| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | USA300TCH1516_ALE | 2,028,652 | 0 | C | T | 9.6% | 681.5 / 50.6 | 274 | intergenic (‑8/+7) | USA300HOU_RS10230/USA300HOU_RS10235 | hypothetical protein/hypothetical protein |
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Only 100 of 288 total aligned reads displayed.
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2:3449039/1‑141 (MQ=255) gccgccTTTCTATGCCACAGCGTTCATATAATTTATTAGATACGATGTTTGTTCTGTTGCTATTTTTTCAGTTGAAGTTTGTTGAATTTGAGTTTCAATTTGTGCATAATATGCTTCAACTTTATTCAACTCTGATTTAat > 1:2569913/1‑141 (MQ=255) cgccTTTCTATGCCACAGCGTTCATATAATTTATTAGATACGATGTTTTTTCTGTTGCTATTTTTTCAGTTGAAGTTTGTTGAATTTGAGTTTCAATTTGTGCATAATATGCTTCAACTTTATTCAACTCTGATTTAatat > 1:3916684/1‑141 (MQ=255) | AAACTAATACACATCCCAATAATAGAACGAGTAAAAAGCCAATTTTTTCAAAAAATATGTAGTAAAAATTGGCAATAATCATTAATGCAGTAAAAATGATCAACATTTGCGTTGATATATATTTGTGTGTCATGTTTCGCCGCCTTTCTATGCCACAGCGTTCATATAATTTATTAGATACGATGTTTTTTCTGTTGCTATTTTTTCAGTTGAAGTTTGTTGAATTTGAGTTTCAATTTGTGCATAATATGCTTCAACTTTATTCAACTCTGATTTAATAT > USA300TCH1516_ALE/2028512‑2028792 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |