| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 1,083,479 | T→C | 6.5% | G33G (GGT→GGC) | purD → | Phosphoribosylamine‑‑glycine ligase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 1,083,479 | 0 | T | C | 6.5% | 192.7 / 3.8 | 67 | G33G (GGT→GGC) | purD | Phosphoribosylamine‑‑glycine ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/30); new base C (3/2); total (35/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.27e-01 | |||||||||||
ACTCGACATTTTAAACACTAATTTTAAAGGGGCGTAACATAAATGAATGTATTAGTAATTGGTGCTGGTGGACGAGAACATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACTAGATTTTGCTAAACGGCAAAATGTTGATTGGGTAGTTATAGGTCCAGAACAGCCGCTAATTGATGGAT > USA300TCH1516_ALE/1083339‑1083615 | cgtCGACATTTTAAACACTAGTTGTAAAGGGGCGTAACATAAATGAATGTATTAGTAATTGGTGCTGGTGGACGAGAACATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGt < 2:145177/139‑1 (MQ=255)aCTCGACATTTTAAACACTAATTTTAAAGGGGCGTAACATAAATGAATGTATTAGTAATTGGTGCTGGTGGACGAGAACATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGt > 1:304755/1‑141 (MQ=255)aCTCGACATTTTAAACACTAATTTTAAAGGGGCGTAACATAAATGAATGTATTAGTAATTGGTGCTGGTGGACGAGAACATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGt < 2:531412/141‑1 (MQ=255) cGACATTTTAAACACTAATTTTAATGGGGCGTAACATAAATGAATGTATTAGTAATTGGTGCTGGTGGACGAGAACATGCACTTGCATATAAACTTAATCATTCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAAt < 2:493501/141‑1 (MQ=255) tttAAACACTAATTTTAAAGGGGCGTAACATAAATGAATGTATTAGTAATTGGTGCTGGTGGACGAGAACATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCa < 2:503384/141‑1 (MQ=255) aaTTTTAAAGGGGCGTAACATAAATGAATGTATTAGTAATTGGTGCTGGTGGACGAGAACATGCACTTGCATAGAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGCAATGAGGCAATGACACCta > 2:86444/1‑141 (MQ=255) aaTTTTAAAGGGGCGTAACATAAATGAATGTATTAGTAATTGGTGCTGGTGGACGAGAACATGCACTTACATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGCAATGAGGCAATGACACCta > 2:86296/1‑141 (MQ=255) ttttAAAGGGGCGAAACATAAATGAATGTATTAGTAATTGGTGCTGGTGGACGAGAACATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCtata < 2:331735/141‑1 (MQ=255) aaaGGGGCGTAACATAAATGAATGTATTAGTAATTGGTGCTGGTGGACGAGAACATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTg < 1:85689/141‑1 (MQ=255) gggCGTAACATAAATGAATGTATTAGTAATTGGTGCTGGTGGACGAGAACATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGt > 2:641494/1‑141 (MQ=255) gggCGTAACAGAAATGAATGTATTAGTAATTGGTGCTGGTGGACGAGAACATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGt > 2:533938/1‑141 (MQ=255) aaCATAAATGAATGTATTAGTAATTGGTGCTGGTGGACGAGAACATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAGACATGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTacacac > 1:375079/1‑141 (MQ=255) aaCATAAATGAATGTATTAGTAATTGGTGCTGGTGGACGAGAACATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTacacac > 2:83564/1‑141 (MQ=255) aaCATAAATGAATGTATTAGTAATTGGTGCTGGTGGACGAGAACATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTacacac < 1:462760/141‑1 (MQ=255) aCATAAATGAATGTATTAGTAATTGGTGCTGGTGGACGAGAACATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACt > 2:561983/1‑141 (MQ=255) aCAGAAGTGAATGTATCCGTAATTGGTGCTGGTGGACGAGAACACGCCCTTGCATATCAACTTAATCAATCGAATCCAGTTAAACACGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACt < 2:33342/141‑1 (MQ=255) cATAAATGAATCTACTAGTATTTGGTGCTGTTGGACGAGAACATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTg < 2:511088/141‑1 (MQ=255) atgaatgTATTAGTAATTGGTGCTGGTGGACGAGAACATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTCCACCCTGAGAtt > 1:33303/1‑141 (MQ=255) atgaatgTATTAGTAATTGGTGCTGGTGGACGAGAACATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACAAACTGAAAtt > 1:96060/1‑141 (MQ=255) atgGATTAGTAATTGGTGCTGGTGGACGAGAATATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAg < 1:630593/141‑1 (MQ=255) tATTAGTAATTGGTGCGTGTGGACGAGAACGTGCCCTTGCAGATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAAt < 2:585401/141‑1 (MQ=255) aGTAATTGGTGCTGGTGGACGAGAACATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGa < 1:175412/141‑1 (MQ=255) aGTAATTGGTGCTGGTGGACGAGAACATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGa < 1:175415/141‑1 (MQ=255) aGTAATTGGTGCTGGTGGACGAGAACATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAATTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGa > 2:675040/1‑141 (MQ=255) ttGGTGCTGGTGGACGATAACATGCACCTGCCTATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGatcatc < 1:289866/141‑1 (MQ=255) ttGGTGCTGGTGGACGAGAACATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTGATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTGCACAATCTGataatc > 1:652263/1‑141 (MQ=255) ttGGTGCTGGTGGACGAGAACATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGatcatc > 1:309446/1‑141 (MQ=255) ggTGCTGGTGGACGAGGACGTGCACTTGCATATAAACTTAAGCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCaa > 2:382929/1‑141 (MQ=255) ggTGCTGGTGGACGAGAACATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGCATCTCGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCaa > 1:23380/1‑141 (MQ=255) ggTGCTGGTGGACGAGAACATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGGCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACAAACCGAAATTTCCGAATCGGATCATCaa > 1:519561/1‑141 (MQ=255) gCTGGTGGACGAGAACATGCACTTGAATACAAAATTACACAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGATTGTCATACCAGGCAATGAGGCAAAAACACATATAGCTGAAGTACACACGGGAATTTCAGAACATGATCATCAAGCg > 2:245797/1‑141 (MQ=255) ggtggACGAGAACATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATa > 2:773132/1‑141 (MQ=255) tggACGAGAACATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCAGTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACt < 2:110546/141‑1 (MQ=255) gggACGAGAACATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACt < 1:611091/140‑1 (MQ=255) ggACGAGAACATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGCATCTGATCAACAAGCGATACTa > 2:307300/1‑141 (MQ=255) ggACGAGAACATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACTa > 1:647447/1‑141 (MQ=255) gagaACATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAATTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTCATCATCCAGCGATACTAGAtt < 2:539961/141‑1 (MQ=255) gCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACTAGATTTTGCTAAACGGCaa < 2:712638/141‑1 (MQ=255) ttaggaaCTTGATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACTAGATTTAGCTAAACGGCaaaa < 2:538288/136‑1 (MQ=255) aCTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACTAGATTTTGCTAAACGGCAAAATGTTGa < 1:761652/141‑1 (MQ=255) cTTAATCAATGGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACTAGATTTTGCTAAACGGCAAAATGTTgct > 1:571528/1‑139 (MQ=255) cTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGCAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACTAGATTTTGCTAAACGGCAAAATGTTGAt < 1:86296/141‑1 (MQ=255) cTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGCAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACTAGATTTTGCTAAACGGCAAAATGTTGAt < 1:86444/141‑1 (MQ=255) ttatccaagcGAATCTAGGTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGTATCTGATCATCAAGCGATACTAGATTTTGCTAAACGGCAAAATGTTGAtt < 2:306939/136‑1 (MQ=255) ttAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACTAGATTTTGCTAAACGGCAAAATGTTGAtt < 2:106856/141‑1 (MQ=255) ttAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACTAGATTTTGCTAAACGGCAAAATGTTGAtt < 2:652551/141‑1 (MQ=255) ttAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACTAGATTTTGCTAAACGGCAAAATGTTGAtt < 2:48290/141‑1 (MQ=255) aatcaatcGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGCTCATCAAGCGATACTAGATTTTGCTAAACGGCAAAATGTTGATTgg > 1:735255/1‑141 (MQ=255) aatcaatcGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACTAGATTTTGCTAAACGGCAAAATGTTGATTgg > 1:338651/1‑141 (MQ=255) aatcaatcGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACTAGATTTTGCTAAACGGCAAAATGTTGATTgg > 2:665110/1‑141 (MQ=255) tcaatcGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGCACCCCATGTCAGCAAGCCAGCTTAGCGTCAAACGTCTCCAGGTTTTGCTAAACGGCAACATGTTGATTGGGt < 2:555968/141‑1 (MQ=255) caatcGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACTAGATTTTGCTAAACGGCAAAATGTTGATTGGGTa < 2:727178/141‑1 (MQ=255) atcGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACTAGATTTTGCTAAACGGCAAAATGTTGATTgggaggt > 1:211340/1‑137 (MQ=255) atcGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCAAATCGTAAAGCAAAACTGGATATTGCTAAACGACAAATTGTTGAATGGGGAGt > 1:105105/1‑141 (MQ=255) aTCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATATCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACTAGATTTTGCTAAACGGCAAAATGTTGATTGGGTAGTTATAg > 1:742350/1‑141 (MQ=255) aTCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACTAGATTTTGCTAAACGGCAAAATGTTGATTGGGTAGTTATAg > 2:613297/1‑141 (MQ=255) aTCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACTAGATTTTGCTAAACGGCAAAAAGTTGATTGGTTAGTTagag > 2:139748/1‑141 (MQ=255) aTCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACTAGATTTTGCTAAACGACAAAATGTTGATTGGGTAGTTATAg > 2:338286/1‑141 (MQ=255) gTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACTAGATTTTGCTAAACGGCAAAATGTTGATTGGGTAGTTATAGGTCCa > 2:221119/1‑141 (MQ=255) ttgaaCAAGTGGTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACTAGATTTTGCTAAACGGCAAAATGTTGATTGGGTAGTTATAGGTCCAg < 2:701890/138‑1 (MQ=255) ttAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACTAGATTTTGCTAAACGGCAAAATGTTGATTGGGTAGTTATAGGTCCAg > 1:620538/1‑141 (MQ=255) gtgaaCAAGTGGTTGTCATTCCAGCTAATGAGTAAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGGTACTAGATTTTGCTAAACGGCAAAATGTTGATTGGGTAGTTATAGGTCCAg < 2:188114/138‑1 (MQ=255) tAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGTTAATGAGGCAATGACACCTATCGCGGAAGTACACCCTGAAATTTCAGAATCTGAGCTTCAAGCGTGACTAGCTTTTGCTAAACGGCAAAATGTTGATTGGGTAGTTATAGGTCCAGa < 2:349790/141‑1 (MQ=255) ttGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACATATAGCTGAAGTACCCACTGAAATTTCGGAATCTAATCATCACACGATACTAGATTGCGCTAAACGGCAGAATTGTGAGTGTTTAGTTATAGGTCCAGAACAGCCGCTaa > 2:577403/1‑141 (MQ=255) tgttCATTCCAGGTAAGGCGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACTAGATTTTGCTAAACGGCAAAATGTTGATTGGGTAGTTATATGTCCAGAACAGCCGCTaa < 2:23380/138‑1 (MQ=255) cATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACAGACGGAGATGTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACTAGATTTTGCTAAACGGCAAAATGTTGATTGGGTAGTTATAGGTCCAGAACAGCCGCTAATTGa > 1:152657/1‑141 (MQ=255) cATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGCACAAGGTGGAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACTAGATTTTGCTAGACGGCAAAATGTTGATTGGGTAGTTATAGGTCCAGAACAGCCGCCAATTGa > 1:541701/1‑141 (MQ=255) aTTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACTAGATTTTGCTAAACGGCAAAATGTTGATTGGGTAGTTATAGGCCCAGAACAGCCGCTAATTGAt > 2:448686/1‑141 (MQ=255) cAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACTAGATTTTGCTAAACGGCAAAATGTTGATTGGGTAGTTATAGGTCCAGAACAGCCGCTAATTGATGGAt < 1:354194/141‑1 (MQ=255) cAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACTAGATTTTGCTAAACGGCAAAATGTTGATTGGGTAGTTATAGGTCCAGAACAGCCGCTAATTGATGGAt < 1:294132/141‑1 (MQ=255) | ACTCGACATTTTAAACACTAATTTTAAAGGGGCGTAACATAAATGAATGTATTAGTAATTGGTGCTGGTGGACGAGAACATGCACTTGCATATAAACTTAATCAATCGAATCTAGTTAAACAAGTGTTTGTCATTCCAGGTAATGAGGCAATGACACCTATAGCTGAAGTACACACTGAAATTTCAGAATCTGATCATCAAGCGATACTAGATTTTGCTAAACGGCAAAATGTTGATTGGGTAGTTATAGGTCCAGAACAGCCGCTAATTGATGGAT > USA300TCH1516_ALE/1083339‑1083615 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |