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| * | USA300TCH1516_ALE | 618,657 | 0 | T | C | 6.9% | 864.6 / 9.1 | 394 | D1253D (GAT→GAC) | sdrD | Serine‑aspartate repeat‑containing protein D |
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Only 100 of 440 total aligned reads displayed.
GACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGAC‑TCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCGGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCGGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGCGATTC > USA300TCH1516_ALE/618517‑618797 | gacagcgactcagactcagacagcgactcagactcaGATAGTGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGAC‑TCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGATAGCGACtcagat > 1:3078000/1‑141 (MQ=255) cagcgactcagactcagacagcgactaagactcagaTAGTCACTCAGATTCAGATAGAGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGAC‑TCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGATAGCGACtcagattc < 1:4212207/141‑1 (MQ=255) cagcgacgcagacacagacagcgactccgactcagaTAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGAC‑TCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGATAGCGACtcagattc < 1:3470356/141‑1 (MQ=255) gcgactcagattcagacggagactcagactcagaTAGCGATTGAGATCAAGATACCGACTCAGATTCGGACAGCGATTCAGACTCAGATAGCGAC‑TCAGATTCAGATAGCGATTCGGACTCAGATAGCGACtcagattcag < 2:3127445/141‑1 (MQ=14) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |