTGATACAACTCGTATAAATGTATATTTAATGGCTGGCTTAGTATTAGCAGGTGTGATTGATCCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGTATGATGTATTAATCTGTTCTTATGCAGTTATTTTac < 2:1928745/132‑2 (MQ=255) aggtAGTGCTACAACTGGTGATACTTCACATGTGTGGTCTGGTGTAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGTTGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAg < 2:1397838/133‑1 (MQ=255) gTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGgt > 1:1879889/1‑134 (MQ=255) cTACAACTGGTAAAAATGTTTTTGTAGGGGTTGGTGTAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACAGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTa < 1:1500895/134‑1 (MQ=255) aaCTGGTAAAAATGTACGTGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTACgtg < 2:1430724/134‑1 (MQ=255) | CGTTTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTACGTGTT > USA300TCH1516_ALE/1434939‑1435204 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |