| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 2,704,755 | C→T | 12.0% | G360S (GGT→AGT) | crtQ ← | 4,4'‑diaponeurosporenoate glycosyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 2,704,755 | 0 | C | T | 12.0% | 192.2 / 14.7 | 82 | G360S (GGT→AGT) | crtQ | 4,4'‑diaponeurosporenoate glycosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (38/32); new base T (4/6); total (44/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.05e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.68e-01 | |||||||||||
TCTTCATGATTTTATGACAATATTTAAAATTCATATCCATCATTGTCATACTAGTCCTCCTATATTGAAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCCGACCCTTCGATGCAGATAAATAAATTGTGTAGTATAGCTCA > USA300TCH1516_ALE/2704620‑2704892 | tcttcATGATTTTATGACAATATTTAAAATTCATATCCATCATTGTCATACTAGTCCTCCTATATTGAAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAAc < 2:160752/141‑1 (MQ=255) cttcATGATTTTATGACAATATTTAAAATTCATATCCATCATTGTCATACTAGTCCTCCTATATTGAAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACg > 1:44482/1‑141 (MQ=255) ttcATGATTTTATGACAATATTTAAAATTCATATCCATCATTGTCATACTAGTCCTCCTATATTGAAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGa > 1:544470/1‑141 (MQ=255) gATTTTATGACAATATTTAAAATTCATATCCATCATTGTCATACTAGTCCTCCTATATTGAAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACTATAACGATGCgt > 1:583860/1‑141 (MQ=255) tATGACAATATTTAAAATTCATATCCATCATTGTCATACTAGTCCTCCTATATTGAAATGCCTTTACCCTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGTATATTTACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCgtttgtt > 1:61936/1‑141 (MQ=255) tATGACAATATTTAAAATTCATATCCATCATTGTCATACTAGTCCTCCTATATTGAAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCgtttgtt < 2:365573/141‑1 (MQ=255) ttGACAATATTTAAAATTCATATCCTTTATTGTCATCCTAGTCCTCCAATAACGAACAGCCATATCCTTGATTTATTGTTCTGTAAATATATAAGATGGACTATCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCgtttgttt < 2:458678/140‑1 (MQ=255) gACAATATTTAAAATTCATATCCATCATTGTCATACTAGTCCTCCTATATTGAAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTcc > 1:427698/1‑141 (MQ=255) ataaTATTAAAAATCCACATCCATCATTGTCATACTAGTCCGCCTATATTTAAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGATCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCa < 1:540788/139‑1 (MQ=255) aCAATATTTAAAATTCATATCCATCATTGTCATACTAGTCCTCCTATATTGAAGTGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGCTATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTcaa > 2:451317/1‑139 (MQ=255) aCAATATTTAAAATTCATATCCATCATTGTCATACTAGTCCTCCTATATTGAAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCa > 2:783624/1‑141 (MQ=255) aCAATATTTAAAATTCATATCCATCATTGCCATACAATTTCTCCTATATTGAAATGACATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAAACCTGCCTTGGTTTCCa > 1:30469/1‑141 (MQ=255) aaaTATTTAAAATTCATATCCATCATTGTCATACTAGTCCTCCTATATTGAAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACTATAACGATGCGTTTGTTTCCaa < 2:474669/140‑1 (MQ=255) aaTATTTAAAATTCATATCCATCATTGTCATACTAGTCCTCCTATATTGAAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACATTTCCATTCAACTACACCATGACGATGCGTTTGTTTACAAg > 1:525448/1‑141 (MQ=255) tttAAAATTCATATCCATCATTGTCATACTAGGCCTCCTATATTGAAATGCCATTCCCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTg < 2:730435/141‑1 (MQ=255) tAAAATTCATATCCATCATTGTCATACTAGTCCTCCTATATTGAAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAAATTggt > 2:573414/1‑140 (MQ=255) aaTTCATATCCATCATTGTCATACTAGTCCTCCTATATTGAAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGa > 2:392762/1‑141 (MQ=255) aaTGCATATCCATCTTTGTCACACTAGTCCTCCTATATGGAAATGTCATTACCTTGATTTAGTGATCTTGTGATATAGAATATTGGCTACCTTTCCATTCAACTACACTATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGa < 1:777257/141‑1 (MQ=255) atatCCATCATTGTCATACTAGTCCTCCTATATTGAAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAAtt < 2:602355/141‑1 (MQ=255) aaatCCATCATTGTCATACTAGTCCTCCTATATTGAAATGCCATTACCTGGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAAtt < 2:470681/139‑1 (MQ=255) tCCATCATTGTCATACTAGTCCTCCTATATTGAAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTGCCAAGATTGGTTGaaaaggttg > 1:178372/1‑136 (MQ=255) tCATACTAGTCCTCCTATATTGAAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACa > 2:474037/1‑141 (MQ=255) aTACTTGTCCGCCTATATTGGAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACata < 1:197494/141‑1 (MQ=255) aCTAGTCCTCCTATATTGAAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTGTAGTAAAAAACataaa < 1:393195/141‑1 (MQ=255) tAGTCCTCCTATATGGAAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACTATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACataaata < 1:131992/141‑1 (MQ=255) gTCCTCCTATATTGAAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTCGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGAGGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAAc > 1:446121/1‑141 (MQ=255) gTCCTCCTATATTGAAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAAc < 1:526649/141‑1 (MQ=255) gTCCTCCTATATTGAAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAAc < 1:354519/141‑1 (MQ=255) tcctccTATATTGAAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACa < 2:454934/141‑1 (MQ=255) tcctATATTGAAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATg > 2:733598/1‑141 (MQ=255) cctATATTGAAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATGGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACCCAATAAAGATGCGTTGGTTTCCAAGATTGGATGAAGATTTTAGAAAAAAACATAAATAACAATgg > 2:417997/1‑141 (MQ=255) cctATATTGAAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGACAAAGAATATTGATCAAATTTTCATTTAAATTTATATTAAAGATGAGATTATTTCAAAATTATTAATATAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATgg > 2:458135/1‑141 (MQ=255) tataTTGAAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAACTTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGAt > 2:91526/1‑141 (MQ=255) tataTTGAAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGAt < 1:290733/141‑1 (MQ=255) tataTTGAAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGAt < 1:199584/141‑1 (MQ=255) tataTTGAAATGCCATTACCTTGAGTTATTGTTCTTTAGACATAGAAGATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGAt < 1:608998/141‑1 (MQ=255) tatTGAAATGCCTTTACCTTGATTTCTTGTTCTTTACATAGAGAAGATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACTATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGa < 1:409770/141‑1 (MQ=255) tatTGAAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCAAAGATTGGATAAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAAAAATGGagta > 2:207777/1‑138 (MQ=255) aaTGCCATTACCTTGTCTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATAcc > 1:394767/1‑141 (MQ=255) cgaTTACCTTGGTTTATTGTTCTTTGGATATAGAATATTGAGGACCTTTCTATTCAACTTGCGCGTAACGATGCGTTTGTTTCCAAGTTTGGATGATAATTTTGGTAAAAAACTTTAATAACAGTGGTTGACATACCAttt > 2:639538/3‑140 (MQ=255) ccATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATta > 1:591042/1‑141 (MQ=255) cATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATtaa > 2:245796/1‑141 (MQ=255) aTTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATaaaa > 1:292664/1‑140 (MQ=255) aCCTTGATTTATTGTTCCTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATaaa < 1:386492/141‑1 (MQ=255) ccTTGAATTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCATTCCCTTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGAAATACCATTAATAAAt > 2:584728/1‑141 (MQ=255) tATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAAt < 2:713930/141‑1 (MQ=255) tctgctatAGATATATAAGATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTgg < 2:195400/134‑1 (MQ=255) tGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAAAAAATTgg > 2:129540/1‑141 (MQ=255) tGTTCGTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTAGGCCTAAACGATTCGTCTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTgg < 2:44482/141‑1 (MQ=255) ttCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCCACTACACTATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATAGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGcc > 1:708610/1‑141 (MQ=255) ttCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGAAATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGcc > 2:647841/1‑141 (MQ=255) cTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAACACCCGATGTAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCCGa > 2:706662/1‑141 (MQ=255) tttAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACTATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCCGAc > 1:700360/1‑141 (MQ=255) tttAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCCGAc < 2:385584/141‑1 (MQ=255) ttAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCCGAcc < 1:370536/141‑1 (MQ=255) tAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACGCCATAACGATGCGTTTGTTTACAAGATTGGATGAAAATTTTAGAAAAAAACATAAATAACAATGAATGACGTACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCCGAcct > 2:358025/1‑140 (MQ=255) aGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCCGACCCt < 1:575181/141‑1 (MQ=255) gATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCGGACCCtt > 2:256468/1‑141 (MQ=255) atatAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCCGACCCTTc > 2:352116/1‑141 (MQ=255) ataaTGACGACCTATCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCCGACCCTTCGATGCAg < 1:307294/141‑1 (MQ=255) tatTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCCGACCCTTCGATGCAGa > 1:98301/1‑141 (MQ=255) tGACGACCTTTCCATTCAACTACACTATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCCGACCCTTCGATGCAGataa < 1:217578/141‑1 (MQ=255) tGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCCGACCCTTCGATGCAGataa > 1:548626/1‑141 (MQ=255) tGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCCGACCCTTCGATGCAGataa > 1:220738/1‑141 (MQ=255) gacgacCTTTCCATTCAACTACACTATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCCGACCCTTCGATGCAGataaa < 2:583860/141‑1 (MQ=255) gacgacCTTTCCATTCAACTACACTATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCCGACCCTTCAATGCAGataaa > 1:666126/1‑141 (MQ=255) gacgacCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCCGACCCTTCGATGCAGataaa > 1:173984/1‑141 (MQ=255) gacgacCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCCGACCCTTCGATGCAGataaa < 1:745965/141‑1 (MQ=255) acgacCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCCGACCCTTCGATGCAGataaat < 1:184264/141‑1 (MQ=255) acgacCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCCAACCCTTCGATGCAGataaat > 2:325948/1‑141 (MQ=255) cgacCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCCGACACTTCGATGCAGataaata > 1:659568/1‑141 (MQ=255) cgacCTTTCCATTCAACTAAACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCCGACCCTTCGATGCAGataaata < 2:244146/141‑1 (MQ=255) cgacCTTTCCAATCAACTACACCATAACGATGTGTTTGTTTCCATGATCTTATTAAAATAATAGAAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCCGACCCTTCGATGCAGataaata < 2:464830/141‑1 (MQ=255) tCCATTCAACTACACCATAACGGAGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTGGTAAAAAACATAAATAACAATGGGTGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCCGACCCTTCGATGCAGATAAATAAATtgtg > 2:317125/1‑141 (MQ=255) cATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCCGACCCTTCGATGCAGATAAATAAATTGTgta < 2:61936/141‑1 (MQ=255) cATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAAGGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCCGACCCTTCGATGCAGATAAATAAATTGTgta < 2:178372/141‑1 (MQ=255) ttCAACTACACCATAACGATGCGGTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATAACATTAATAAAGAAGAAAATTGGCCGACCCTTCGATGCAGATAACAAAATAGTgtatt > 2:180586/1‑139 (MQ=255) cAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCCGACCCTTCGATGCAGATAAATAAATTGTGTAGtat < 2:544470/141‑1 (MQ=255) cAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCCGACCCTTCGATGCAGATAAATAAATTGTGTAGtat > 2:339297/1‑141 (MQ=255) cTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCCGACCCTTCGATGCAGATAAATGAATTGTGTAGTATAGc < 1:392762/141‑1 (MQ=255) atACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCCGACCCTTCGATGCAGATAAATAAATTGTGTAGTATAGc < 2:525448/140‑1 (MQ=255) cacCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGTGGAAAAATTTAGGAAAAAACATAAATAACAATGGATAACATACCAGTAATCAATTAGAAAAATGGCCGACCCTTCGATCCAGATAAATACATGGTGAAGtatatccca > 2:278660/1‑136 (MQ=255) | TCTTCATGATTTTATGACAATATTTAAAATTCATATCCATCATTGTCATACTAGTCCTCCTATATTGAAATGCCATTACCTTGATTTATTGTTCTTTAGATATAGAATATTGACGACCTTTCCATTCAACTACACCATAACGATGCGTTTGTTTCCAAGATTGGATGAAAATTTTAGTAAAAAACATAAATAACAATGGATGACATACCATTAATAAATTAGAAAATTGGCCGACCCTTCGATGCAGATAAATAAATTGTGTAGTATAGCTCA > USA300TCH1516_ALE/2704620‑2704892 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |