| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | USA300TCH1516_ALE | 1,435,074 | 0 | G | A | 11.0% | 470.0 / 7.1 | 207 | G144D (GGT→GAT) | dapH | 2,3,4,5‑tetrahydropyridine‑2,6‑dicarboxylate N‑acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (70/99); new base A (31/2); total (101/106) | |||||||||||
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Only 100 of 215 total aligned reads displayed.
TTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTACGTGTTGGT > USA300TCH1516_ALE/1434942‑1435207 | ttattaGAGAGCAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGt < 1:751529/134‑1 (MQ=255)ttattaGAGAACAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCTCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTGCTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGt < 1:416068/134‑1 (MQ=255)ttattaGAGAACAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGt < 1:1732708/134‑1 (MQ=255) attaGAGAACAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGACGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTaa > 1:722111/1‑134 (MQ=255) aaGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACAt > 2:116145/1‑134 (MQ=255) aaGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTAGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACAt > 1:110315/1‑134 (MQ=255) aGCCATTATTGTAGATGGTGCTGTTGTTATGATGTGTGTAATAATTAATATTGGCGTTGTAGTTGGGGAAGGGACAATGAGTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATg < 1:670809/134‑1 (MQ=255) gCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGATAAaaatgtaaatgt > 2:1698075/1‑134 (MQ=255) ccATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTa > 1:1527636/1‑134 (MQ=255) ccATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTa > 2:1366639/1‑134 (MQ=255) ccATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTa > 1:612483/1‑134 (MQ=255) ccATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATATACATGTa > 2:236823/1‑134 (MQ=255) ccATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTCGTACCACTAATAAAAATATACATGTa > 2:1344741/1‑134 (MQ=255) ccATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGCACTACCACTAGAAAAAAAACACATGTa > 2:2231710/1‑134 (MQ=255) ccATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTAGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTa > 1:1391547/1‑134 (MQ=255) cATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACACTTAATATTGGCGCAGTCGTTGACGAAGGTACAATGATAGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAg > 1:1022504/1‑134 (MQ=255) 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TTATTAGAGAACAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTACGTGTTGGT > USA300TCH1516_ALE/1434942‑1435207 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |