| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | USA300TCH1516_ALE | 4,449 | 0 | C | A | 6.2% | 362.4 / 2.4 | 129 | Q171K (CAA→AAA) | recF | DNA replication and repair protein RecF |
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Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
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2:279217/141‑1 (MQ=255) ggCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTGTTCAAGAGCTAGGGTCGTTAGCTAAACCGATTCATGCTGGTATCACAAAt > 1:302544/1‑141 (MQ=255) agCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGCTAGAGTCGTTAGCTAAACCGATGCATGCTGGTATCACAAAt < 2:553469/140‑1 (MQ=255) ccAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAGGAGCTAGAGGCGTTAGCTAAACCGATTCATGCTGGTATCACAAATGa > 1:291344/1‑141 (MQ=255) ccAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGCTAGAGTCGTTAGCTAAACCGCTTCATGCTGGTATCACAAATGa > 1:813167/1‑141 (MQ=255) ccAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGCTAGAGTCGTTAGCTAAACCGATTCATGCTGGTATCACAAATGa > 1:535388/1‑141 (MQ=255) | AAAAGGCTCTCCTCAAATAAGACGACGCTTTATAGATATGGAGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGCTAGAGTCGTTAGCTAAACCGATTCATGCTGGTATCACAAATGA > USA300TCH1516_ALE/4310‑4588 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |