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cTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTTTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTACgtgct < 2:758150/134‑3 (MQ=255) tGGTAAAAATGTACATTTAGGGGCTGGTGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTACGTGTTg < 1:2118278/134‑1 (MQ=255) tGGTAAAAATGTACATGTAGGTGTTGGCGTAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCAGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTACGTGTTg < 1:1975765/134‑1 (MQ=255) tGGTAAAAATGTACATGTAGGGTCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAAACGAGGAGGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTACGTGTTg < 1:889373/134‑1 (MQ=255) ggTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGTCGTAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCTAGGATGATGTATTAATCTGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTACGTGTTgg < 2:1348349/134‑1 (MQ=255) ggTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCTCCTAGTTCTTTTCTTGTTATAATTGATGATTATGTATTAATCGGTGAAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTACGTGTTgg < 1:616696/134‑1 (MQ=255) gTAAAAATGTACATGTAGGGGTTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCTCTAGTGCTTCACTGGTTATAATCGAGGATGATGTATTACTCGGTGCCGGTATGGTTATTTTAGAAGGTGTACGTGTTGGt < 1:556533/134‑1 (MQ=255) tacaaaTGGACATGTAGGGGGTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCTCTAGTGCTTTACCGGTTATAATCGTGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTACGTGTTGGTa < 2:427632/131‑1 (MQ=255) agaagggTATATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCTGGTGTGAGTGAACCCCCTAGTGCTTCGCCGGTGATAATCGAGGATGATGTATTAGTCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGTAGGTGTACGTGTTGGTaa < 2:82646/128‑1 (MQ=255) aaaaTGTACATGTAGGGGATGGCGCACTACGAGCAGGGGGGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATATTAGAAGGTGTACGTGTTGGTaaa > 1:2730419/1‑134 (MQ=255) aaTGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTACGTGTTGGTAAAgg > 1:1965374/1‑134 (MQ=255) aaTGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTACGTGTTGGTAAAgg > 1:2592313/1‑134 (MQ=255) | AACAAGCCATTATTGAAGATGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCTTCACCGGTTATAATCGAGGATGATGTATTAATCGGTGCAAATGCAGTTATTTTAGAAGGTGTACGTGTTGGTAAAGGT > USA300TCH1516_ALE/1434951‑1435213 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |