| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 783,859 | T→C | 6.9% | intergenic (‑8/+91) | USA300HOU_RS03830 ← / ← queE_1 | hypothetical protein/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 783,859 | 0 | T | C | 6.9% | 186.1 / 2.2 | 69 | intergenic (‑8/+91) | USA300HOU_RS03830/queE_1 | hypothetical protein/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/32); new base C (3/2); total (35/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TATTTATAAAGGCGTTTATCGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTGCTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAA > USA300TCH1516_ALE/783719‑783997 | tatatataACGGCGTTTATCGTCATAGATCACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATCTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGGCGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACt < 1:464151/141‑1 (MQ=255)tATTTATAAAGGCGTTTATCGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACt < 1:17447/141‑1 (MQ=255) ttttATAAAGGCGTTTATCGTAATAGATAACAACATTGCAATTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTc < 2:509976/140‑1 (MQ=255) tataAAGTCGTTTATCGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTTATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTg < 2:10062/141‑1 (MQ=255) ataAAGGCGTTTATCGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGt > 1:503410/1‑141 (MQ=255) gCGTTTATCGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTta > 1:35579/1‑141 (MQ=255) gCGTTTATCGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTAAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCACTATTAGTCA‑‑ATATATATACAATCATGATGAACCCCTGTTcttaa > 2:341442/1‑137 (MQ=255) cGTTTATCGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTtat < 1:148859/141‑1 (MQ=255) gTTTATCGTAATAGAGAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTtata < 2:390640/141‑1 (MQ=255) tttATCGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCTAGTTATATGTACGTCTATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCTTGATGGACTCCTGTTCGTTATAc > 1:25978/1‑141 (MQ=255) tttATCGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATAc < 2:561563/141‑1 (MQ=255) tttAGCGTAATAGATAACAACAATGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATAc < 2:146072/141‑1 (MQ=255) tctctCGTTAGAGATAACAACATTGCAATTAATGATAAATGTTCCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCATTATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATAc < 2:173932/137‑1 (MQ=255) aTCGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTtc < 1:302705/141‑1 (MQ=255) aTCGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTtc > 1:368661/1‑141 (MQ=255) cGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTtcaa > 2:358844/1‑141 (MQ=255) acaacaTTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACtattat > 2:324249/1‑141 (MQ=255) acaacaTTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACtattat > 1:57049/1‑141 (MQ=255) aacaTTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTatat > 2:537005/1‑141 (MQ=255) caTTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCa > 2:3317/1‑141 (MQ=255) gCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATAGCAATTa > 2:69209/1‑141 (MQ=255) cTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAata > 2:45012/1‑141 (MQ=255) cTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATAAATTCatt > 2:327388/1‑140 (MQ=255) cTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATGA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAata > 1:132869/1‑141 (MQ=255) gATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGt < 1:631696/141‑1 (MQ=255) aTAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATATATTTATATATTGtt > 2:548145/1‑141 (MQ=255) gTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATATACAATTATGGTGGACTCCTGTTCGTTATTTTTCAATACACTATCATATCATTTAATATTTTTTTAttt > 2:416343/1‑140 (MQ=255) gTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCAt > 2:357916/1‑141 (MQ=255) gCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAg > 1:99682/1‑141 (MQ=255) gCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATACATTGTTATTCATTAg < 1:333919/141‑1 (MQ=255) cATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGa < 1:473352/141‑1 (MQ=255) aTGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGat > 2:520662/1‑140 (MQ=255) aTGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGAc < 2:26827/141‑1 (MQ=255) tGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACt > 2:454472/1‑141 (MQ=255) cttatataAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTg < 1:160880/139‑1 (MQ=255) ccTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTg < 1:43984/141‑1 (MQ=255) ccTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTg < 1:3317/141‑1 (MQ=255) atataAATTGTATTTTGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCaa < 2:430317/141‑1 (MQ=255) tataAATTGAATTCAGTTATAAGTACGTCGATAGCAATCTCAATTA‑‑ATATATATACCCGCATCATGGTCTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCaaa < 2:236145/141‑1 (MQ=255) aTTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTa < 2:288675/141‑1 (MQ=255) gAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTaaaa < 2:25978/141‑1 (MQ=255) gAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTaaaa > 2:408863/1‑141 (MQ=255) gAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACCCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTaaaa > 2:453372/1‑141 (MQ=255) gAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACCCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTaaaa > 2:453262/1‑141 (MQ=255) tCCAGTAATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTAAATCAATTAATATATTGTTATTGATTAGATATGACTTGCAAAAAGTAAAATaa > 2:417864/1‑141 (MQ=255) ccAGTTAAAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTAAAATAAg < 1:577106/141‑1 (MQ=255) ataAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTAAAATAAGTTATcc > 2:614555/1‑141 (MQ=255) tACGACGATAGCTATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTtat < 2:187381/141‑1 (MQ=255) tACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTCAAATAAGTTATCCTTtat > 2:522922/1‑141 (MQ=255) tACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTtat > 2:235435/1‑141 (MQ=255) tACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTtat > 1:665150/1‑141 (MQ=255) acgacgATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTtata < 1:506582/141‑1 (MQ=255) acgaTAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATacac < 1:36602/141‑1 (MQ=255) aTAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCtt < 1:287785/141‑1 (MQ=255) tAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTTTACACCttt > 2:424643/1‑141 (MQ=255) tAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCttt > 2:563174/1‑141 (MQ=255) aaTATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTa > 1:327799/1‑141 (MQ=255) a‑‑atATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTGCTCCaaa < 1:76593/141‑1 (MQ=255) tatatataCAACCATGATGGACTCTTGTTCATTATACTTCACTCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTGCTCCAAAGt < 2:612450/141‑1 (MQ=255) ataCAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTGCTCCAAAGTAATGt < 1:635975/141‑1 (MQ=255) taCAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTGCTCCAAAGTAATGTa > 1:647107/1‑141 (MQ=255) taCAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTGCTCCAAAGTAATGTa > 1:278667/1‑141 (MQ=255) tcattCATGATGGACTCCTGTTGGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTGCTCCAAAGTAATGTAt < 1:148903/137‑1 (MQ=255) aaTCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTGCTCCAAAGTAATGTATGa < 1:610644/141‑1 (MQ=255) aTCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTAAAATAAGATATCCTTTATACACCTTTTTTATTGCTCCAAAGAAATGTATGaa > 2:561161/1‑141 (MQ=255) aTCATGATGGACCCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTGCTCCAAAGTAATGTGTGaa < 1:453372/141‑1 (MQ=255) aTCATGATGGACCCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTGCTCCAAAGTAATGTCTGaa < 1:453262/141‑1 (MQ=255) tCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTGCTCCAAAGTAATGTATGAAg < 2:541071/141‑1 (MQ=255) cATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTGCTCCAAAGTAATGTATTAAGt < 1:454472/141‑1 (MQ=255) gACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTAAGTAGATAAGACTTGCAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTCTACACCTTTTTTATTGCTCCGAAGTAATGTATGAGGGTGTGGTa > 2:186070/1‑141 (MQ=255) aCTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGAATAGAAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTGCTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTaa < 2:81688/141‑1 (MQ=255) | TATTTATAAAGGCGTTTATCGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTA‑‑ATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTGCTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAA > USA300TCH1516_ALE/783719‑783997 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |