| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | USA300TCH1516_ALE | 2,359,473 | 0 | G | T | 7.1% | 353.5 / 3.5 | 131 | Q100K (CAA→AAA) | rpsM | 30S ribosomal protein S13 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (74/45); new base T (8/2); total (83/48) | |||||||||||
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Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
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(MQ=255) ttCGTTTTTTGACCACGAACTGGTAAACCACGACGGTGACGGATACCACGGTATGATGAAATTTCCATTAAACGTTTGATATTTAAGTTAGTTTCACGACGTAAGTCACCTTCGACTTTATAACCGTCTACAACTTCACgg > 1:352197/1‑141 (MQ=255) ttCGTTTTTTGACCACGAACTGGTAAACAACGACGGTGACGGATACCACGGTAGGATGAAATTTCCATTAAACGTTTGATATTTAAGTTAGTTTCACGACGTAAGTCACCTTCGACTTTATAACCGTCTACAACTTCACgg > 2:671789/1‑141 (MQ=255) ttttttGACCACGAACTGGTAAACCACGACGGTGACGGATACCACGGTATGATGAAATTTCCATTAAACGTTTGATATTTAAGTTAGTTTCACGACGTAAGTCACCTTCGACTTTATAACCGTCTACAACTTCACGGATGc < 1:911534/141‑1 (MQ=255) tttttGACCACGAACTGGTAAACCACGACGGTGACGGATACCACGGTATGATGAAATTTCCATTAAACGTTTGATATTTAAGTTAGTTTCACGACGTAAGTCACCTTCGACTTTATAACCGTCTTCAACTTCACGTATGCg > 1:75610/1‑141 (MQ=255) ttGACCACGAACTGGTAAACCACGACGGTGACGGATACCACGGTATGATGAAATTTCCATTAAACGTTTGATATTTAAGTTAGTTTCACGACGTAAGTCACCTTCGACTTTATAACCGTCTACAACTTCACGGATGCGAcc < 1:1002687/141‑1 (MQ=255) | ATTCTTTTTCACTCTACGTTTACGAGATACTTGTTTACGTGCCATTTAAAATTTGCCTCCTTTACCTATTATTTTTTCTTGTTAGCTACCGTTTTAACTGGTCCTTTACGAGTACGCGCGTTGTTTTTCGTTTTTTGACCACGAACTGGTAAACCACGACGGTGACGGATACCACGGTATGATGAAATTTCCATTAAACGTTTGATATTTAAGTTAGTTTCACGACGTAAGTCACCTTCGACTTTATAACCGTCTACAACTTCACGGATGCGACCTA > USA300TCH1516_ALE/2359337‑2359613 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |