| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 863,781 | A→G | 5.0% | intergenic (+310/‑30) | eno → / → USA300HOU_RS04210 | Enolase/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 863,781 | 0 | A | G | 5.0% | 238.0 / 2.8 | 83 | intergenic (+310/‑30) | eno/USA300HOU_RS04210 | Enolase/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (44/33); new base G (2/2); total (48/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.15e-01 | |||||||||||
ACTAATAATCATGAGGTAACTAATAACACATATTTAACTTGTATTCTTAAACTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCTTTATTGCAACTGCATCAATCGTATTCTCAATATTATTGATTATTCATTACTTTGTTTCGTTGGATAATGC > USA300TCH1516_ALE/863642‑863920 | aCTAATAATCATGAGGTAACTAATAACACATATTTAACTTGTATTCTTAAACTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGaa < 2:428084/141‑1 (MQ=255) taatCATGAGGTAACTAATAACACATATTTAACTTGTATTCTTAAACTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGGACGTAt > 1:565609/1‑141 (MQ=255) taatCATGAGGTAACTAATAACACATATTTAACTTGTATTCTTAAACTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGGACGTAt > 1:1012487/1‑141 (MQ=255) atCATGAGGTAACTAATAACACATATTTAACTTGTATTCTTAAACTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTAttt > 1:313100/1‑141 (MQ=255) atCATGAGGTAACTAATAACACATATTTAACTTGTATTCTTAAACTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTAtta > 1:376895/1‑140 (MQ=255) tCATGAGGTAACTAATAACACATATTTAACTTGTATTCTTAAACTGGTATAATACATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGTTTTTATAGTAAGTCTTTa > 2:52334/1‑141 (MQ=255) acATGAGGTAACTAATAACACATATTTAACTTGTATTCTTAAACTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTa < 1:393718/140‑1 (MQ=255) tGAGGTAACTAATAAAACATATTTAACTTGTATTCTTAAACTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTCTTGAACGTATTTAAat < 1:589561/141‑1 (MQ=255) aGGTAACTAATAACACATATTTAACTTGTATTCTTAAACTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGTGTATTCACTTTTATTAGAAGGTAAAAATAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAatat > 2:348866/1‑141 (MQ=255) aGGTAACTAATAACACATATTTAACTTGTATTCTTAAACTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAatat > 1:569464/1‑141 (MQ=255) aGGTAACTAATAACACATATTTAACTTGTATTCTTAAACTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAatat > 1:892258/1‑141 (MQ=255) gTAACTAATAACACATATTTAACTTGTATTCTAATCCTGTTTAAATTGATCCATATTTAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAatatat < 1:81196/141‑1 (MQ=255) taataaCACATATTTAACTTGTATTCTTAAACTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATgagag > 1:229066/1‑139 (MQ=255) aataaCACATATTTAACTTGTATTCTTAAACTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGCATATTGTATGACAGGGTATTCGCTTATATTCAAGTGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTACGTAActataaacggaa > 2:915993/1‑134 (MQ=255) ataaCACATATTTAACTTGTATTCTTAAACTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGt > 1:123772/1‑141 (MQ=255) acacATATTTAAGTTGTATTCTTAAACTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTaaa < 1:823936/141‑1 (MQ=255) acaAATTTAACTTGTATTCTTAAACTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACa < 1:169958/141‑1 (MQ=255) aatatTTAACTTGTATTCTTAAACTGGTATAATAAATTGATGTTGCACCAATAATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACaa < 1:1038032/140‑1 (MQ=255) tatTTAACTTGTATTCTTAAACTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACaaag > 2:750079/1‑140 (MQ=255) ttAACTTGTATTCTTAAACTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGc > 2:473171/1‑141 (MQ=255) aCTTGTATTCTTAAACTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGa < 1:842894/141‑1 (MQ=255) aCTTGTATTCTTAAACTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGa > 2:475997/1‑141 (MQ=255) aCTTGTATTCTTAAACTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGa > 2:131847/1‑141 (MQ=255) cTTGTATTCTTAAACTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGAt < 2:522918/141‑1 (MQ=255) cTTGTATTCTTAAACTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAAAAAATGGCTGAt > 2:160135/1‑141 (MQ=255) attGTATTTTTAAAATGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTAATTAAAAGTGAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGAt < 1:144906/140‑1 (MQ=255) tGTATTCTTAAACTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAg > 1:986825/1‑141 (MQ=255) tATTCTTAAACTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGATGAGTAAACAAATGGCTGATAGaa > 1:750914/1‑141 (MQ=255) aTTCTTATACTGGTATAATAGATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGaaa > 2:888296/1‑140 (MQ=255) ttCTTAAACTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACg < 2:873277/141‑1 (MQ=255) ttCTCAAAATGGAGTAGTAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACg > 2:757674/1‑141 (MQ=255) tCTTAAACTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATCGAACGa > 1:711230/1‑141 (MQ=255) aaCTGGTATAATAAATTTATGGTGAAAGGAATACTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATTAAGGTGTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATATAACGAATaaa < 1:469188/141‑1 (MQ=255) aCTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCAGTTTTAGTCAAAGGTAACATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTCAACAAATGCCTGATAGAAAGAATaaaa > 2:627493/1‑140 (MQ=255) aCTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAg > 1:659160/1‑141 (MQ=255) aCTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAg < 2:569464/141‑1 (MQ=255) cTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGa < 2:278138/141‑1 (MQ=255) gTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAATGAATAAAGAAAt > 1:162563/1‑141 (MQ=255) gTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAAt > 1:1063952/1‑141 (MQ=255) tataATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAAtt < 1:536258/141‑1 (MQ=255) taataaATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAAttca > 1:397385/1‑139 (MQ=255) taataaATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTAATAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTaa > 2:60548/1‑141 (MQ=255) tttATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGGACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGa < 2:565609/141‑1 (MQ=255) tttATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGGACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGa < 2:1012487/141‑1 (MQ=255) tttATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACCTCAATAAAGATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGa > 1:771269/1‑141 (MQ=255) ttATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAAGAc > 1:45642/1‑141 (MQ=255) ttATGTTGAAATGAAGATTATATGACAGGGTATTCACTTTTAGTAAAACGTAAAATTAAATAAACGTATTATCGTACGTATTTAAATATACGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGAc > 1:792605/1‑141 (MQ=255) tATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACg > 2:988122/1‑141 (MQ=255) tGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCt > 1:893253/1‑141 (MQ=255) gTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCtt > 1:391035/1‑141 (MQ=255) gTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCtt < 1:63060/141‑1 (MQ=255) ttGAAATGAATATGGTATGATAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGTACGCttt < 1:213362/141‑1 (MQ=255) aaTGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCTTTATTg < 1:806104/141‑1 (MQ=255) attaaTATTGTATGACAGGGTATTCACTTTAATTAAAAAGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCTTTATCGc < 2:686056/138‑1 (MQ=255) atatTCGATGACAGGGTATTCCCTTGTGTAAAAAGGTAAACTTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTACTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCTTTATTGCAACt > 1:780751/1‑141 (MQ=255) ttGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCTTTATTGCAACTGCa < 2:986825/141‑1 (MQ=255) tGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCTTTATTGCAACTGCATCAAt < 1:267630/141‑1 (MQ=255) taCAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATCTGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCTTTATTGCAACTACATCAATc < 2:789499/140‑1 (MQ=255) gACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCTTTATTGCAACTGCATCAATc < 1:356741/141‑1 (MQ=255) aaaGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACTCTTTATTGCAACTGCATCAATCg < 2:227158/139‑1 (MQ=255) aCAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCTTTATTGCAACTGCATCAATCg < 2:1059366/141‑1 (MQ=255) aCAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCTTTATTGCAACTGCATCAATCg < 2:769107/141‑1 (MQ=255) aCAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCTTTATTGCAACTGCATCAATCg < 1:967575/141‑1 (MQ=255) aGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCTTTATTGCAACTGCATCAATCGTa > 1:1006812/1‑141 (MQ=255) gggTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAAGATGCTATGAAATTAAAACAAGACGCATTATTGCAACTGCCTCAATCGtgt > 1:1037791/1‑139 (MQ=255) gTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAATAAATTAAAAAAGGACGCTTTATTGCAACTGCATCAATCGTATtc > 1:873972/1‑141 (MQ=255) tCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCTTTATTGCAACTGCATCAATCGTATTCTCaa < 1:475997/141‑1 (MQ=255) cACTGTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAAAATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCTTTATTGCAACTGCATCAATCGTATTCTCAat > 1:723592/1‑141 (MQ=255) aCTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTGTTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCTTTATTGCAACTGCATCAATCGTATTCTCAata > 2:567467/1‑141 (MQ=255) cTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCTTTATTGCAACTGCATCAATCGTATTCTCAatat < 2:313100/141‑1 (MQ=255) ttttATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCTTTATTGCAACTGCATCAATCGTATTCTCAAtatt > 1:1002565/1‑141 (MQ=255) tattaAAAGGTAAAAATAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTTTTTTCAAATATATTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCTTTATTGCAACTGCATCAATCGTATTCTCAATattatt < 1:1037666/141‑1 (MQ=255) aattaAAAAGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCTTTATTGCAACTGCATCAATCGTATTCTCAATattatt < 1:266779/140‑1 (MQ=255) attaAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCTTTATTGCAACTGCATCAATCGTATTCTCAATATTATTg > 2:534702/1‑141 (MQ=255) attaAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCTTTATTGCAACTGCATCAATCGTATTCTCAATATTATTg > 1:602800/1‑141 (MQ=255) aaaaGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCTTTATTGCAACTGCATCAATCGTATTCTCAATATTATTGatt > 1:441551/1‑141 (MQ=255) aaGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCTTTATTGCAACTGCATCAATCGTATTCTCAATATTATTGattat > 2:408178/1‑141 (MQ=255) taaatgtaaattaaGGGTTTTTAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATTGCTTAGAGAACGAATAAAGAAATTAAAACTTGTCGTGTTACTGCAACTGCATCAATCGTATTCTCAATATTATTGATTATTCAt < 2:272539/135‑1 (MQ=255) ataaataaaGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGCCGCTTAATTTCAACTGCATCAATCGTATTCTCAATATTATTGATTATTCATTACtt < 1:411665/140‑1 (MQ=255) aaataaaGGTTTTATAGAACGAATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGATTAATCGCAACTACATCAATCGTATTCTCAATATTATTGATTATTAATTACtttt > 2:341475/1‑140 (MQ=255) aaGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCTTTATAGCAACTGCATCAATCGTATTCTCAATATTATTGATTATTCATTACTTTGTTTct > 2:783187/1‑140 (MQ=255) aGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCTTTATTGCAACTGCATCAATCGTATTCTCAATATTATTGATTATTCATTACTTTGTTTCGt > 2:74241/1‑141 (MQ=255) taGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCTTTCTTGCAACTGCATCAATCGTATTCTCAATATTATTGATTATTCATTACTTTGTTTCGTTGGATAAt < 2:566182/141‑1 (MQ=255) gAACGTATTTAAAGATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGAACGCTTTATTGCAACTGCATCAATGGTATTCTCAATAGTATTGATTATTCATTACTTTGTTTCGTTGGGTAATgg > 2:141533/1‑140 (MQ=255) | ACTAATAATCATGAGGTAACTAATAACACATATTTAACTTGTATTCTTAAACTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAAAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCTTTATTGCAACTGCATCAATCGTATTCTCAATATTATTGATTATTCATTACTTTGTTTCGTTGGATAATGC > USA300TCH1516_ALE/863642‑863920 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |