| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1442915 = | NA (NA) | 4 (0.050) | 3/268 | 9.3 | 5.9% | intergenic (+148/+120) | USA300HOU_RS07165/USA300TCH1516_01342 | TelA‑like protein/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1803138 = | 67 (0.850) | coding (730/807 nt) | USA300HOU_RS12765 | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GTATCGCTGCTAAATCAAATAAATAACAACAAGTTTTAGGGCTTGGGACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCGAGTGAAACCCAAAATAGCCTTCATAAATCCAAAAGCAGGCTCTA > USA300TCH1516_ALE/1803003‑1803275 | gTATCGCTGCTAAATCAAATAAATAACAACAAGTTTTAGGGCTTGGGACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTc < 1:304910/141‑1 (MQ=255)gTATCGCTGCTAAATCAAATAAATAACAACAAGTTTTAGGGCGTGGGACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTc < 1:719389/141‑1 (MQ=255) ggtggctAAATCAAATAAATAACAACAAGTTTTAGGGCTTGGGAAATTAATTTCTCAGGCAACGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTg < 2:27700/137‑1 (MQ=17) cGCTGCTAAATCAAATAAATAACAACAAGTTTTAGGGCTTGGGACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTg > 2:549288/1‑141 (MQ=255) cGCTGCTAAATCAAATAAATAACAACAAGTTTTAGGGCCTGGGACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTg < 2:304024/141‑1 (MQ=255) ctgctAAATCAAATAAATAACAACAAGTTTTAGGGCTTGGGACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAGAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAg > 2:884511/1‑141 (MQ=255) ctgctAAATCAAATAAATAACAACAAGTTTTAGGGCTTGGGACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAg > 1:542028/1‑141 (MQ=255) tgctAAATCAAATAAATAACAACAAGTTTTAGGGCTTGGGACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTCTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAgc > 2:716090/1‑141 (MQ=255) gctAAATCAAATAAATAACAACAAGTTTTAGGGCTTGGGACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAgct < 1:20667/141‑1 (MQ=255) aaaTCAAATAAATAACAACAAGTTTTGGGGCTTGGGACATTAAGTGACTAGGCAATGTAAAAAAGGTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATAAGATATTTTGATATGTAGTTGTTAATGTGAAGCTCGTTGAgctgct > 2:252858/1‑141 (MQ=17) aaaTCAAATAAATAACAACAAGTTTTAGGGCTTGGGACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAgctgct < 2:65433/141‑1 (MQ=255) aaTCAAATAAATAACAACAAGTTTTAGGGCTTGGGACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTa < 1:17394/141‑1 (MQ=255) aataaataACAACAAGTTTTAGGGCTTGGGACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTc > 1:469429/1‑141 (MQ=255) ataaataaCAACAAGTTTTAGGGCTTGGGACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTcc > 1:664072/1‑141 (MQ=255) ataaataaCAACAAGTTTTAGGGCTTGGGACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTcc > 2:637469/1‑141 (MQ=255) aataaCAACAAGTTTTAGGGCTTGGGACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCttt > 1:128419/1‑140 (MQ=255) acaacaATTTTTAGGGCGTGGGACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATAtt < 1:497103/141‑1 (MQ=25) acaacaAGTTTTAGGGCTTGGGACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAgctg > 1:389927/1‑125 (MQ=40) acaacaAGTTTTAGGGCTTGGGACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAgctg < 2:389927/125‑1 (MQ=40) acaacaAGTTTTAGGGCTTGGGACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATAtt > 2:739915/1‑141 (MQ=39) gTTTTAGGGCTTGGGACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGcc > 1:132380/1‑141 (MQ=33) tttAGGGCTTGGGACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTCTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGGTATTTTCCTTATCTTAAGTGcctt > 2:779595/1‑139 (MQ=12) tAGGGCTTGGGACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCa > 1:661129/1‑141 (MQ=32) aGGGCTTGGGACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCaa > 2:639691/1‑141 (MQ=32) gggCTTGGGACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAAt > 1:832553/1‑141 (MQ=32) gggCTTGGGACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAAt > 1:76043/1‑141 (MQ=32) ggCTTGGGACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATa > 2:746006/1‑141 (MQ=32) ggACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATCCAAAAc > 2:141749/1‑141 (MQ=17) gACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGTCATCAATACAAAAcc > 2:729788/1‑141 (MQ=17) gACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAAcc > 2:729849/1‑141 (MQ=32) aCATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGATGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCt > 1:364720/1‑141 (MQ=17) cATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCCAGTCAGGCTGCGATTTGCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTa > 1:710931/1‑141 (MQ=11) ggCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAAc > 1:96664/1‑141 (MQ=32) aGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCt < 2:330022/141‑1 (MQ=32) cTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGAc < 1:807663/141‑1 (MQ=32) cTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGAc < 2:526913/141‑1 (MQ=32) cTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATCTAAAACTCATTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGAc < 1:436988/141‑1 (MQ=255) aattaTTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCg < 2:488224/141‑1 (MQ=32) ttGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTAGAACTGACATTCGAGTGaa > 2:136586/1‑141 (MQ=17) aTAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCGAGTGAAAcc > 1:368732/1‑141 (MQ=32) aTAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCGAGTGAAAcc > 1:582135/1‑141 (MQ=32) aaaTCAGCTTTTTTTATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCGAGTGAAACCCaaa < 2:332957/141‑1 (MQ=17) aaaTCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCGAGTGAAACCCaaa < 1:779595/141‑1 (MQ=32) aaTCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCGAGTGAAACCCaaaa < 1:434557/141‑1 (MQ=32) aaTCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCGAGTGAAACCCaaaa < 1:615984/141‑1 (MQ=32) aTCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCGAGTGAAACCCAAAAt > 1:800338/1‑141 (MQ=32) aTCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCGAGTGAAACCCAAAAt < 2:843731/141‑1 (MQ=32) aTCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCGAGTGAAACCCAAAAt < 2:592318/141‑1 (MQ=32) tCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCGAGTGAAACCCAAAATa > 1:518323/1‑141 (MQ=32) tCAGCTTTTTTGATATATATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCGAGTGAAACCCAAAATa > 1:458486/1‑141 (MQ=17) cAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCGAGTGAAACCCAAAATAg > 2:112949/1‑141 (MQ=32) aGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCGAGTGAAACCCAAAATAGc > 2:18937/1‑141 (MQ=32) gCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCGAGTGAAACCCAAAATAGcc < 1:425118/141‑1 (MQ=32) cTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCATGTTGAGCCGCTATTGTACTTATATTAAATCGAAGCAAGACAAAACCTAGCTCTCGGTGAATATTATTTATTCCTCGCACTGACATTCGAGTGACACCCCAACTAGCCt > 2:330995/1‑141 (MQ=2) ttttttGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCGAGTGAAACCCAAAATAGCCtt > 2:466047/1‑141 (MQ=32) ttttttGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCGAGTGAAACCCAAAATAGCCtt < 2:96664/141‑1 (MQ=32) tttgttGATATGTATTTTATAATATACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCATCGAAATGACATTCGAGTGAAACCCAAAATAGCCtt > 2:698840/1‑141 (MQ=255) tttttGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCGAGTGAAACCCAAAATAGCCTTc > 1:519751/1‑141 (MQ=32) tttttGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCGAGTGAAACCCAAAATAGCCTTc > 1:283502/1‑141 (MQ=32) ttttGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCGAGTGAAACCCAAAATAGCCTTCa < 1:739915/141‑1 (MQ=32) ttGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCGAGTGAAACCCAAAATAGCCTTCATa > 2:237199/1‑141 (MQ=32) tGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCGAGTGAAACCCAAAATAGCCTTCATaa > 2:119674/1‑141 (MQ=32) tATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCGAGTGAAACCCAAAATAGCCTTCATAAATCCaaa < 2:665711/141‑1 (MQ=32) ttttATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCGAGTGAAACCTAAAATAGCCGTCATAAATCCAAAAg < 1:462951/141‑1 (MQ=18) ttttATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCGAGTGAAACCCAAAATAGCCTTCATAAATCCAAAAg < 2:834701/141‑1 (MQ=32) aTGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCGAGTGAAACCCAAAATAGCCTTCATAAATCCAAAAGCAGGctc > 2:487810/1‑141 (MQ=35) gTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCGAGTGAAACCCAAAATAGCCTTCATAAATCCAAAAGCAGGCTCTa > 1:549239/1‑141 (MQ=35) | GTATCGCTGCTAAATCAAATAAATAACAACAAGTTTTAGGGCTTGGGACATTAAGTTCTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATCAATACAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCGAGTGAAACCCAAAATAGCCTTCATAAATCCAAAAGCAGGCTCTA > USA300TCH1516_ALE/1803003‑1803275 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |