Missing coverage evidence...
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*	*	÷	USA300TCH1516_ALE	2176683–2181135	2181135	1–4453	14 [13]	[13] 14	ilvA/USA300TCH1516_02069	L‑threonine dehydratase biosynthetic IlvA/tRNA‑Gly

CTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAAATTATACATTCAAAACTAGATAGTAAGTAAAAGTGATTTTGCTTCGCAAAACATTTATTTTGATTAAGTCTTCGATCGATTAGTATTCGTCAGCTCCACATGTCACCATGCTTCCACCTCGAACCTATTAACCTCA  >  USA300TCH1516_ALE/2176542‑2176711                                                                                                                                             |                              ctcctTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAAATTATACATTCAAAACTAGATAGTAAGTAAAAGTGATTTTGCTTCGCAAAACATTTATTTTGATTAAGTCTTCGATCGATTAGTATTGGTCAGCTCCACATGTCAcc                               >  1:277949/1‑141 (MQ=17)     ttGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAAATTATACATTCAAAACTAGATAGTAAGTAAAAGTGATTTTGCTTCGCAAAACATTTATTTTGATTAAGTCTTCGATCGATTAGTATTCGTCAGCTCCACATGTCACCATGc                           <  2:429854/141‑1 (MQ=32)       gCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAAATTATACATTCAAAACTAGATAGTAAGTAAAAGTGATTTTGCTTCGCAACACATTTATTTTGATTAAGTCTTCGATCGATTCGTATTCGTCAGCTCCACATGTCCCCAGGCtt                         >  1:196426/1‑141 (MQ=255)        cTATAGTCACCAGACATATGAATGTAAATTATACATTCAAAACTAGATAGTAAGTAAAAGTGATTTTGCTTCGCAAAACATTTATTTTGATTAAGTCTTCGATCGATTAGTATTCGTCAGCTCCACATGTCACCATGCTTc                        >  1:323054/1‑141 (MQ=32)             gTCACCAGACATATGAATGTAAATTATACATTCAAAACTAGATAGTAAGTAAAAGTGATTTTGCTTCGCAAAACATTTATTTTGATTAAGTCTTCGATCGATTAGTATTCGTCAGCTCCACATGTCACCATGCTTCCACCt                   <  1:395195/141‑1 (MQ=32)              tCACCAGACATATGAATGTAAATTATACATTCAAAACTAGATAGTAAGTAAAAGTGATTTTGCTTCGCAAAACATTTATTTTGATTAAGTCTTCGATCGATTAGTATTCGTCAGCTCCACATGTCACCATGCTTCCACCTc                  >  1:147580/1‑141 (MQ=32)                  cAGACATATGAATGTAAATTATACATTCAAAACTAGATAGTAAGTAAAAGTGATTTTGCTTCACAAAACATTTATTTTGATTAAGTCTTCGATCGATTAGTATTCGTACGCTCCACATCTCACCATGCTGCAACCTCgctc              >  2:101228/1‑138 (MQ=11)                     aCATATGAATGTAAATTATACATTCAAAACTAGATAGTAAGTAAAAGTGATTTTGCTTCGCAAAACATTTATTTTGATTAAGTCTTCGATCGATTAGTATTCGTCAGCTCCACATGTCACCATGCTTCCACCTCGAACCTa           >  1:145117/1‑141 (MQ=32)                      cATATGAATGTAAATTATACATTCAAAACTAGATAGTAAGTAAAAGTGATTTTGCTTCGCAAAACATTTATTTTGATTAAGTCTTCGATCGATTAGTATTCGTCAGCTCCACATGTCACCATGCTTCCACCTCGAACCTAt          >  1:80539/1‑141 (MQ=32)                       ttatTAATGTAAATTATACATTGAAAACTAGATAGTAAGTAAAAGTGATTTTGCTTCGCAAAACATTTATTTTGATTAAGTCTTCGATCGATTAGTATTCGTCAGCTCCACATGTCACCATGCTTCCACTTCGAACCTAtt         <  2:132407/140‑1 (MQ=12)                       atatGAATGTAAATTATACATTCAAAACTAGATAGTAAGTAAAAGTGATTTTGCTTCGCAAAACATTTATTTTGATTAAGTCTTCGATCGATTAGTATTCGTCAGCTCCACATGTCACCATGCTTCCACCTCGAACCTAtt         <  1:488235/141‑1 (MQ=32)                             aTGTAAATTATACATTCAAAACTAGATAGTAAGTAAAAGTGCTTTTGCTTCGCAAAACATTTATTTTGATTAAGTCTTCGATCGATTAGTATTCGTCAGCTCCACATGTCACCATGCTTCCACCTCGAACCTCTTAACCtc   >  1:25553/1‑141 (MQ=17)                             aTGTAAATTATACATTCAAAACTAGATAGTAAATAAAAGTGATTTTGCTTCGCAAAACATTTATTTTGATTAAGTCTTCTATCGATTAGTATTCGTAGGCTCCAAATGTCACTATACTTCCACATCGATCCTACTCACCta   >  2:366761/1‑140 (MQ=11)                              tgtagtgtattCATTCAAAACTATATAATAAGTAAAAGTGAGATCGCATCGCAAAACATTTATTTTGCTCAAGTCTTCGATCGATTAGTATTCGTCAGCTCCACATGTCACCATGCTTCCACCTCGAACCTATTAACCtca  <  2:352089/134‑1 (MQ=1)                                                                                                                                             |                              CTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAAATTATACATTCAAAACTAGATAGTAAGTAAAAGTGATTTTGCTTCGCAAAACATTTATTTTGATTAAGTCTTCGATCGATTAGTATTCGTCAGCTCCACATGTCACCATGCTTCCACCTCGAACCTATTAACCTCA  >  USA300TCH1516_ALE/2176542‑2176711

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑