New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 399691 = | 297 (1.030) | 16 (0.060) | 9/138 | NT | 6.5% | coding (1712/1713 nt) | efeU | Ferrous iron permease EfeU |
? | USA300TCH1516_ALE | 399718 = | 206 (0.830) | intergenic (+26/+66) | efeU/tatC2 | Ferrous iron permease EfeU/Sec‑independent protein translocase protein TatCy |
Only 100 of 345 total aligned reads displayed.
ATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCGG > USA300TCH1516_ALE/399629‑399808 | ttGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTttgt < 2:3387005/91‑1 (MQ=255) ttGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTttgt < 1:4262704/91‑1 (MQ=255) tGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTttgtt > 1:2548431/1‑91 (MQ=255) gATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTttgttg > 2:2707683/1‑91 (MQ=255) aTAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGc < 1:5446550/91‑1 (MQ=255) tAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCt > 2:4475100/1‑91 (MQ=255) tAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCt > 2:430831/1‑91 (MQ=255) tAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCt < 1:2888429/91‑1 (MQ=255) aGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCta > 2:2546580/1‑91 (MQ=255) aGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCta > 2:3788719/1‑91 (MQ=255) gCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCtat < 1:3735855/91‑1 (MQ=255) aaGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTg > 2:2757184/1‑91 (MQ=255) aGGTGCTTATATTATGGTCGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTgg < 1:5556616/91‑1 (MQ=255) aGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTTTTATATTgg > 2:3868814/1‑91 (MQ=255) aGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTgg < 1:2658119/91‑1 (MQ=255) ggTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGa > 1:2857994/1‑91 (MQ=255) gctgtgattatcgttatactgcaataccgaatatttccaatatagcaacaaaaaaacaggccgagtgcctgttttttTGTTGCTATATTgg < 1:825229‑M2/14‑1 (MQ=255) tGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGaaa > 1:4153895/1‑91 (MQ=255) cTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAata < 1:1096024/91‑1 (MQ=255) ttATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAatat < 2:3259548/91‑1 (MQ=255) ttATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAatat > 2:3166386/1‑91 (MQ=255) attatGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCgg < 1:2121245/91‑1 (MQ=255) attatGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCgg > 1:1312486/1‑91 (MQ=255) tatGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTa < 2:3543214/91‑1 (MQ=255) atGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTAt < 1:711729/91‑1 (MQ=255) tGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTAtt < 2:3302988/91‑1 (MQ=255) ggTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTg < 1:3612958/91‑1 (MQ=255) ggTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTg < 1:3870283/91‑1 (MQ=255) gTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGc < 1:1399721/91‑1 (MQ=255) tAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCa < 2:1969734/91‑1 (MQ=255) aGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAg > 1:4018944/1‑91 (MQ=255) ttGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGta > 2:2658295/1‑91 (MQ=255) gCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGATTTCCTGATTTTTAGTTGCTATATAGGAAATATTCGGTATTGCTGtatt > 2:5655925/1‑90 (MQ=255) aataccgaatatttccaatatagcaacaAAAAAACAGGCACTCG‑GCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGtata < 1:3041033‑M1/63‑1 (MQ=255) cTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATaa > 2:2122446/1‑91 (MQ=255) tATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAAc < 1:2356551/91‑1 (MQ=255) tATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAAc > 2:2218579/1‑91 (MQ=255) aTCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACg > 1:1585480/1‑91 (MQ=255) tCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTTGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGa > 1:4527934/1‑91 (MQ=255) tCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGa > 2:5108478/1‑91 (MQ=255) tCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGa < 2:5349147/91‑1 (MQ=255) cTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGAt < 1:3174556/91‑1 (MQ=255) ttAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATa > 2:1661205/1‑91 (MQ=255) tAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTTTATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATaa < 1:3010691/91‑1 (MQ=255) tAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTTGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATaa > 2:3506811/1‑91 (MQ=255) tAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATaa > 1:987168/1‑91 (MQ=255) tAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATaa > 1:5201291/1‑91 (MQ=255) tAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATaa < 1:4391431/91‑1 (MQ=255) aaTCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAAt < 1:1686482/91‑1 (MQ=255) tCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATca < 1:2049618/91‑1 (MQ=255) cTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTTGAAATATTCGGTATTTCAGTATATCGATAATcac > 2:153628/1‑91 (MQ=255) cTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATcac < 1:1712677/91‑1 (MQ=255) ttaaatttaaaAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAg > 2:536748/1‑91 (MQ=255) ttaaatttaaaAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAg < 2:1793363/91‑1 (MQ=255) taaatttaaaAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGc > 2:1313220/1‑91 (MQ=255) aaatttaaaAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCa > 2:729138/1‑91 (MQ=255) aatttaaaAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCAt < 2:4920127/91‑1 (MQ=255) aatttaaaAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCAt > 1:5031315/1‑91 (MQ=255) aatttaaaAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCAt < 1:3801276/91‑1 (MQ=255) ttaaaAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGa < 2:5479091/91‑1 (MQ=255) ttaaaAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGa < 2:4231214/91‑1 (MQ=255) ttaaaAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGa < 2:40048/91‑1 (MQ=255) ttaaaAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGa < 2:833152/91‑1 (MQ=255) taaaaaataaaaaaCAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGAt < 1:5338191/91‑1 (MQ=255) taaaaaataaaaaaCAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGAt < 1:3466402/91‑1 (MQ=255) aaaaaataaaaaaCAGGC‑CGCGTGCACGTTTTTTCGTTGCTATCTTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACCATAATCACAGCATTGAtt > 2:3350923/1‑91 (MQ=255) aaaataaaaaaCAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCg > 2:1032141/1‑91 (MQ=255) ataaaaaaCAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGtat > 2:4784356/1‑91 (MQ=255) ataaaaaaCAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGtat < 2:1170157/91‑1 (MQ=255) AACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGtt < 1:4931819‑M1/91‑1 (MQ=255) AACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGtt > 1:1989292‑M1/1‑91 (MQ=255) AACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGtt < 1:1133568‑M1/91‑1 (MQ=255) ACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTa < 1:4430663‑M1/91‑1 (MQ=255) ACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTa < 2:1705653‑M1/91‑1 (MQ=255) ggcactcggcctgttttttTGTTGCTATATTGGAAATATTAGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGATAAtg > 1:1815122‑M2/20‑91 (MQ=255) GC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAAtgt > 2:4650973‑M1/1‑91 (MQ=255) gcactcggcctgttttttTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAAtgt > 1:2326048‑M2/19‑91 (MQ=255) cGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATgtgt < 1:1487113/91‑1 (MQ=255) cGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATgtgt < 2:594227/91‑1 (MQ=255) cGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATgtgt < 1:1915090/91‑1 (MQ=255) actcggcctgttttttTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATgtgt > 1:1896571‑M2/17‑91 (MQ=255) gAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGtt > 1:50554/1‑91 (MQ=255) aGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTg < 1:3292735/91‑1 (MQ=255) tGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGc > 1:4352576/1‑91 (MQ=255) gcctgttttttTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCg < 2:1473028‑M2/80‑1 (MQ=255) gcctgttttttTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCg < 2:303356‑M2/80‑1 (MQ=255) cctgttttttTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCgg > 2:2063237‑M2/11‑91 (MQ=255) cctgttttttTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCgg < 1:960416‑M2/81‑1 (MQ=255) ctgttttttTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGt < 2:3676473‑M2/82‑1 (MQ=255) ctgttttttTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGt < 2:508939‑M2/82‑1 (MQ=255) ctgttttttTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGt > 1:1000580‑M2/10‑91 (MQ=255) ctgttttttTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGt < 1:4792878‑M2/82‑1 (MQ=255) ggttttttTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGtt < 2:3100877‑M2/83‑1 (MQ=255) ttttTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGcc < 2:3913640‑M2/87‑1 (MQ=255) ttttTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGcc < 2:2951593‑M2/87‑1 (MQ=255) ttttTGTTGCTATATGGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGcc < 2:5536659‑M2/87‑1 (MQ=255) tttTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCt < 1:2212147‑M2/88‑1 (MQ=255) tTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCg < 2:2925550‑M2/90‑1 (MQ=255) tgttgCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCgg < 1:3330680/91‑1 (MQ=255) tgttgCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCgg < 2:5262700/91‑1 (MQ=255) | ATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGC‑CGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCGG > USA300TCH1516_ALE/399629‑399808 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |