New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | USA300TCH1516_ALE | 854380 = | 268 (0.930) | 16 (0.060) | 15/148 | NT | 5.9% | intergenic (‑275/‑460) | USA300HOU_RS04170/zipA_1 | Epimerase family protein/Cell division protein ZipA |
? | USA300TCH1516_ALE | 854405 = | 263 (0.990) | intergenic (‑300/‑435) | USA300HOU_RS04170/zipA_1 | Epimerase family protein/Cell division protein ZipA |
Only 100 of 355 total aligned reads displayed.
AAAAGTATGTGTAAAACGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTTTTATTTATTTCTTATTCCCATTATACATCAATTTAAAGCATTAATTTTTTAAACAAATTTAAGAATACATAGTAATATAACAATCTA > USA300TCH1516_ALE/854316‑854495 | aGTATGTGTAAAACGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGtttt < 2:4254517/91‑1 (MQ=255) tgtgTAAAACGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTtttatt > 2:2247084/1‑91 (MQ=255) tgtgTAAAACGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTtttatt > 1:2333009/1‑91 (MQ=255) tgtACAACGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAACTTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTtttattta > 1:3439171/1‑91 (MQ=255) tgtAAAACGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTtttatttt > 2:1008509/1‑90 (MQ=255) tgtAAAACGCTGCATGATACAAACGAAGGTAAAAATTTGACTCCCTTTAGTAGTGGACCCGTACG‑TTAATCGTGCGGGTCGTTtttattta > 2:2965179/1‑91 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |