| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 1,416,458 | A→T | 100% | I216N (ATT→AAT) | oppD_4 ← | Oligopeptide transport ATP‑binding protein OppD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 1,416,458 | 0 | A | T | 100.0% | 255.6 / NA | 75 | I216N (ATT→AAT) | oppD_4 | Oligopeptide transport ATP‑binding protein OppD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (34/41); total (34/41) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
TTTAACTCAATCATAGTAATCCCTCTTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAAATGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCAAAGCATCCAATGATGCAACTGGTTC > USA300TCH1516_ALE/1416322‑1416594 | tttAACTCAATCATAGTAATCCCTCGTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTa < 1:415596/141‑1 (MQ=255) aCTCAATCATAGTAATCCCTCTTTAAGTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGa > 2:637159/1‑141 (MQ=255) cTCAATCATAGTAATCCCTCTTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGAc < 2:462424/141‑1 (MQ=255) cTCAAGCATAGTAATCCCTCTTTAATTGTGTTTTATATTTAATTAGAATTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGAc < 2:964903/141‑1 (MQ=255) cAATCATAGTAATGCCTCTTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCCATGATTTCACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTgcaat > 2:539220/1‑137 (MQ=255) cAATCATAGTAACACCTCTGTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTGCTTTTAAAACTTAATTTTACTTACaa > 2:301908/1‑141 (MQ=255) tAGTAATCCCTCTTTATTTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGAGTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTc < 2:786668/141‑1 (MQ=255) tAGTAATCCCTCTTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTc < 2:885950/141‑1 (MQ=255) aaGTAATCCCTCTTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTc < 2:18728/140‑1 (MQ=255) gTAATCCCTCTTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAGTGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATCTTTCaa > 1:277292/1‑141 (MQ=255) tctTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGAc < 2:548301/141‑1 (MQ=255) tctTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGAc > 1:520544/1‑141 (MQ=255) tctGTAATTGTGTGCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGAc < 2:826692/141‑1 (MQ=255) ctTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACt > 1:870944/1‑141 (MQ=255) tAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCACTACATCAATTaa > 1:712447/1‑141 (MQ=255) aTTGGGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGt < 2:367597/141‑1 (MQ=255) ttGTGTTCTATATTTAATTCGACGTTCAGTATACGGATCCACATTCTCATACTTGGAATGATTAATGTTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTACAGtt > 2:733029/1‑141 (MQ=255) ttGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGtt < 1:1026224/141‑1 (MQ=255) ttGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGtt < 2:649438/141‑1 (MQ=255) ttGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGtt < 2:84439/141‑1 (MQ=255) ttGTGTTCTATATTTAATTAGAAGTTCAGTATACGGATGAAAATGATCATAATTGAAATAATTAATATTAACTCGTTCCATGATATGAACTTAATTTCAAGAGTAATTGTACTGACCATATTTCACTACATGGCTTCAGtt > 2:114231/1‑141 (MQ=255) tgtTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTAtg < 2:1027530/141‑1 (MQ=255) tCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTAtgtgt < 1:666976/141‑1 (MQ=255) tCTATATTTAATTACACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATAGTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGAAAATCTCTCTTTTGATGACTTAAGTTAtgtgt < 1:514828/141‑1 (MQ=255) cTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTAtgtgtg > 2:452351/1‑141 (MQ=255) atTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGataa > 2:443290/1‑141 (MQ=255) ttAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGataata < 1:468524/141‑1 (MQ=255) tAATTAGACCTTTAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCCATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGAtaataa < 2:28620/141‑1 (MQ=255) aTTAGACGTTCAGTATCCGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATaataaat < 1:871528/141‑1 (MQ=255) aTTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCCTACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTATTGACAATATTTCAATACATGACTTATGTTATGTGTGAtaattaat > 1:39860/1‑141 (MQ=255) aTTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTATTGACAATATTTCCATACATGACTTAAGTTATGTGTGAtaataact > 1:165118/1‑139 (MQ=255) aTTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAACGCTCATACTTCAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGGTATGTGTGATaataaat < 2:449033/141‑1 (MQ=255) ttatggTTCAGTATACGGTTACAAATGCTCATTCTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTATTAAAAAATAATTGTTCTGACATTATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAataaataa < 2:830282/136‑1 (MQ=255) tAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACACGACTTAAGTTATGTGTGATAataaataa < 1:673988/141‑1 (MQ=255) aCGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATACTAAATCAT‑Gt > 2:677011/1‑141 (MQ=255) ttCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTg < 2:847901/141‑1 (MQ=255) ttcgTATACAGATGCACATGCTCATTCTTAAAATGATTACACTTACCTCGTCCCATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTACAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGa < 1:126076/138‑1 (MQ=255) tCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTgc > 2:731555/1‑140 (MQ=255) tCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGa < 2:217434/141‑1 (MQ=255) cAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGAc < 1:732100/141‑1 (MQ=255) cAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGAc < 1:420736/141‑1 (MQ=255) atataCGGATGCAAATGCTTATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCa < 1:1006165/140‑1 (MQ=255) ataCGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCATg < 1:607291/141‑1 (MQ=255) aaTGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTGAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCATGTTCTAATACaa < 1:637159/141‑1 (MQ=255) aaTGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCATGTTCTAATACaa > 1:668381/1‑141 (MQ=255) tGCTTATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTCTGATAATAAATAAT‑GTTTGACGATGTTCTAATACAata < 1:591154/141‑1 (MQ=255) tGCTCATACTTGAAATGATTTATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCATGTTCTAATACAata < 1:928715/141‑1 (MQ=255) ggCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCATGTTCTAATACAata < 1:208620/140‑1 (MQ=255) cgCTTATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCATGTTCTAATACAata < 1:6406/140‑1 (MQ=255) cTCATACTTGAAATGATTAATATTGCCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGAGCATGTTCTAATACAATATg > 1:676630/1‑141 (MQ=255) cTTGAAATTATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTAAACACATATTTCTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGtaa < 1:723081/141‑1 (MQ=255) cTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGtaa < 1:452351/141‑1 (MQ=255) gAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAATTAAT‑GTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGtaataa > 2:923107/1‑141 (MQ=255) gAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGtaataa > 1:265870/1‑141 (MQ=255) aaaTGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCATGTTCTAATACAATATTCTGTGATaaa > 1:44862/1‑141 (MQ=255) aaaTGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATaaa > 1:593494/1‑141 (MQ=255) aTTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACAATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCAt > 2:889947/1‑141 (MQ=255) ttAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATc > 2:1027518/1‑141 (MQ=255) ttAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATc > 2:997559/1‑141 (MQ=255) ttAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATc > 2:74567/1‑141 (MQ=255) aaTATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCATGTTCTAATACAATATTCTGTAATAAATCCATccc > 2:997797/1‑139 (MQ=255) aaTATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCat > 2:971190/1‑140 (MQ=255) acgtCGTGCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGAtt > 2:1053178/4‑141 (MQ=255) ccTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTa < 1:114084/141‑1 (MQ=255) ccTCGTTCAATGATTTGACATTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCCCTTGATTa < 1:677742/141‑1 (MQ=255) tCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTc > 1:229323/1‑141 (MQ=255) tGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCAAAg > 1:633862/1‑141 (MQ=255) gATTTGACCTTCTTTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGCTTACCGTTCAAAGc > 1:158616/1‑141 (MQ=255) cttcttTTAAAACATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCAAAGCATCCAata > 2:174749/1‑140 (MQ=255) aaaCATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATACT‑AATAATAATGTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCAAAGCATCCAATGATGCAACTg < 1:245449/141‑1 (MQ=255) aaaCATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCATGTTCTAATACAATGTGCTCTGAGAAATCCATCACTTGATTACCGTTCAAAGCATCCAATGATGCAACTg < 1:411505/141‑1 (MQ=255) aaaCATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCAAAGCATCCAATGATGCAACTg > 2:652291/1‑141 (MQ=255) aaaCATAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCAAAGCATCCAATGATGCAACTg > 1:342199/1‑141 (MQ=255) cATAATTGTCTTGACAATATTTCAAGCCATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCAAAGCATCTAATGATGCAACTGGtt < 1:631778/141‑1 (MQ=255) aTAATTGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCAAAGCATCCAATGATGCAACTGGTTc < 1:74567/141‑1 (MQ=255) | TTTAACTCAATCATAGTAATCCCTCTTTAATTGTGTTCTATATTTAATTAGACGTTCAGTATACGGATGCAAATGCTCATACTTGAAATGATTAATATTACCTCGTTCAATGATTTGACCTTCTTTTAAAACATAAATGTACTGACAATATTTCAATACATGACTTAAGTTATGTGTGATAATAAATAAT‑GTTTGACCATGTTCTAATACAATATGCTGTAATAAATCCATCACTTGATTACCGTTCAAAGCATCCAATGATGCAACTGGTTC > USA300TCH1516_ALE/1416322‑1416594 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |